2018年大庆市某规模化猪场PEDV检测及S1基因遗传变异分析

发布时间：2021-09-02 07:11

　　为调查2018年大庆市某规模化猪场猪流行性腹泻病毒（PEDV）的感染及遗传变异情况,应用RT-PCR方法,对该规模化猪场的两个分场的仔猪腹泻样品进行PEDV S1基因扩增、测序及遗传进化分析。结果表明两个分场均存在PEDV感染;序列分析显示,两个分场PEDV S1基因序列核苷酸同源性为98.3%,推导氨基酸同源性为97.7%,与我国HGC-01-2015野毒株核苷酸同源性最高为99.0%,与2014年日本流行毒株ZK-O型毒株核苷酸同源性最低为84.9%。PEDV S1基因系统进化树分析显示,实验鉴定毒株均属于GⅡb亚群,与近年国内流行毒株及黑龙江省地区的流行毒株亲缘关系较近,与早期经典毒株CV777型毒株及国外流行毒株亲缘关系较远。 

【文章来源】：黑龙江八一农垦大学学报. 2020,32(06)

【文章页数】：9 页

【部分图文】：

PEDV S1基因PCR鉴定图

对挑取的单菌落进行菌落PCR鉴定，琼脂糖凝胶电泳结果显示，扩增目的片段与预期的大小相符，获得阳性菌落，如图3所示。2.4 PEDV S1基因序列同源性分析

研究成功获得了2株PEDV S1基因序列，将成功克隆并测序的基因序列递交NCBI的Gen Bank数据库，获得Gen Bank编号为MK395356和MK395357，同源性分析显示鉴定毒株S1基因的核苷酸同源性为98.3%，推导的氨基酸同源性为97.7%，与经典毒株CV777相比，核苷酸序列同源性为91.4%～91.6%，推导的氨基酸同源性为89.8%～89.9%。分析显示实验鉴定毒株S1基因与我国国内流行HGC-01-2015毒株、HLJ-QTH-2018毒株同源性较高，与早期经典毒株CV777、LZC毒株、ZK-O毒株同源性较低。PEDV S1基因序列比对分析见表8。2.5 PEDV S1基因遗传进化性分析

【参考文献】：
期刊论文
[1]猪流行性腹泻病毒检测方法的研究进展[J]. 李亚兰,袁晓民,湛洋,杨凌宸,胡意,谭磊,刘谭彬,郭时印,王爱兵.  中国兽医科学. 2019(03)
[2]猪流行性腹泻病毒黑龙江分离株ORF3基因的克隆、表达及分子进化分析[J]. 邹德华,郑亮,程丽鑫,李兴志,张雅婷,徐嘉欣,武雪宁,张华,曹宏伟.  黑龙江八一农垦大学学报. 2018(03)
[3]2016年黑龙江省猪流行性腹泻病毒S1基因的遗传变异分析[J]. 朱金海,王恩雨,孙东波.  黑龙江畜牧兽医. 2018(05)
[4]做好生物安全防护降低猪流行性腹泻感染风险[J]. 曲向阳.  猪业科学. 2017(07)
[5]猪流行性腹泻的诊疗与防治[J]. 覃力巾,慕家明.  乡村科技. 2016(21)
[6]桦褐孔菌酸性蛋白酶基因的克隆及其生物信息分析[J]. 李健,张宇婷,安丹丹,陈艳秋.  延边大学农学学报. 2016(04)
[7]猪流行性腹泻的特征以及治疗[J]. 仁青才让.  甘肃畜牧兽医. 2016(13)
[8]猪流行性腹泻病毒S、N和ORF3基因的遗传变异分析[J]. 王隆柏,林裕胜,车勇良,吴学敏,陈如敬,邵良平,周伦江.  畜牧兽医学报. 2014(11)
[9]我国部分省份猪流行性腹泻的流行病学监测[J]. 张志,董雅琴,刘爽,吴发兴,邵卫星,李晓成.  中国动物检疫. 2014(10)
[10]猪胸膜放线杆菌中黏附素的研究进展[J]. 计群,谢芳,周靓,王瑜,杨舒心,李林溪,韩文瑜,雷连成.  河北科技师范学院学报. 2011(01)

博士论文
[1]PEDV感染猪空肠组织的蛋白质组学分析及hnRNP A1影响PEDV复制的作用机制研究[D]. 李中华.华中农业大学 2018

硕士论文
[1]江苏某猪场2015-2016年猪流行性腹泻病毒分子流行病学调查及基于S蛋白的抗体间接ELISA检测方法的建立[D]. 江倩倩.扬州大学 2016
[2]辽宁省仔猪病毒性腹泻病的病原调查及PEDV的遗传变异分析[D]. 王娜.吉林农业大学 2015
[3]四川部分地区PED和TGE分子流行病学调查及PEDV部分S基因变异分析[D]. 杨绍林.四川农业大学 2014
[4]黑龙江省部分地区PED流行特征及病毒生物学特性研究[D]. 郎景华.东北农业大学 2003



本文编号：3378570