绒肉兼用山羊重要经济性状基因组选择的模拟研究

发布时间：2021-09-01 18:48

　　近年来,随着基因芯片技术的发展与育种技术的进步,动植物的基因组选择成为研究热点。在家畜育种中,基因组选择凭借其准确性高、世代间隔短和育种成本低等优势被应用于各种经济动物的种畜选择中。本研究根据前期对内蒙古阿尔巴斯绒山羊生产性能的遗传评估结果,以山羊的体重（²=0.11）和纤维直径（²=0.34）两个性状为例,参考NCBI已经公布的山羊基因组序列信息,设定合理的基因组参数和世代传递过程,模拟历史群体和基础群体的表型和基因型数据,之后,基础群体继续繁育,从基础群的后代中选择不同规模大小的参考群体和验证群体。以模拟获得的表型和基因型数据为基础,利用GBLUP、BayesA、BayesB、Bayesian Ridge Regression（BRR）、Bayesian LASSO共5种基因组育种值估计方法进行遗传评估,针对不同标记密度、不同参考群体规模和不同QTL数目等,通过交叉验证的方法确定不同水平下基因组选择的准确性,初步确定影响基因组选择准确性的关键因素的最适水平。具体结果如下:1.通过研究发现,标记密度为45K的中等密度芯片可作为日后利用真实数... 

【文章来源】：内蒙古农业大学内蒙古自治区

【文章页数】：46 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

绒纤维直径基因组选择的准确性随标记密度的变化

图 2 体重基因组选择的准确性随标记密度的变化Fig.2 Variation of accuracy of body weight genomic selection with marker density结体来看，无论是绒纤维直径等中等偏高遗传力性状还是体重等低遗传力性状

图 3 绒纤维直径基因组选择的准确性随参考群体规模的变化 The accuracy of genomic selection of pile fiber diameter varies with different reference populatio参考群体规模下体重基因组选择准确性的比较4 显示，GBLUP 法、BRR 法、BL 法和 BA 法的基因组选择的准确性

【参考文献】：
期刊论文
[1]内蒙古绒山羊抓绒性状的遗传参数及遗传进展估计的研究[J]. 李学武,王瑞军,王志英,娜清,李宏伟,王振宇,苏蕊,张燕军,李金泉,刘少卿.  黑龙江畜牧兽医. 2017(01)
[2]畜禽基因组选择研究进展[J]. 张哲,张勤,丁向东.  科学通报. 2011(26)
[3]马尔科夫链蒙特卡罗方法研究综述[J]. 朱新玲.  统计与决策. 2009(21)

博士论文
[1]基于SNP芯片和全测序数据的奶牛全基因组关联分析和基因组选择研究[D]. 吴晓平.中国农业大学 2014

硕士论文
[1]山羊绒候选基因筛选及低密度芯片设计[D]. 刘斌.内蒙古农业大学 2016
[2]肉用绵羊基因组选择方法的模拟研究[D]. 王景霖.山西农业大学 2014
[3]西门塔尔牛部分屠宰和肉质性状基因组选择初步研究[D]. 朱淼.中国农业科学院 2013
[4]通过预选标记法进行基因组选择[D]. 董林松.山东农业大学 2012



本文编号：3377498