牛FOXA2基因组织表达规律及遗传变异研究
发布时间：2021-11-13 06:50
牛分子标记辅助育种的前提是找到对生长性状有显著影响的基因或分子标记。翼螺旋转录因子FOXA2是调节组织发育、胰腺分泌、糖脂代谢及脂肪分化的重要转录因子。目前，尚未见该基因在牛上的研究报道。因此，本试验利用荧光定量PCR首先在mRNA水平上考察了不同发育阶段的秦川牛和不同营养水平肥育的中国荷斯坦牛FOXA2基因的组织表达规律，探索FOXA2基因对牛生长发育的影响，再利用DNA池测序和PCR-RFLP等方法在群体水平上研究了FOXA2基因在秦川牛、南阳牛、郏县红牛、德南牛和夏郏牛中的遗传变异，并分析了该基因4个多态位点的遗传多样性及其与5个黄牛群体的生长性状之间的关联性，以期发现对黄牛生长发育影响显著的分子标记，为今后黄牛分子标记辅助选择、培育优质高产的新品系提供科学依据。本研究获得以下结果：（1）秦川牛FOXA2基因在不同发育阶段的组织表达谱分析FOXA2基因在秦川牛3个发育阶段（胎牛、新生犊牛、成年牛）9个组织中的相对定量结果显示，FOXA2的表达受组织特异性和时间特异性的影响。FOXA2基因在同一时期各组织间差异表达，在三个时期的肝脏中其表达量均很高，在胎牛和犊牛的肺脏中表达丰度最高...
【文章来源】：西北农林科技大学陕西省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：88 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
组织总RNA琼脂糖电泳图
图 2-1 组织总 RNA 琼脂糖电泳图Fig. 2-1 The electrophoresis result of total RNA in tissues注：M 代表 marker 2000，1,2,3 代表 RNA 泳道。Note: M represents marker 2000, 1,2,3 represents RNA lanes.2.2.2 cDNA 质量及 qRT-PCR 引物特异性检测结果以反转录所得 cDNA 为模板，以跨外显子的引物扩增持家基因 GAPDH，经 1%琼脂糖凝胶电泳检测结果如图 2-2a，仅出现一条 145 bp 的目的片段，与预期结果一致，说明 cDNA 没有受到基因组 DNA 的污染；经 qRT-PCR 结果显示的溶解曲线峰图 2-2b显示，目的基因 FOXA2 和内参基因 GAPDH 的溶解曲线各均只出现了一个单峰，表明引物特异性好，可进行下一步试验。
2.2.3 FOXA2 基因在秦川牛中的组织表达谱2.2.3.1 秦川牛 FOXA2 基因在胎牛时期的组织表达谱秦川牛胎牛时期的 8 个不同组织中 FOXA2 基因的相对表达量结果如图 2-3 所示，在所检测的组织中，肺脏的 FOXA2 基因表达丰度最高（P<0.01），且肝脏和肺脏两个组织的 FOXA2 基因表达量均极显著高于其他组织（P<0.01），胃和小肠中也表达，脾脏、肾脏和肌肉低量表达或不表达，提示 FOXA2 基因可能在秦川牛胚胎时期与肺脏和肝脏发育紧密相关。
【参考文献】：
期刊论文
[1]南阳牛种质资源个性描述[J]. 魏成斌,张彬,施巧婷,蔺萍,徐照学. 河南农业科学. 2013(09)
[2]分子标记在动物育种中的应用[J]. 刘双虎,胡海燕. 养殖技术顾问. 2013(09)
[3]秦川牛选育与改良的评析与建议[J]. 王娟. 养殖技术顾问. 2013(09)
[4]饲粮能氮限饲与补偿对蒙古羔羊肝脏重量、肝细胞增殖和增肥及生长激素受体、类胰岛素生长因子基因表达量的影响[J]. 张冬梅,侯先志,杨金丽,高爱武,王海荣,考桂兰. 动物营养学报. 2013(07)
[5]实时荧光定量PCR技术研究及其在医学领域的应用[J]. 鲍鑫,刘向国,刘茜. 医学理论与实践. 2013(12)
[6]多种因素对牛超数排卵效果影响的研究[J]. 王峰,黄春华,张东,王申元,刘彩云,刘羿羿,韩锦龙,韩利东,潘静,张立. 中国农学通报. 2013(17)
[7]牦牛乳脂合成关键酶基因全泌乳期的表达研究[J]. 李钰璨,邓霄禹,江明锋. 中国畜牧兽医. 2013(04)
[8]谷饲、乳饲奶公牛犊直线育肥报告[J]. 王嘉博,孙芳,亓美玉,赵晓川,刘利. 中国牛业科学. 2013(02)
[9]红安格斯牛改良郏县红牛的试验效果[J]. 马桂变. 中国牛业科学. 2013(01)
[10]中国西门塔尔牛DGAT1和DGAT2基因组织表达谱及其在脂肪组织中的表达与背膘厚的关联分析[J]. 王国富,吴慧光,孙国权,李俊雅,王景山,王玉泉,高树新. 华北农学报. 2012(05)
博士论文
[1]慢病毒介导的Foxa2和Hnf4a组成性表达对胚胎干细胞向肝细胞分化的影响[D]. 刘涛.第三军医大学 2009
[2]猪生产性状QTL区域5个候选基因的分离、鉴定及功能初步研究[D]. 吴健.华中农业大学 2007
[3]猪PRKAG3基因表达规律及其与肉质关系的研究[D]. 李梦云.四川农业大学 2006
[4]营养限制和补偿生长对母羊和羔羊的生长轴激素及其受体基因表达水平的影响[D]. 齐景伟.内蒙古农业大学 2006
硕士论文
[1]HNF6对结肠癌肿瘤细胞生物学行为影响的初步研究[D]. 耿海涛.浙江大学 2012
[2]地塞米松调控胰岛β细胞内PDX-1、FoxO1表达的机制研究[D]. 骆莺.南京医科大学 2010
[3]北方地区种公牛遗传多样性评估及个体识别研究[D]. 王静.甘肃农业大学 2008
[4]五个山羊品种微卫星和DQA基因的遗传多样性研究[D]. 李俊营.西北农林科技大学 2007
本文编号：3492543
【文章来源】：西北农林科技大学陕西省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：88 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
组织总RNA琼脂糖电泳图
图 2-1 组织总 RNA 琼脂糖电泳图Fig. 2-1 The electrophoresis result of total RNA in tissues注：M 代表 marker 2000，1,2,3 代表 RNA 泳道。Note: M represents marker 2000, 1,2,3 represents RNA lanes.2.2.2 cDNA 质量及 qRT-PCR 引物特异性检测结果以反转录所得 cDNA 为模板，以跨外显子的引物扩增持家基因 GAPDH，经 1%琼脂糖凝胶电泳检测结果如图 2-2a，仅出现一条 145 bp 的目的片段，与预期结果一致，说明 cDNA 没有受到基因组 DNA 的污染；经 qRT-PCR 结果显示的溶解曲线峰图 2-2b显示，目的基因 FOXA2 和内参基因 GAPDH 的溶解曲线各均只出现了一个单峰，表明引物特异性好，可进行下一步试验。
2.2.3 FOXA2 基因在秦川牛中的组织表达谱2.2.3.1 秦川牛 FOXA2 基因在胎牛时期的组织表达谱秦川牛胎牛时期的 8 个不同组织中 FOXA2 基因的相对表达量结果如图 2-3 所示，在所检测的组织中，肺脏的 FOXA2 基因表达丰度最高（P<0.01），且肝脏和肺脏两个组织的 FOXA2 基因表达量均极显著高于其他组织（P<0.01），胃和小肠中也表达，脾脏、肾脏和肌肉低量表达或不表达，提示 FOXA2 基因可能在秦川牛胚胎时期与肺脏和肝脏发育紧密相关。
【参考文献】：
期刊论文
[1]南阳牛种质资源个性描述[J]. 魏成斌,张彬,施巧婷,蔺萍,徐照学. 河南农业科学. 2013(09)
[2]分子标记在动物育种中的应用[J]. 刘双虎,胡海燕. 养殖技术顾问. 2013(09)
[3]秦川牛选育与改良的评析与建议[J]. 王娟. 养殖技术顾问. 2013(09)
[4]饲粮能氮限饲与补偿对蒙古羔羊肝脏重量、肝细胞增殖和增肥及生长激素受体、类胰岛素生长因子基因表达量的影响[J]. 张冬梅,侯先志,杨金丽,高爱武,王海荣,考桂兰. 动物营养学报. 2013(07)
[5]实时荧光定量PCR技术研究及其在医学领域的应用[J]. 鲍鑫,刘向国,刘茜. 医学理论与实践. 2013(12)
[6]多种因素对牛超数排卵效果影响的研究[J]. 王峰,黄春华,张东,王申元,刘彩云,刘羿羿,韩锦龙,韩利东,潘静,张立. 中国农学通报. 2013(17)
[7]牦牛乳脂合成关键酶基因全泌乳期的表达研究[J]. 李钰璨,邓霄禹,江明锋. 中国畜牧兽医. 2013(04)
[8]谷饲、乳饲奶公牛犊直线育肥报告[J]. 王嘉博,孙芳,亓美玉,赵晓川,刘利. 中国牛业科学. 2013(02)
[9]红安格斯牛改良郏县红牛的试验效果[J]. 马桂变. 中国牛业科学. 2013(01)
[10]中国西门塔尔牛DGAT1和DGAT2基因组织表达谱及其在脂肪组织中的表达与背膘厚的关联分析[J]. 王国富,吴慧光,孙国权,李俊雅,王景山,王玉泉,高树新. 华北农学报. 2012(05)
博士论文
[1]慢病毒介导的Foxa2和Hnf4a组成性表达对胚胎干细胞向肝细胞分化的影响[D]. 刘涛.第三军医大学 2009
[2]猪生产性状QTL区域5个候选基因的分离、鉴定及功能初步研究[D]. 吴健.华中农业大学 2007
[3]猪PRKAG3基因表达规律及其与肉质关系的研究[D]. 李梦云.四川农业大学 2006
[4]营养限制和补偿生长对母羊和羔羊的生长轴激素及其受体基因表达水平的影响[D]. 齐景伟.内蒙古农业大学 2006
硕士论文
[1]HNF6对结肠癌肿瘤细胞生物学行为影响的初步研究[D]. 耿海涛.浙江大学 2012
[2]地塞米松调控胰岛β细胞内PDX-1、FoxO1表达的机制研究[D]. 骆莺.南京医科大学 2010
[3]北方地区种公牛遗传多样性评估及个体识别研究[D]. 王静.甘肃农业大学 2008
[4]五个山羊品种微卫星和DQA基因的遗传多样性研究[D]. 李俊营.西北农林科技大学 2007
本文编号：3492543
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