伪狂犬病毒编码的miRNA血清表达谱及其在疫苗免疫与感染鉴别诊断中的应用
发布时间:2021-09-11 15:58
伪狂犬病(Pesudorabies,PR)是对养猪业造成严重性破坏的重要疫病之一。此病对断奶后的仔猪、育肥猪、母猪造成明显神经性症状、不育、木乃伊胎等一系列严重疾病。近期疱疹病毒编码的miRNA的研究表明,一些疱疹病毒编码的miRNA参与病毒复制过程,甚至在病毒的调节过程中起着关键的作用。而目前对于伪狂犬病毒编码的miRNA来说,相关的研究甚少。本研究旨在研究伪狂犬病毒编码的miRNA血清表达谱及其在疫苗免疫与感染鉴别诊断中的应用。抽取不同生长阶段猪的血清,分别混合不同生长阶段疫苗免疫猪的血清和免疫后感染猪的血清。用血清RNA提取试剂盒提取总RNA,利用RT-PCR和实时荧光定量比较集中不同血清样本伪狂犬病毒编码的miRNA表达谱,利用生物信息学的方法分析伪狂犬病毒编码的miRNA对自身的调控以及感染病毒后对宿主miRNA表达谱的影响。本研究根据在感染伪狂犬病毒的血清和免疫的血清中miRNA表达量的差异,做出了关于伪狂犬病毒miRNA的血清表达谱。同时,比较分析了不同血清样本中的miRNA表达谱的差异显著性,筛选验证出能够作为分子标志的miRN A。此外还详细的分析了在疫苗免疫与感染后...
【文章来源】:沈阳农业大学辽宁省
【文章页数】:60 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
伪狂犬病毒粒子结构(PomeranzLEetal,2005)
图 2-2.由 PRV 编码的 miRNA(圈)和它们的靶基因(矩形)形成的基因调控网络。 Gene regulatory networks formed by PRV-encoded miRNAs (circles) and their tar(rectangular).犬病毒功能基因与其编码的 miRNA狂犬病毒株 JS-2012 株的基因组,分析其编码的 miRNA 在基因 miRNA 都不参与编码猪伪狂犬病毒的蛋白质编码,集中在 giRNA 占伪狂犬病毒编码的 miMRA 中很大部分,miRNA-24-含子中。图一中多数 miRNA 存在的部分多数被认为是非编码Kb 的伪狂犬病毒 DNA 链中,编码 gB,gC,gD 等 N 多个蛋白的 miRNA,因为其高度稳定的特性,更能用于疫苗免疫与感染 集中分布在 100Kb 左右处,其存在位置可能因为周围没有功能在。到伪狂犬病毒编码的这 37 条 miRNA 后,将其位置与功能性基来。图中显示 miRNA 的位置不在编码蛋白质的基因组中,大白质基因位置较远,不参与伪狂犬病毒蛋白质的结构蛋白和非
22图 2-2:病毒编码的 miRNA 在 PRV JS-2012 基因组中的位置Fig 2-2: Location of virus-encoded miRNAs in the PRV JS-2012 genome注:长线表示伪狂犬病毒基因组,黑色尖头表示伪狂犬病毒的功能性基因位置,短点标识 miRNA 所在位置。2.3 讨论在此之前几个研究已经证明病毒 mRNA 可以由伪狂犬病毒 miRNA 调节。伪狂犬病毒编码的 miRNA 靶向关键的反式激活蛋白,这些调节机制是所有伪狂犬病毒中控制潜伏期建立和再活化的关键。在前人的研究中,这可能是通过直接抑制早期基因来严格控制潜伏期的存活机制(Deltcheva E et al,2011)。miRNA-15,miRNA-16,miRNA-17,miRNA-22,miRNA-23,pmiRNA-25,miRNA-1,miRNA-3,miRNA-7,miRNA-8 和 miRNA-11 靶向位于 PRV 的大潜伏期转录物(LLT)区中。该靶向可能与维持三叉神经节静止状态或再活化状态相关。此外,miRNA 调节的途径与宿主-病毒相互作用的许多方面相关。病毒 miRNA 对细胞转录物具有调节
【参考文献】:
期刊论文
[1]2013年河南省猪伪狂犬野毒感染血清学调查[J]. 解伟涛,乔松林,王寅彪,郝慧芳,梁跃,张桂悦,郭成留,张改平. 中国动物传染病学报. 2014(06)
[2]不同物种FABP3基因编码区及蛋白生物信息学分析[J]. 高红,彭静,沈一飞,王颖,徐宁迎. 扬州大学学报(农业与生命科学版). 2014(01)
[3]Emerging and re-emerging viruses: A global challenge illustrated by Chikungunya virus outbreaks[J]. Christian A Devaux. World Journal of Virology. 2012(01)
[4]广东部分地区中小型猪场猪伪狂犬病野毒感染的血清学调查[J]. 冼琼珍,蔡明福,王淑敏,黄良宗,顾万军. 动物医学进展. 2006(10)
[5]ELISA在猪伪狂犬病诊断中的应用[J]. 牛春玲,祁小乐,崔保安,王鑫. 动物医学进展. 2004(03)
本文编号:3393292
【文章来源】:沈阳农业大学辽宁省
【文章页数】:60 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
伪狂犬病毒粒子结构(PomeranzLEetal,2005)
图 2-2.由 PRV 编码的 miRNA(圈)和它们的靶基因(矩形)形成的基因调控网络。 Gene regulatory networks formed by PRV-encoded miRNAs (circles) and their tar(rectangular).犬病毒功能基因与其编码的 miRNA狂犬病毒株 JS-2012 株的基因组,分析其编码的 miRNA 在基因 miRNA 都不参与编码猪伪狂犬病毒的蛋白质编码,集中在 giRNA 占伪狂犬病毒编码的 miMRA 中很大部分,miRNA-24-含子中。图一中多数 miRNA 存在的部分多数被认为是非编码Kb 的伪狂犬病毒 DNA 链中,编码 gB,gC,gD 等 N 多个蛋白的 miRNA,因为其高度稳定的特性,更能用于疫苗免疫与感染 集中分布在 100Kb 左右处,其存在位置可能因为周围没有功能在。到伪狂犬病毒编码的这 37 条 miRNA 后,将其位置与功能性基来。图中显示 miRNA 的位置不在编码蛋白质的基因组中,大白质基因位置较远,不参与伪狂犬病毒蛋白质的结构蛋白和非
22图 2-2:病毒编码的 miRNA 在 PRV JS-2012 基因组中的位置Fig 2-2: Location of virus-encoded miRNAs in the PRV JS-2012 genome注:长线表示伪狂犬病毒基因组,黑色尖头表示伪狂犬病毒的功能性基因位置,短点标识 miRNA 所在位置。2.3 讨论在此之前几个研究已经证明病毒 mRNA 可以由伪狂犬病毒 miRNA 调节。伪狂犬病毒编码的 miRNA 靶向关键的反式激活蛋白,这些调节机制是所有伪狂犬病毒中控制潜伏期建立和再活化的关键。在前人的研究中,这可能是通过直接抑制早期基因来严格控制潜伏期的存活机制(Deltcheva E et al,2011)。miRNA-15,miRNA-16,miRNA-17,miRNA-22,miRNA-23,pmiRNA-25,miRNA-1,miRNA-3,miRNA-7,miRNA-8 和 miRNA-11 靶向位于 PRV 的大潜伏期转录物(LLT)区中。该靶向可能与维持三叉神经节静止状态或再活化状态相关。此外,miRNA 调节的途径与宿主-病毒相互作用的许多方面相关。病毒 miRNA 对细胞转录物具有调节
【参考文献】:
期刊论文
[1]2013年河南省猪伪狂犬野毒感染血清学调查[J]. 解伟涛,乔松林,王寅彪,郝慧芳,梁跃,张桂悦,郭成留,张改平. 中国动物传染病学报. 2014(06)
[2]不同物种FABP3基因编码区及蛋白生物信息学分析[J]. 高红,彭静,沈一飞,王颖,徐宁迎. 扬州大学学报(农业与生命科学版). 2014(01)
[3]Emerging and re-emerging viruses: A global challenge illustrated by Chikungunya virus outbreaks[J]. Christian A Devaux. World Journal of Virology. 2012(01)
[4]广东部分地区中小型猪场猪伪狂犬病野毒感染的血清学调查[J]. 冼琼珍,蔡明福,王淑敏,黄良宗,顾万军. 动物医学进展. 2006(10)
[5]ELISA在猪伪狂犬病诊断中的应用[J]. 牛春玲,祁小乐,崔保安,王鑫. 动物医学进展. 2004(03)
本文编号:3393292
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