JAK-STAT通路基因对奶牛乳房炎抗性的遗传和表观遗传效应研究

发布时间：2021-11-10 04:32

　　乳房炎是影响奶牛生产经济效益和动物福利最常见的炎症疾病,为了降低奶牛乳房炎的发病率,育种工作者已经将重点转移到乳房炎抗性奶牛的培育。其中,候选基因法被认为是有效的方法,其目的在于发现单核苷酸多态性（SNP）,即使该致病基因是微效基因,候选基因法也会对该微效基因进行挖掘。在本研究中,共研究5个炎症基因,包括CD4基因、LAG3基因和其他3个涉及JAK-STAT信号通路上的基因（JAK2、STAT5A和STAT5B）。本研究使用了综合的研究方法,其目的如下：1)分析这些基因的SNPs与中国荷斯坦牛的血清细胞因子、乳房炎和产奶性状的关系；2)针对不同基因型和不同牛群中分析基因表达的差异；3鉴定乳房炎牛与健康牛的DNA甲基化水平差异,挖掘对奶牛乳房炎抗性遗传机制选择有效的标记基因。首先,通过DNA混池测序共发现60个SNPs,其中27个SNPs被用于468头奶牛群体的关联分析,进而对显著的SNPs进行mRNA表达量测定及启动子区CpG岛的DNA甲基化鉴定。本课题研究结果如下：1) JAK2基因：JAK2基因共发现5个新的SNPs。在这5个SNP中,两个SNP （SNP1A39652267G和S... 

【文章来源】：中国农业大学北京市 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校

【文章页数】：128 页

【学位级别】：博士

【文章目录】：
ABSTRACT
摘要
ACKNOWLEDGEMENTS
DEDICATION
LIST OF TABLES
LIST OF FIGURES
TABLE OF CONTENTS
LIST OF ABBREVIATIONS
INTRODUCTION
    1.1 BACKGROUND OF THE RESEARCH
    1.2 REVIEW OF LITERATURE
    1.3 JUSTIFICATION OF THE STUDY
    1.4 Rationale of the study
    1.5 OBJECTIVES OF THE STUDY AND TECHNICAL ROUTES
MATERIALS AND METHODS
    2.1 Sample collection and phenotypic data
    2.2 DNA extraction and SNPs identification
    2.3 RNA extraction,cDNA synthesis
    2.4 Quantitative real time PCR(qRT-PCR)
    2.5 Bisulfite treatment of extracted DNA and hot start PCR
    2.6 Quantitative DNA methylation evaluation using pyrosequencing
    2.7 Statistical analysis
RESULTS AND DISCUSSION
    3.1 SNPs discovery and genotypes
    3.2 Results of JAK2 gene
    3.3 Results of STAT5A/B genes
    3.4 RESULTS AND DISCUSSION OF CD4
    3.5 RESULTS AND DISCUSSION OF LAG3
    3.6 Combination genotype effect of SNPs in the 5 genes
    3.7 Integrating the 2 projects:Grand Analysis
GENERAL DISCUSSION
CONCLUSIONS
REFERENCES
APPENDIX 1
APPENDIX 2
Curriculum vitae



本文编号：3486580