猪RXRB和MYOM1基因组织表达量及其遗传进化分析
发布时间:2021-08-10 01:20
通过对长白山野猪和东北民猪数字基因表达谱文库的筛选,本课题组发现有20多个基因与肌纤维的发育以及肉质有关。本实验此次选取候选基因RXRB和MYOM-1,以东北民猪(♀♂)、长白山野猪(♀♂)为材料进行组织差异表达分析、单核苷酸多态性分析和遗传结构分析。为进一步了解这些基因在肌纤维发育过程中和对猪肉质的作用及调控机制,进而开展改善猪肌肉性状和屠宰性状的遗传学研究提供科学依据。研究结果显示,两个基因的表达量在同品种不同性别组织间、同性别不同品种组织间,同品种同性别不同组织间均存在广泛的差异性。其中RXRB基因在四种猪的肌肉组织表达量普遍高于非肌肉组织,表明RXRB基因可能与猪的肌纤维发育及特性存在密切联系。RXRB基因在四个品种猪中均有多个组织不表达,由此可见RXRB基因在各组织间表达存在时空特异性,杨国伟等试验表明该基因在组织中的表达存在明显的时间和空间变化,与本实验结果一致。MYOM-1基因在四种猪的各组织间呈现无规律变化,通过对MYOM-1基因单核苷酸多态性与肌纤维性状和屠宰性状间的关联分析,发现不同基因型的猪肌纤维性状和屠宰性状没有显著的差异性(P>0.05),MYOM-1基...
【文章来源】:吉林农业大学吉林省
【文章页数】:55 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
Abstract
目录
第一章 前言
1.1 猪肌纤维的研究进展
1.2 本研究的意义
第二章 长白山野猪和东北民猪 RXRB 基因 mRNA 组织表达特性分析
2.1 RXRB 基因的作用机制及研究进展
2.2 研究材料和方法
2.2.1 试验动物
2.2.2 试验试剂和仪器
2.2.3 试验方法
2.2.3.1 RNA 的提取与浓度测定
2.2.3.2 cDNA 的获得与检测
2.2.3.3 引物设计
2.2.3.4 PCR 条件的建立
2.2.3.5 PCR 产物的凝胶电泳分析
2.2.3.6 数据分析
2.3 结果与分析
2.3.1 总 RNA 提取结果
2.3.2 两种猪不同组织中 RXRB 基因 mRNA 表达结果
2.3.3 四种猪各组织 RXRB 基因 mRNA 表达量相互比较
2.4 讨论
第三章 长白山野猪和东北民猪 MYOM-1 基因 mRNA 组织表达及单核苷酸多态性分析与屠宰性状、肌纤维性状间的关联分析
3.1 MYOM-1 基因的作用机制及研究进展
3.2 长白山野猪和东北民猪 MYOM1 基因 mRNA 组织表达特性分析
3.2.1 试验动物
3.2.2 试验试剂和仪器
3.2.3 试验方法
3.2.3.1 RNA 的提取与浓度测定
3.2.3.2 cDNA 的获得与检测
3.2.3.3 引物设计
3.2.3.4 PCR 条件的建立
3.2.3.5 PCR 产物的凝胶电泳分析
3.2.4 结果与分析
3.2.4.1 总 RNA 提取
3.2.4.2 两种猪不同组织中 MYOM-1 基因 mRNA 表达结果
3.2.4.3 四种猪各组织 MYOM-1 基因 mRNA 表达量相互比较
3.3 MYOM-1 基因单核苷酸多态性与肌纤维性状和屠宰性状间的关联分析
3.3.1 试验样品与生产性状资料
3.3.1.1 试验东北民猪猪群建立
3.3.1.2 屠宰性状记录
3.3.1.3 血液样本采集
3.3.2 东北民猪背最长肌肌纤维密度测定
3.3.3 利用 PCR-SSCP 对各样本中的 MYOM-1 基因进行分型
3.3.3.1 主要仪器设备
3.3.3.2 试剂药品
3.3.3.3 主要试剂的配制方法
3.3.3.4 实验方法
3.3.3.5 结果与分析
3.4 讨论
第四章 RXRB 基因和 MYOM-1 基因物种间同源性和物种进化情况分析
4.1 猪 RXRB 基因和 MYOM-1 基因遗传进化与系统发生分析研究进展
4.2 研究材料和方法
4.2.1 研究材料
4.2.2 研究方法
4.3 结果与分析
4.3.1 使用 MEGA6.0 软件构建进化树
4.3.2 遗传进化分析
4.3.2.1 等位基因间的系统发生分析
4.3.2.2 系统发生分析中出现的问题及原因分析
4.3.2.3 各物种内和物种间的遗传变异程度对物种结构及多样性的影响
4.3.2.4 从系统发生方面分析 RXRB 基因和 MYOM-1基因与物种生理功能间的关系
4.4 结论
第五章 全文总结
参考文献
作者简介
致谢
本文编号:3333166
【文章来源】:吉林农业大学吉林省
【文章页数】:55 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
Abstract
目录
第一章 前言
1.1 猪肌纤维的研究进展
1.2 本研究的意义
第二章 长白山野猪和东北民猪 RXRB 基因 mRNA 组织表达特性分析
2.1 RXRB 基因的作用机制及研究进展
2.2 研究材料和方法
2.2.1 试验动物
2.2.2 试验试剂和仪器
2.2.3 试验方法
2.2.3.1 RNA 的提取与浓度测定
2.2.3.2 cDNA 的获得与检测
2.2.3.3 引物设计
2.2.3.4 PCR 条件的建立
2.2.3.5 PCR 产物的凝胶电泳分析
2.2.3.6 数据分析
2.3 结果与分析
2.3.1 总 RNA 提取结果
2.3.2 两种猪不同组织中 RXRB 基因 mRNA 表达结果
2.3.3 四种猪各组织 RXRB 基因 mRNA 表达量相互比较
2.4 讨论
第三章 长白山野猪和东北民猪 MYOM-1 基因 mRNA 组织表达及单核苷酸多态性分析与屠宰性状、肌纤维性状间的关联分析
3.1 MYOM-1 基因的作用机制及研究进展
3.2 长白山野猪和东北民猪 MYOM1 基因 mRNA 组织表达特性分析
3.2.1 试验动物
3.2.2 试验试剂和仪器
3.2.3 试验方法
3.2.3.1 RNA 的提取与浓度测定
3.2.3.2 cDNA 的获得与检测
3.2.3.3 引物设计
3.2.3.4 PCR 条件的建立
3.2.3.5 PCR 产物的凝胶电泳分析
3.2.4 结果与分析
3.2.4.1 总 RNA 提取
3.2.4.2 两种猪不同组织中 MYOM-1 基因 mRNA 表达结果
3.2.4.3 四种猪各组织 MYOM-1 基因 mRNA 表达量相互比较
3.3 MYOM-1 基因单核苷酸多态性与肌纤维性状和屠宰性状间的关联分析
3.3.1 试验样品与生产性状资料
3.3.1.1 试验东北民猪猪群建立
3.3.1.2 屠宰性状记录
3.3.1.3 血液样本采集
3.3.2 东北民猪背最长肌肌纤维密度测定
3.3.3 利用 PCR-SSCP 对各样本中的 MYOM-1 基因进行分型
3.3.3.1 主要仪器设备
3.3.3.2 试剂药品
3.3.3.3 主要试剂的配制方法
3.3.3.4 实验方法
3.3.3.5 结果与分析
3.4 讨论
第四章 RXRB 基因和 MYOM-1 基因物种间同源性和物种进化情况分析
4.1 猪 RXRB 基因和 MYOM-1 基因遗传进化与系统发生分析研究进展
4.2 研究材料和方法
4.2.1 研究材料
4.2.2 研究方法
4.3 结果与分析
4.3.1 使用 MEGA6.0 软件构建进化树
4.3.2 遗传进化分析
4.3.2.1 等位基因间的系统发生分析
4.3.2.2 系统发生分析中出现的问题及原因分析
4.3.2.3 各物种内和物种间的遗传变异程度对物种结构及多样性的影响
4.3.2.4 从系统发生方面分析 RXRB 基因和 MYOM-1基因与物种生理功能间的关系
4.4 结论
第五章 全文总结
参考文献
作者简介
致谢
本文编号:3333166
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