山西省鸡源新城疫病毒基因特性分析
发布时间:2021-10-14 13:49
为调查山西省鸡源新城疫病毒(NDV)的流行现状,本研究于2011-2012年从山西省部分地区的发病鸡群分离、鉴定出5株NDV,参考GenBank中已发表的NDV F基因序列(FJ969394),设计了用于扩增F基因的特异引物,应用RT-PCR技术扩增5株分离株的F基因片段。将扩增、纯化的目的片段DNA与PMD19simple-T载体连接,转化感受态细胞,运用菌落PCR法鉴定,将鉴定为含有阳性质粒的重组菌进行基因测序。利用DNAStar7.1软件对5株NDV的分子生物学特性进行了研究,包括绘制系统发育进化树、确定基因型,并与参考毒株的核苷酸及相应氨基酸序列进行比较。对分离株F基因序列的分析结果表明:其中的4株病毒在基因型分类上属于基因II亚型,并与标准弱毒疫苗LaSota株高度同源,核苷酸序列同源性为99.2%-99.4%,氨基酸序列同源性为100%,且裂解位点氨基酸序列为:112G-R-Q-G-R-L117,符合弱毒株裂解位点特征。另1分离毒株在基因型分类上与JS/5/01/Go同属基因Ⅶd亚型,两者核苷酸序列同源性为95.6%,氨基酸序列同源性为97.5%,其裂解位点氨基酸序列为:1...
【文章来源】:山西农业大学山西省
【文章页数】:28 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
符号说明
前言
1 文献综述
1.1 新城疫发病特点
1.2 新城疫病原学
1.3 NDV的分子生物学特性
1.4 我国NDV分子生物学及其疫苗的研究进展
1.4.1 我国NDV分子生物学研究进展
1.4.2 新城疫疫苗研究现状
1.5 本研究的内容、目的及意义
2 NDV的分离鉴定及F基因片段的扩增
2.1 NDV的分离鉴定
2.1.1 材料与方法
2.1.2 结果与分析
2.1.3 讨论
2.2 NDV F基因可变区部分序列的扩增与分析
2.2.1 材料与方法
2.2.2 结果与分析
2.2.3 讨论
2.3 结论
参考文献
Abstract
致谢
本文编号:3436282
【文章来源】:山西农业大学山西省
【文章页数】:28 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
符号说明
前言
1 文献综述
1.1 新城疫发病特点
1.2 新城疫病原学
1.3 NDV的分子生物学特性
1.4 我国NDV分子生物学及其疫苗的研究进展
1.4.1 我国NDV分子生物学研究进展
1.4.2 新城疫疫苗研究现状
1.5 本研究的内容、目的及意义
2 NDV的分离鉴定及F基因片段的扩增
2.1 NDV的分离鉴定
2.1.1 材料与方法
2.1.2 结果与分析
2.1.3 讨论
2.2 NDV F基因可变区部分序列的扩增与分析
2.2.1 材料与方法
2.2.2 结果与分析
2.2.3 讨论
2.3 结论
参考文献
Abstract
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本文编号:3436282
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