黑龙江省某规模化牧场BVDV病毒分离鉴定及生物学信息分析
发布时间：2021-08-30 02:10
为了探讨黑龙江某规模化牧场发病奶牛的致病原及其生物学特征,对黑龙江省某规模化牛场采集到的育成牛肺脏组织样本进行病毒分离鉴定,确定了样本的基因型为BVDV-1d,5’UTR的同源性比对显示,与中国北京株BJ1023（Genbank:KF925509）同源性最高。E2基因的同源性比对显示,与中国北京株BJ1308（Genbank:KT951841）同源性最高。对样本进行E2基因序列分析和理化性质分析可知,E2核苷酸水平上有58.9%的可变性位点（763/1 296）,保守区有两段:核苷酸位置394～541以及919～1 234。有两个潜在的跨膜信号区域:30～50和410～420。蛋白不稳定性为33.62,可以将该蛋白质分类为稳定的蛋白质。E2基因的抗原表位与瑞士毒株SuwaCp （Genbank:KC853441）的抗原表位优势部分走势基本一致。分离获得的毒株为我国BVDV毒株资源与分子流行病学提供了资料。
【文章来源】：黑龙江八一农垦大学学报. 2020,32(05)
【文章页数】：10 页
【部分图文】：
5’UTR PCR结果
通过在BLAST对比结果显示，样本株AD-1基因型为BVDV-1d。将所得序列使用MegaX64与Genbank中公布的36株BVDV基因序列进行核苷酸、氨基酸同源性比较，结果显示，5’-UTR测序结果的AD-1与所有参考毒株的同源性为70.8%～99.5%。与BVDV-1型的同源性为75.4%～99.5%，与BVDV-2型的参考株同源性为76.4%～77.9%，与BVDV-3型的参考株同源性为70.8%。样本株AD-1的同源性最高同为北京株BJ1023(Genbank:KF925509）同源性为99.5%，其次是玉树株Yushu2121(Genbank:KC414613）同源性为95.9%、宁夏株11Y59 (Genbank:JX437158）同源性为94.9%。从进化树上可以看出，与北京株BJ1023处于同一进化分支。（图2、图3)图3 BVDV 5’UTR基因核苷酸树状分析结果
BVDV 5’UTR基因核苷酸树状分析结果
【参考文献】：
期刊论文
[1]吉林省西部地区牛新孢子虫病流行病学调查[J]. 柴方红,孙兴忠,李航,谢素珠,张贺洋,贾立军. 延边大学农学学报. 2018(02)
[2]牛病毒性腹泻病毒研究进展[J]. 邵红,倪宏波. 黑龙江八一农垦大学学报. 2017(06)
[3]血浆生物学指标与TOAST分型各亚型的相关性[J]. 李平,仝秀清,楚洪波. 长春大学学报. 2016(02)
[4]牛病毒性腹泻病毒基因Ⅱ型HLJ-10分离株全基因组克隆及其序列特征分析[J]. 刘华,付培芬,李岩,温凯,贾莹,刘晓玫,张海丽,商云鹏,高明春,马波,张文龙,王君伟. 中国预防兽医学报. 2012(01)
[5]猪瘟病毒石门强毒株和兔化弱毒疫苗株E2蛋白糖基化位点差异分析[J]. 彭伍平,夏照和,侯强,李娜,孙元,童光志,仇华吉. 病毒学报. 2007(05)
[6]枯草芽孢杆菌与酵母培养物对奶牛产奶性能的影响研究[J]. 赵珺,黄玉珍. 长春大学学报. 2007(08)
[7]牛病毒性腹泻病毒抗原捕获ELISA检测方法的标准化研究[J]. 邓宇,王新华,郭燕,钟发刚,沈敏. 中国预防兽医学报. 2007(07)
[8]猪瘟病毒囊膜糖蛋白E2中和表位的定位及其免疫反应性分析[J]. 张富强,李志华,张念祖. 病毒学报. 2005(02)
[9]信使RNA三维遗传信息的研究[J]. 刘次全. 中国科学基金. 1998(01)
[10]牛病毒性腹泻－粘膜病病毒的分离鉴定[J]. 刘善艺,茹仙古丽. 中国畜禽传染病. 1996(01)
博士论文
[1]牛病毒性腹泻病毒诱导的细胞自噬对病毒感染影响机制研究[D]. 周玉龙.吉林大学 2017
硕士论文
[1]牛病毒性腹泻病毒新疆流行株的分离鉴定及E2基因遗传变异研究[D]. 王国超.石河子大学 2014
[2]我国牛病毒性腹泻病毒E2基因的多态性分析[D]. 郎一飞.中国农业科学院 2014
本文编号：3371848
【文章来源】：黑龙江八一农垦大学学报. 2020,32(05)
【文章页数】：10 页
【部分图文】：
5’UTR PCR结果
通过在BLAST对比结果显示，样本株AD-1基因型为BVDV-1d。将所得序列使用MegaX64与Genbank中公布的36株BVDV基因序列进行核苷酸、氨基酸同源性比较，结果显示，5’-UTR测序结果的AD-1与所有参考毒株的同源性为70.8%～99.5%。与BVDV-1型的同源性为75.4%～99.5%，与BVDV-2型的参考株同源性为76.4%～77.9%，与BVDV-3型的参考株同源性为70.8%。样本株AD-1的同源性最高同为北京株BJ1023(Genbank:KF925509）同源性为99.5%，其次是玉树株Yushu2121(Genbank:KC414613）同源性为95.9%、宁夏株11Y59 (Genbank:JX437158）同源性为94.9%。从进化树上可以看出，与北京株BJ1023处于同一进化分支。（图2、图3)图3 BVDV 5’UTR基因核苷酸树状分析结果
BVDV 5’UTR基因核苷酸树状分析结果
【参考文献】：
期刊论文
[1]吉林省西部地区牛新孢子虫病流行病学调查[J]. 柴方红,孙兴忠,李航,谢素珠,张贺洋,贾立军. 延边大学农学学报. 2018(02)
[2]牛病毒性腹泻病毒研究进展[J]. 邵红,倪宏波. 黑龙江八一农垦大学学报. 2017(06)
[3]血浆生物学指标与TOAST分型各亚型的相关性[J]. 李平,仝秀清,楚洪波. 长春大学学报. 2016(02)
[4]牛病毒性腹泻病毒基因Ⅱ型HLJ-10分离株全基因组克隆及其序列特征分析[J]. 刘华,付培芬,李岩,温凯,贾莹,刘晓玫,张海丽,商云鹏,高明春,马波,张文龙,王君伟. 中国预防兽医学报. 2012(01)
[5]猪瘟病毒石门强毒株和兔化弱毒疫苗株E2蛋白糖基化位点差异分析[J]. 彭伍平,夏照和,侯强,李娜,孙元,童光志,仇华吉. 病毒学报. 2007(05)
[6]枯草芽孢杆菌与酵母培养物对奶牛产奶性能的影响研究[J]. 赵珺,黄玉珍. 长春大学学报. 2007(08)
[7]牛病毒性腹泻病毒抗原捕获ELISA检测方法的标准化研究[J]. 邓宇,王新华,郭燕,钟发刚,沈敏. 中国预防兽医学报. 2007(07)
[8]猪瘟病毒囊膜糖蛋白E2中和表位的定位及其免疫反应性分析[J]. 张富强,李志华,张念祖. 病毒学报. 2005(02)
[9]信使RNA三维遗传信息的研究[J]. 刘次全. 中国科学基金. 1998(01)
[10]牛病毒性腹泻－粘膜病病毒的分离鉴定[J]. 刘善艺,茹仙古丽. 中国畜禽传染病. 1996(01)
博士论文
[1]牛病毒性腹泻病毒诱导的细胞自噬对病毒感染影响机制研究[D]. 周玉龙.吉林大学 2017
硕士论文
[1]牛病毒性腹泻病毒新疆流行株的分离鉴定及E2基因遗传变异研究[D]. 王国超.石河子大学 2014
[2]我国牛病毒性腹泻病毒E2基因的多态性分析[D]. 郎一飞.中国农业科学院 2014
本文编号：3371848
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