鸭MEF2A/D基因CAG重复多态性和SNP的鉴定与分析
发布时间：2021-09-24 19:44
MEF2A和MEF2D基因在包括不同类型肌肉组织在内的多种组织生长发育中具有调控作用,对家畜家禽的生产性能、尤其是骨骼肌的产量与品质有重要影响。不同物种中的研究均表明,MEF2A和MEF2D基因多态性与多项生产性状有关。骨骼肌是肉鸭生产的主要产品,探究鸭MEF2A和MEF2D基因分子标记多态性及其对生产性能的影响,有助于分子标记辅助选择和优质肉鸭新品种的培育。然而,关于MEF2A和MEF2D基因编码区CAG重复及其侧翼序列中SNP的多态性以及他们对生产性能的影响,还缺少研究报道。并且,农华麻鸭GF2系作为新近培育的优质肉鸭品系,其生产性能还缺乏系统的测定与分析。因此,本研究测定并分析了农华麻鸭GF2系肉鸭的生产性能;克隆了鸭MEF2A和MEF2D基因编码区内CAG重复序列及其两端侧翼序列,鉴定了它们在农华麻鸭GF2系肉鸭中的多态性;初步分析了CAG重复多态性与其侧翼序列中SNP间的关系;最后,对CAG重复基因型和侧翼序列中SNP位点、SNP单倍型组合与生产性能进行了关联分析。主要研究结果如下:（1）9周龄时,农华麻鸭GF2系公鸭的体重、胸肌重、腿肌重、屠宰率、胸肌率和腿肌率达到了347...
【文章来源】：四川农业大学四川省 211工程院校
【文章页数】：79 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
启动子中重复序列长度与基因表达的关系
因组 DNA 的提取效果定了生产性能的 70 只肉鸭个体，分别进行了基因组因组 DNA 经微量核酸蛋白仪检测其浓度和纯度，浓度经 1.5%琼脂糖凝胶电泳检测其完整性。结果发现，所度均符合要求，并且电泳条带清晰整齐、没有杂带，表用于后续实验。部分个体的凝胶电泳检测结果如图 3
图 3-2 （A）引物对 MEF2A-730 的 PCR 产物电泳图；（B）引物对 MEF2A-730 的克隆序列；（C）克隆序列的比对结果注：图（B）中粗体和下划线表示的区域即为 CAG 重复Fig.3-2（A）Gel electrophoresis result of primer pair MEF2A-730 PCR products；（B）Clonesequence of primer pair MEF2A-730；（C）Sequences alignment of clone sequence of primerpair MEF2A-730Note: The area indicated by bold and underline in Figure (B) is CAG repeat随后，为明确试验群体中 MEF2A 基因 CAG 重复及其侧翼序列是否存在多态性，随机挑选了 27 个体进行多态性的初步鉴定。不同个体测序结果的比对情况如图 3-3 所示，表明 MEF2A 基因 CAG 重复无多态性，并且其侧翼序列中无SNP 位点。因此，后续在全部 70 个体中将不再检测该基因。
【参考文献】：
期刊论文
[1]兴义鸭MEF2D基因的多态性及组织差异表达研究[J]. 师新彩,赵忠海,李辉,卜小雁,易恒洁,陈林. 农业生物技术学报. 2018(02)
[2]MEF2A基因第11外显子CAG三联核苷酸重复序列多态性与动脉粥样硬化性脑梗死的相关性研究[J]. 王凤,应忠明,朱敏,郑周,胡晓飞,王恩,伍嫦珠,何欣威,李卫玲,李彩,朱峰,金笑平. 中华神经医学杂志. 2017 (12)
[3]3个品种猪MEF2D基因启动子多态及其生物信息学分析[J]. 白优,张勇,陈祥,张雄,李俊,何琦,杨红,陆静. 中国畜牧杂志. 2017(10)
[4]我国肉鸭生产现状分析及改进方案[J]. 王洁,杨天宇,陈明. 畜禽业. 2017(08)
[5]兴义鸭MEF2A基因mRNA在组织中表达研究[J]. 王成栋,李辉,卜小雁,师新彩,彭邦星,易恒洁,赵忠海. 畜牧与兽医. 2017(07)
[6]我国肉鸭产业在新常态下的发展思路[J]. 侯水生. 中国禽业导刊. 2017 (12)
[7]鸭MEF2A基因克隆及其mRNA在组织间的表达差异[J]. 赵忠海,李辉,卜小雁,师新彩,张蓉,王成栋. 农业生物技术学报. 2017(01)
[8]MyoG和MEF2a基因多态性聚合效应对鸭屠宰性状的影响[J]. 赵忠海,李辉,易恒洁,杨胜林,彭邦星,卜小雁. 中国农业科学. 2016(18)
[9]我国优质肉鸭品种选育进展及发展趋势[J]. 李昂. 中国禽业导刊. 2016 (17)
[10]四川麻鸭体尺性状和生产性能观测[J]. 张军,吕佳,叶建超,罗淑英,陈有才,胡卫杰,朱攀华. 中国家禽. 2016(05)
硕士论文
[1]西门塔尔牛、雪龙黑牛两群体部分胴体性状全基因组关联分析[D]. 宋禹昕.中国农业科学院 2017
[2]兴义鸭MEF2A、MEF2B、MEF2C和MEF2D基因克隆与组织时空表达研究[D]. 赵忠海.贵州大学 2016
[3]北京油鸡体重和屠体性状的全基因组关联研究[D]. 吴丹.中国农业科学院 2012
[4]固始鸡安卡鸡资源群体1、8、9、10、11、13号染色体重要经济性状的QTL定位[D]. 张艳芳.河南农业大学 2010
[5]鸭MEF2家族的克隆及组织表达研究[D]. 司建民.四川农业大学 2009
[6]微卫星DNA多态性与骡鸭产肉性能关联性研究[D]. 董健.吉林农业大学 2008
[7]北京鸭和樱桃谷鸭肉用性能及MSTN基因多态性的研究[D]. 戴晔.西北农林科技大学 2006
[8]猪MSTN基因和MEF2D基因的多态性及其与胴体和肉质性状间关联性研究[D]. 陈磊.四川农业大学 2005
本文编号：3408336
【文章来源】：四川农业大学四川省 211工程院校
【文章页数】：79 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
启动子中重复序列长度与基因表达的关系
因组 DNA 的提取效果定了生产性能的 70 只肉鸭个体，分别进行了基因组因组 DNA 经微量核酸蛋白仪检测其浓度和纯度，浓度经 1.5%琼脂糖凝胶电泳检测其完整性。结果发现，所度均符合要求，并且电泳条带清晰整齐、没有杂带，表用于后续实验。部分个体的凝胶电泳检测结果如图 3
图 3-2 （A）引物对 MEF2A-730 的 PCR 产物电泳图；（B）引物对 MEF2A-730 的克隆序列；（C）克隆序列的比对结果注：图（B）中粗体和下划线表示的区域即为 CAG 重复Fig.3-2（A）Gel electrophoresis result of primer pair MEF2A-730 PCR products；（B）Clonesequence of primer pair MEF2A-730；（C）Sequences alignment of clone sequence of primerpair MEF2A-730Note: The area indicated by bold and underline in Figure (B) is CAG repeat随后，为明确试验群体中 MEF2A 基因 CAG 重复及其侧翼序列是否存在多态性，随机挑选了 27 个体进行多态性的初步鉴定。不同个体测序结果的比对情况如图 3-3 所示，表明 MEF2A 基因 CAG 重复无多态性，并且其侧翼序列中无SNP 位点。因此，后续在全部 70 个体中将不再检测该基因。
【参考文献】：
期刊论文
[1]兴义鸭MEF2D基因的多态性及组织差异表达研究[J]. 师新彩,赵忠海,李辉,卜小雁,易恒洁,陈林. 农业生物技术学报. 2018(02)
[2]MEF2A基因第11外显子CAG三联核苷酸重复序列多态性与动脉粥样硬化性脑梗死的相关性研究[J]. 王凤,应忠明,朱敏,郑周,胡晓飞,王恩,伍嫦珠,何欣威,李卫玲,李彩,朱峰,金笑平. 中华神经医学杂志. 2017 (12)
[3]3个品种猪MEF2D基因启动子多态及其生物信息学分析[J]. 白优,张勇,陈祥,张雄,李俊,何琦,杨红,陆静. 中国畜牧杂志. 2017(10)
[4]我国肉鸭生产现状分析及改进方案[J]. 王洁,杨天宇,陈明. 畜禽业. 2017(08)
[5]兴义鸭MEF2A基因mRNA在组织中表达研究[J]. 王成栋,李辉,卜小雁,师新彩,彭邦星,易恒洁,赵忠海. 畜牧与兽医. 2017(07)
[6]我国肉鸭产业在新常态下的发展思路[J]. 侯水生. 中国禽业导刊. 2017 (12)
[7]鸭MEF2A基因克隆及其mRNA在组织间的表达差异[J]. 赵忠海,李辉,卜小雁,师新彩,张蓉,王成栋. 农业生物技术学报. 2017(01)
[8]MyoG和MEF2a基因多态性聚合效应对鸭屠宰性状的影响[J]. 赵忠海,李辉,易恒洁,杨胜林,彭邦星,卜小雁. 中国农业科学. 2016(18)
[9]我国优质肉鸭品种选育进展及发展趋势[J]. 李昂. 中国禽业导刊. 2016 (17)
[10]四川麻鸭体尺性状和生产性能观测[J]. 张军,吕佳,叶建超,罗淑英,陈有才,胡卫杰,朱攀华. 中国家禽. 2016(05)
硕士论文
[1]西门塔尔牛、雪龙黑牛两群体部分胴体性状全基因组关联分析[D]. 宋禹昕.中国农业科学院 2017
[2]兴义鸭MEF2A、MEF2B、MEF2C和MEF2D基因克隆与组织时空表达研究[D]. 赵忠海.贵州大学 2016
[3]北京油鸡体重和屠体性状的全基因组关联研究[D]. 吴丹.中国农业科学院 2012
[4]固始鸡安卡鸡资源群体1、8、9、10、11、13号染色体重要经济性状的QTL定位[D]. 张艳芳.河南农业大学 2010
[5]鸭MEF2家族的克隆及组织表达研究[D]. 司建民.四川农业大学 2009
[6]微卫星DNA多态性与骡鸭产肉性能关联性研究[D]. 董健.吉林农业大学 2008
[7]北京鸭和樱桃谷鸭肉用性能及MSTN基因多态性的研究[D]. 戴晔.西北农林科技大学 2006
[8]猪MSTN基因和MEF2D基因的多态性及其与胴体和肉质性状间关联性研究[D]. 陈磊.四川农业大学 2005
本文编号：3408336
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