猪CAST基因多态性分析及发育性表达研究

发布时间：2021-10-24 08:07

　　CAST基因被认为是影响肉质性状的候选基因,本试验从基因多态性水平和基因表达水平研究不同猪种CAST基因第2内含子和外显子9的多态性分布,以及CAST基因在马身猪和大白猪背最长肌组织中的表达分析,以期为马身猪优良肉质遗传分子机理提供理论基础。猪CAST基因第2内含子中存在以GT为核心序列的微卫星座位。本试验检测了5个猪种（马身猪、山西黑猪、大白猪、长白猪、杜洛克猪）共227个个体在该座位的遗传多态性,检测到4个等位基因：A（171bp）、B（179bp）、C（185bp）、D（191bp）。所检测的猪群体中,马身猪群体以B等位基因为主（基因频率为0.6310）,山西黑猪和杜洛克猪群体以D等位基因为主（基因频率分别为0.6389和0.5143）,长白猪和大白猪群体中4种基因频率相近。所选择的猪群体中,共有10种基因型被检测到,大白猪和长白猪群体的基因型以纯合子为主,遗传纯合度分别为0.7037和0.6667。马身猪和山西黑猪群体的基因型以杂合子为主,遗传杂合度分别为0.5476和0.6111。采用PCR-SSCP技术检测了杜洛克猪、大白猪、长白猪、晋汾白猪、山西黑猪和马身猪6个品种共41... 

【文章来源】：山西农业大学山西省

【文章页数】：53 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
中英文缩略对照表
前言
文献综述
    1 钙蛋白酶系统简介
        1.1 钙蛋白酶系统的发现
        1.2 钙蛋白酶系统的功能
        1.3 影响钙蛋白酶系统的因素
    2 CAST基因的研究进展
        2.1 CAST基因的发现及定位
        2.2 CAST蛋白的结构
        2.3 CAST蛋白的作用机制
        2.4 CAST基因多态性的研究
        2.5 CAST基因表达及功能的研究
试验一 关于5个猪种CAST基因第2内含子的微卫星多态性分析
    1 材料与方法
        1.1 试验动物及材料
        1.2 主要仪器与试剂
        1.3 试验方法
        1.4 统计方法
    2 结果与分析
        2.1 猪基因组DNA的提取
        2.2 PCR扩增产物检测
        2.3 微卫星多态性检测结果
        2.4 猪CAST基因第二内含子微卫星多态性检测及分析
    3 讨论
        3.1 猪CAST基因遗传多态性及群体遗传学分析
        3.2 各猪种间遗传结构比较
试验二 关于6个猪种CAST基因第9外显子多态性分析
    1 材料与方法
        1.1 试验动物及材料
        1.2 主要仪器与试剂
        1.3 试验方法
    2 结果与分析
        2.1 CAST基因第9外显子PCR扩增结果
        2.2 CAST基因第9外显子SSCP结果
        2.3 不同猪种CAST基因单倍型频率及显著性检验
        2.4 猪CAST基因SSCP多态位点与生长发育性状的关联分析
    3 讨论
        3.1 猪CAST基因外显子9的多态性
        3.2 CAST基因外显子9的单倍型对猪体重和体尺性状的影响
试验三马身猪和大白猪CAST基因发育性表达研究
    1 材料与方法
        1.1 试验动物及组织
        1.2 主要仪器与试剂
        1.3 试验方法
    2 结果与分析
        2.1 总RNA提取结果
        2.2 标准曲线的建立与分析
        2.3 部分样品扩增动力学曲线
        2.4 样品扩增溶解曲线
        2.5 CAST基因MRNA的相对丰度分析
    3 讨论
        3.1 关于RTQF-PCR方法
        3.2 试验结果的误差分析
        3.3 背最长肌CAST基因表达与猪发育的相关性分析
全文结论
参考文献
Abstract
致谢



本文编号：3454912