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基于Y染色体遗传标记分析建昌马的遗传多样性

发布时间:2021-10-23 05:22
  为了分析建昌马的Y染色体遗传多样性和父系起源进化,试验从建昌马公马(n=21)血液样本中提取基因组DNA,对马Y染色体上4个遗传标记位点(Y-25 345、Y-45 288、Y-45 701/977、Y-50 869)进行PCR扩增后直接测序,分析测序结果并定义马Y染色体单倍型。结果表明:在建昌马的1个遗传标记位点发现单核苷酸多态性(Y-50 869,T/A),共鉴定出2种单倍型,即CHT1和CHT2,其中CHT1单倍型占绝对优势,单倍型多样性为0.095±0.084,核苷酸多样性为0.000 36±0.000 32,Y染色体遗传多样性低。说明建昌马可能有2个父系起源。 

【文章来源】:黑龙江畜牧兽医. 2020,(18)北大核心

【文章页数】:3 页

【部分图文】:

基于Y染色体遗传标记分析建昌马的遗传多样性


马Y染色体4个位点PCR产物琼脂糖凝胶电泳结果

建昌,位点,单倍型


PCR产物测序结果显示,21匹建昌马公马中Y-25 345、Y-45 288和Y-45 701/997位点均没有发现SNP,但1匹建昌马的Y-50 869位点存在T/A颠换突变,见图2。根据Y-50 869位点的1个SNP,将21匹建昌马分为2种单倍型,分别为CHT1和CHT2单倍型,个体数比例分别为95.24%、4.76%,见表2。通过DnaSPv 5.10.01软件计算得到单倍型多样性为0.095±0.084,核苷酸多样性为0.000 36±0.000 32。

【参考文献】:
期刊论文
[1]建昌马的数量分布及其影响因素[J]. 杨世忠,林代俊,王毅.  草业与畜牧. 2012(01)
[2]关中马mtDNA D-loop区遗传多态性分析[J]. 苏锐,谢文美,张云生,王小斌,张春梅,王美菊,陈宏,雷初朝.  西北农业学报. 2008(06)
[3]Y染色体的多态性遗传标记及其法医学应用[J]. 张健,侯一平,唐剑频.  中华医学遗传学杂志. 2002(05)



本文编号:3452552

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