产蛋鸡传染性支气管炎病毒的分离鉴定及其遗传变异和血清型分析

发布时间：2021-08-21 21:35

　　【目的】明确产蛋鸡源传染性支气管炎病毒（IBV）分离株（GX-YL170808）的结构基因及抗原变异情况,为广西种鸡场的传染性支气管炎（IB）防控提供科学依据。【方法】通过鸡胚尿囊液血凝试验、鸡胚侏儒化试验及3’端非编码区（3’-UTR）测序对分离株进行鉴定;采用RT-PCR扩增S1、E、M和N基因,以MegAlign和MEGA 6.0分别进行核苷酸序列相似性及系统发育进化树分析,运用RDP4和SimPlot对S1、E、M和N基因进行重组分析,利用NetNGlyc 1.0和NetOGlyc 4.0进行糖基化位点预测分析,并通过中和试验进行血清型鉴定。【结果】分离株的鸡胚尿囊液血凝试验呈阴性,鸡胚盲传5代后出现侏儒胚典型病变,其3’-UTR序列与IBV的3’-UTR序列相似性为99.13%;综合病鸡临床症状及其病理变化可确定该病毒为IBV,命名为GX-YL170808。GX-YL170808分离株S1、E、M和N基因的开放阅读框（ORF）长度分别为1620、327、675和1230 bp,对应编码540、109、225和410个氨基酸残基,与参考株的核苷酸序列相似性分别为60.4%～96... 

【文章来源】：南方农业学报. 2020,51(08)北大核心CSCD

【文章页数】：7 页

【部分图文】：

GX-YL170808分离株3"-UTR序列的RT-PCR鉴定结果

GX-YL170808分离株S1、E、M和N基因扩增电泳结果

为进一步了解GX-YL170808分离株的流行病学特征，本研究对其4个结构基因（S1、E、M和N）进行扩增及重组分析。由于正股RNA病毒依赖的RNA聚合酶缺乏校正功能，导致IBV极易发生重组（周海生等，2017）。虽然本研究的基因重组分析结果表明4个结构基因内部均无重组区域，但系统发育进化树显示其S1、M和N基因属LX4型，而E基因属LDT3型。已有研究表明，基因重组可广泛发生在IBV基因组的非结构基因等位置（Thor et al.,2011），故不排除GX-YL170808分离株为重组株，且其重组断点在S1、E、M和N基因之外的可能性。因此，下一步需对该分离株进行全基因组测序分析。图5 GX-YL170808分离株S1、E、M和N蛋白糖基化位点预测分析结果

【参考文献】：
期刊论文
[1]2009-2017年广西地区鸡传染性支气管炎流行病学调查[J]. 董志华,范文胜,赵长润,张文,陈基明,韦天超,磨美兰,韦平.  中国兽医学报. 2019(09)
[2]3株传染性支气管炎病毒蛋鸡源河南株的S1基因序列分析[J]. 吴倩倩,许鑫,陈钦玺,阚云超,姚伦广,王新卫,冀君.  河南农业科学. 2019(06)
[3]基于中国知网数据的鸡传染性支气管炎病毒混合感染分析[J]. 李智超,孟春春,栗永华,车路平,仇旭升,孙英杰,谭磊,廖瑛,宋翠萍,姚刚,王金泉,丁铲.  中国动物传染病学报. 2018(05)
[4]我国2002-2016年间鸡传染性支气管炎病毒基因组序列重组分析[J]. 周海生,张美红,田雪,武奇,邵红霞,钱琨,叶建强,秦爱建.  微生物学通报. 2017(12)
[5]桔百颗粒(乐康宁)对雏鸡感染鸡传染性支气管炎的防治效果[J]. 何怡宁,李仲林,唐宁,王海勇,曹艳杰,范文胜,朱雷,吴阳开,韦平,韦天超,磨美兰.  南方农业学报. 2016(09)
[6]2012～2013年鸡传染性支气管炎病毒广西分离株S1基因序列分析与血清型鉴定[J]. 张丽华,吴翠兰,张志鹏,何怡宁,李和鸣,秦丽莉,韦天超,磨美兰,韦平.  病毒学报. 2016(01)

博士论文
[1]2001～2016年间华东地区IBV分子流行病学、致病性及S1蛋白的天然免疫应答研究[D]. 周海生.扬州大学 2017

硕士论文
[1]2015-2017年广西鸡传染性支气管炎病毒分离株结构基因序列分析与血清型鉴定[D]. 唐宁.广西大学 2018



本文编号：3356376