犬弓首蛔虫MUC-1基因的克隆及序列分析

发布时间：2021-10-18 23:11

　　为研究犬弓首蛔虫（Toxocara canis,T.canis）黏蛋白1基因（Tc-MUC-1）的分子特征,该试验根据犬弓首蛔虫基因组数据库中的Tc-MUC-1基因序列设计引物,通过PCR技术克隆Tc-MUC-1全长基因,并进行多重序列比对和种系发育进化树分析.结果发现该基因全长为531 bp,编码176个氨基酸.功能结构域分析发现Tc-MUC-1蛋白包含1个由11个STSSSSA重复序列构成的Mucin结构域和2个ShKT结构域; GO分析显示具有蛋白质结合和金属离子结合功能;多重序列比对发现Tc-MUC-1与T.canis的其余4个黏蛋白（Tc-MUC-2-Tc-MUC-5）均含有2个由36个氨基酸组成的ShKT结构域;种系发育进化树分析显示Tc-MUC-1与双胃线虫（Pristionchus pacificus; GenBank No. PDM76930）和秀丽隐杆线虫（Caenorhabditis elegans; GenBank No. NP491509）进化关系较近. 

【文章来源】：西南大学学报(自然科学版). 2020,42(03)北大核心CSCD

【文章页数】：7 页

【部分图文】：

Tc-MUC-1基因的PCR扩增结果

重组菌液的PCR鉴定

从GenBank中检索到Tc-MUC-1氨基酸序列(GenBank No. AAB05820),Tc-MUC-2(GenBank No. AAD49339),Tc-MUC-3(No. AAD49340),Tc-MUC-4(GenBank No. AAD49341),Tc-MUC-5(GenBank No. AAD49342), 并进行多重序列比对. 结果发现5个黏蛋白都是由2个不同模块构成, 其中一个是黏蛋白样富含Ser/Thr的黏蛋白结构域, 可以充当O-糖基化的位点, 另一个是36个氨基酸组成的ShKT结构域. 所有蛋白质都含有C末端配对的ShKT基序, 而Tc-MUC-3和Tc-MUC-5在N末端同样含有ShKT基序(图4).图4 Tc-MUC-1序列多重序列比对

【参考文献】：
期刊论文
[1]犬弓首蛔虫abcg-5基因的克隆及序列分析[J]. 黄汉成,江艾耘,罗永莉,杨晓迪,李相兰,胡志刚,周荣琼.  西南大学学报(自然科学版). 2019(03)



本文编号：3443680