赤水乌骨鸡MC1R、TYR、MITF基因多态性分析及其组织表达效应研究
发布时间：2021-08-04 04:06
赤水乌骨鸡是贵州省优良地方鸡种,具有黑羽、乌骨两个主要特征,但生产中发现其乌度在个体间的变异度较大,为了探讨造成赤水乌骨鸡乌度变异的分子机理,本研究以赤水乌骨鸡为研究对象,泰和乌鸡为对照,采用PCR直接测序技术筛选赤水乌骨鸡MC1R、TYR和MITF基因启动子区和外显子区SNPs位点,并与不同组织中黑色素相关物质含量进行关联性分析。同时利用荧光定量PCR技术分析了MC1R、TYR、MITF基因在不同品种不同组织中表达情况。研究主要结果如下:1.MC1R、TYR和MITF基因SNPs筛选对MC1R、TYR和MITF基因启动子区和外显子区共设计了24对引物,经PCR扩增测序共发现赤水乌骨鸡MC1R基因SNPs 16个（其中启动子区12个,外显子区4个）;泰和乌鸡23个（其中启动子区15个,外显子区8个）;赤水乌骨鸡TYR基因SNPs 7个（其中启动子区2个,内含子5个）;泰和乌鸡6个（其中启动子区2个,外显子区2个,内含子2个）;赤水乌骨鸡MITF基因SNPs位点18个（其中启动子区2个,外显子区1个,内含子15个）;泰和乌鸡21个（其中启动子区2个,外显子区1个,内含子18个）。2.赤水...
【文章来源】：贵州大学贵州省 211工程院校
【文章页数】：153 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
MC1R基因启动子区预测
图 2-3 MC1R 基因核心启动子区预测（Promoter 2.0）-3 MC1R gene core promoter region prediction（Promoter 2.0）物：MC1R 基因（GenBank：NM_001031462.1）通测软件进行预测，Promoter SCAN 和 Neural Netw测的区域相同，其引物为 MC1Ra，Promoter 2.0 软C1Rb；TYR 基因（GenBank：XM_015279812.2）和_015292966.2）基因核心启动子区参照刘小辉（201物详细信息见表 2-4：表 2-3 启动子在线预测软件Tab. 2-3 Promoter online prediction software件 网站ter 2.0 http://www.cbs.dtu.dk/index.er SCAN http://www-bimas.cit.nih.gov/indromoter Prediction http://www.fruitfly.org/seq_tools/pr表 2-4 MC1R、TYR 及 MITF 基因核心启动子引物信息-4 MC1R, TYR and MITF gene core promoter primer informatio
贵州大学 2019 届硕士研究生学位论文T-PCR 反应体系见表 2-10，RT-PCR 反应程序见图 2-4。表 2-10 MC1R、TYR、MITF 基因 RT-PCR 反应体系Tab. 2-10 MC1R, TYR, MITF gene RT-PCR reaction system试剂 体积/μLSYBR SELECT MASTER MIX 5ddH2O /μL 2.5c DNA 模板/μL 1上、下游引物/μL 0.75Total 10
本文编号：3320969
【文章来源】：贵州大学贵州省 211工程院校
【文章页数】：153 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
MC1R基因启动子区预测
图 2-3 MC1R 基因核心启动子区预测（Promoter 2.0）-3 MC1R gene core promoter region prediction（Promoter 2.0）物：MC1R 基因（GenBank：NM_001031462.1）通测软件进行预测，Promoter SCAN 和 Neural Netw测的区域相同，其引物为 MC1Ra，Promoter 2.0 软C1Rb；TYR 基因（GenBank：XM_015279812.2）和_015292966.2）基因核心启动子区参照刘小辉（201物详细信息见表 2-4：表 2-3 启动子在线预测软件Tab. 2-3 Promoter online prediction software件 网站ter 2.0 http://www.cbs.dtu.dk/index.er SCAN http://www-bimas.cit.nih.gov/indromoter Prediction http://www.fruitfly.org/seq_tools/pr表 2-4 MC1R、TYR 及 MITF 基因核心启动子引物信息-4 MC1R, TYR and MITF gene core promoter primer informatio
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