鹅肠道菌群的宏基因组学分析及其与肥肝形成关系的研究
发布时间：2021-11-17 05:01
肠道菌群通过参与营养物质的降解、产生各种代谢物、改变肠道的屏障作用等影响肝脏的代谢与机能,在动物脂肪肝的发生发展过程中扮演着重要角色。人类与许多动物的肝脏在发生严重脂肪变性时往往会出现不可逆的炎症和纤维化,严重影响人体健康及动物生产。相反,鹅肝脏尽管在重量上增加8倍以上,形成严重的脂肪肝,但不会出现明显的病理症状,因此其可能具有独特的形成机制。课题组前期研究发现,相对于正常饲喂组,朗德鹅填饲组的肠道菌群发生了显著的结构变化,然而,它们影响鹅肥肝形成的机理尚不清楚。本研究选择70日龄体重相近的健康朗德鹅公鹅80只,随机分为对照组（48只）和填饲组（32只）。对照组正常饲养,填饲组填饲高能玉米,并于70、82和94日龄时,分别从对照组和填饲组中选取16只鹅进行屠宰采样,取肠道（空肠、回肠、盲肠）内容物。利用16S rDNA测序技术研究填饲对朗德鹅肠道微生物菌群整体结构的影响。根据16S rDNA测序结果选取样品进行宏基因组学测定,分析填饲对不同肠道段的微生物菌群结构和功能的影响。最后选取70日龄体重相近的60只朗德鹅公鹅,随机分为对照组、对照加乳酸菌组、填饲组、填饲加乳酸菌组,每组15只。...
【文章来源】：扬州大学江苏省
【文章页数】：88 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图２－１填饲不同阶段朗德鹅表型数据统计图??Ｆｉｇｕｒｅ?２－１?Ｐｈｅｎｏｔｙｐｉｃ?ｄａｔａ?ｏｆ?Ｌａｎｄｅｓ?ｇｏｏｓｅ?ｉｎ?ｄｉｆｆｅｒｅｎｔ?ｏｖｅｒｆｅｅｄｉｎｇ?ｓｔａｇｅｓ??
２．３．３朗德鹅肠道微生物群落多样性分析??通过物种累积箱形图可以对样本中物种丰度进行预测，并判断试验样本是否充分。物??种累积箱形图是描述随着样本量的增加物种多样性增加的分析，结果见图２－３。从图中可??以看出，箱型图的位置在样本量低于５０时表现出急剧上升的趋势，随着样本量的增多，??箱形图位置趋于平缓，表示试验所检测到物种并不会随样本量的增加而显著增多，本试验??所用样本数为２４０个，说明本试验抽样充分，数据有效性较高。??§?－??ｆ??“爹??〇?－??ｉｕＭＭｒａｉｉｎｎＭｉｎｎｎｎｎｉｎｎＯＴＭｎｎｎｉｎｉｎｉＭｎｉＴｎｎｉｍＭＴｉｎｎｉｎｉｎＭｎＭｉｆｎｎｎＭＭｎＭｒｏｎｎｉｎＴｎｉｎｎｎｉｎｉｎｎｎＭＭＭｎｎｍｎＭｉｎＭｉｉｉ??１?１２?２５?３８?５１?６４?７７?９０?１?０５?１２１?１３７?１５３?１?６９?１８５?２０１?２１７?２３３??Ｎｕｍｂｅｒ?ｏｆ?ｓａｍｐｌｅｓ??图２＿３物种累积箱形图??Ｆｉｇｕｒｅ?２－３?ｓｐｅｃｉｅｓ?ａｃｃｕｍｕｌａｔｉｏｎ?ｂｏｘｐｌｏｔ??注：横坐标为样本量；纵坐标为抽样后ＯＴＵ数目。??Ｎｏｔｅ：?Ｔｈｅ?ａｂｓｃｉｓｓａ?ｉｓ?ｔｈｅ?ｓａｍｐｌｅ?ｓｉｚｅ；?ｔｈｅ?ｏｒｄｉｎａｔｅ?ｉｓ?ｔｈｅ?ｎｕｍｂｅｒ?ｏｆ?ＯＴＵｓ?ａｆｔｅｒ?ｓａｍｐｌｉｎｇ．??通过稀释曲线和等级聚类曲线来分析试验各组样本的微生物群落多样性。稀释曲线是??从样品中随机抽取一定测序量的数据，统计它们所代表物种数目（即ＯＴＵｓ数目），以抽??取的测序数据量与对应的物种数来构建曲线。稀释曲线可直接反映测序数据量的合理性，??并间接反映样品中物种的丰富程度
斐Φ谰?旱暮昊?蜃檠Х治黾捌溆敕矢涡纬晒叵档难芯??２５??的数据量只会产生少量新的物种（ＯＴＵｓ）。结果见图２－４。从图中可以看出，绝大多数样??本在序列数超过３００００时曲线都趋于平缓
【参考文献】：
期刊论文
[1]肠-肝轴功能紊乱在非酒精性脂肪肝病发病机制中的作用及相关治疗策略[J]. 夏凡,周本杰. 世界华人消化杂志. 2018(24)
[2]肥胖及非酒精性脂肪肝疾病与肠道菌群相关性的研究进展[J]. 程伟伟,李博星,陆静,黎尔纳,张政,蒋爱民,袁静. 食品科技. 2018(02)
[3]肠道微生物对仔猪免疫能力的影响[J]. 张学武. 中国动物保健. 2017(11)
[4]肝硬化及肝细胞癌患者肠道微生态组成和结构的初步分析[J]. 周冷潇,韩涛,刘保文,高英堂,韩海燕. 临床肝胆病杂志. 2017(09)
[5]家禽肠道微生物稳定性影响因素及其生理功能研究进展[J]. 王姝妹,卢立志. 中国家禽. 2017(15)
[6]瑞士乳杆菌调控小鼠肠道菌群变化规律的研究[J]. 臧凯丽,贾彦,崔文静,马新颖,王泳,赵林森,赵培,叶雷,阎亚丽,陈庆森. 食品科学. 2018(01)
[7]短链脂肪酸在疾病治疗中的研究进展[J]. 王璐璇,刘玥宏,朱继开,钟煜,李利生,徐敬东. 世界华人消化杂志. 2017(13)
[8]双歧杆菌四联活菌治疗非酒精性脂肪肝的疗效观察[J]. 张彩峰. 中西医结合心血管病电子杂志. 2017(13)
[9]大鼠肠道自发荧光微生物的分布[J]. 田树红,王日超,肖敏,符健. 中国实验动物学报. 2017(01)
[10]鹅肥肝形成中肠道生理指标、菌群及代谢物的变化[J]. 刘龙,龚晗,杨彪,夏丽丽,耿拓宇,龚道清. 扬州大学学报(农业与生命科学版). 2016(04)
博士论文
[1]Behcet病患者肠道微生物宏基因组学的研究[D]. 张旎.重庆医科大学 2018
[2]鹅肥肝形成过程中差异表达miRNA筛选及miRNA-33的表达调控研究[D]. 郑云.扬州大学 2017
[3]两核苷酸实时合成测序技术及其应用研究[D]. 浦丹.东南大学 2015
[4]青藏高原传统发酵牦牛奶中乳酸菌多样性及其益生功能研究[D]. 丁武蓉.兰州大学 2014
[5]应用焦磷酸测序技术对不同人群肠道微生物群落结构的研究[D]. 郭壮.江南大学 2013
[6]高通量基因组数据的处理、分析与建模[D]. 王丛茂.上海交通大学 2012
[7]四倍体鲫鲤BAC文库构建及其演化分析[D]. 陈禹保.湖南师范大学 2011
硕士论文
[1]奶牛肠道微生物群落结构与多样性研究[D]. 高凤.河北工程大学 2017
[2]脂联素受体对鹅肥肝的保护作用及其表达调控研究[D]. 杨彪.扬州大学 2016
本文编号：3500250
【文章来源】：扬州大学江苏省
【文章页数】：88 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图２－１填饲不同阶段朗德鹅表型数据统计图??Ｆｉｇｕｒｅ?２－１?Ｐｈｅｎｏｔｙｐｉｃ?ｄａｔａ?ｏｆ?Ｌａｎｄｅｓ?ｇｏｏｓｅ?ｉｎ?ｄｉｆｆｅｒｅｎｔ?ｏｖｅｒｆｅｅｄｉｎｇ?ｓｔａｇｅｓ??
２．３．３朗德鹅肠道微生物群落多样性分析??通过物种累积箱形图可以对样本中物种丰度进行预测，并判断试验样本是否充分。物??种累积箱形图是描述随着样本量的增加物种多样性增加的分析，结果见图２－３。从图中可??以看出，箱型图的位置在样本量低于５０时表现出急剧上升的趋势，随着样本量的增多，??箱形图位置趋于平缓，表示试验所检测到物种并不会随样本量的增加而显著增多，本试验??所用样本数为２４０个，说明本试验抽样充分，数据有效性较高。??§?－??ｆ??“爹??〇?－??ｉｕＭＭｒａｉｉｎｎＭｉｎｎｎｎｎｉｎｎＯＴＭｎｎｎｉｎｉｎｉＭｎｉＴｎｎｉｍＭＴｉｎｎｉｎｉｎＭｎＭｉｆｎｎｎＭＭｎＭｒｏｎｎｉｎＴｎｉｎｎｎｉｎｉｎｎｎＭＭＭｎｎｍｎＭｉｎＭｉｉｉ??１?１２?２５?３８?５１?６４?７７?９０?１?０５?１２１?１３７?１５３?１?６９?１８５?２０１?２１７?２３３??Ｎｕｍｂｅｒ?ｏｆ?ｓａｍｐｌｅｓ??图２＿３物种累积箱形图??Ｆｉｇｕｒｅ?２－３?ｓｐｅｃｉｅｓ?ａｃｃｕｍｕｌａｔｉｏｎ?ｂｏｘｐｌｏｔ??注：横坐标为样本量；纵坐标为抽样后ＯＴＵ数目。??Ｎｏｔｅ：?Ｔｈｅ?ａｂｓｃｉｓｓａ?ｉｓ?ｔｈｅ?ｓａｍｐｌｅ?ｓｉｚｅ；?ｔｈｅ?ｏｒｄｉｎａｔｅ?ｉｓ?ｔｈｅ?ｎｕｍｂｅｒ?ｏｆ?ＯＴＵｓ?ａｆｔｅｒ?ｓａｍｐｌｉｎｇ．??通过稀释曲线和等级聚类曲线来分析试验各组样本的微生物群落多样性。稀释曲线是??从样品中随机抽取一定测序量的数据，统计它们所代表物种数目（即ＯＴＵｓ数目），以抽??取的测序数据量与对应的物种数来构建曲线。稀释曲线可直接反映测序数据量的合理性，??并间接反映样品中物种的丰富程度
斐Φ谰?旱暮昊?蜃檠Х治黾捌溆敕矢涡纬晒叵档难芯??２５??的数据量只会产生少量新的物种（ＯＴＵｓ）。结果见图２－４。从图中可以看出，绝大多数样??本在序列数超过３００００时曲线都趋于平缓
【参考文献】：
期刊论文
[1]肠-肝轴功能紊乱在非酒精性脂肪肝病发病机制中的作用及相关治疗策略[J]. 夏凡,周本杰. 世界华人消化杂志. 2018(24)
[2]肥胖及非酒精性脂肪肝疾病与肠道菌群相关性的研究进展[J]. 程伟伟,李博星,陆静,黎尔纳,张政,蒋爱民,袁静. 食品科技. 2018(02)
[3]肠道微生物对仔猪免疫能力的影响[J]. 张学武. 中国动物保健. 2017(11)
[4]肝硬化及肝细胞癌患者肠道微生态组成和结构的初步分析[J]. 周冷潇,韩涛,刘保文,高英堂,韩海燕. 临床肝胆病杂志. 2017(09)
[5]家禽肠道微生物稳定性影响因素及其生理功能研究进展[J]. 王姝妹,卢立志. 中国家禽. 2017(15)
[6]瑞士乳杆菌调控小鼠肠道菌群变化规律的研究[J]. 臧凯丽,贾彦,崔文静,马新颖,王泳,赵林森,赵培,叶雷,阎亚丽,陈庆森. 食品科学. 2018(01)
[7]短链脂肪酸在疾病治疗中的研究进展[J]. 王璐璇,刘玥宏,朱继开,钟煜,李利生,徐敬东. 世界华人消化杂志. 2017(13)
[8]双歧杆菌四联活菌治疗非酒精性脂肪肝的疗效观察[J]. 张彩峰. 中西医结合心血管病电子杂志. 2017(13)
[9]大鼠肠道自发荧光微生物的分布[J]. 田树红,王日超,肖敏,符健. 中国实验动物学报. 2017(01)
[10]鹅肥肝形成中肠道生理指标、菌群及代谢物的变化[J]. 刘龙,龚晗,杨彪,夏丽丽,耿拓宇,龚道清. 扬州大学学报(农业与生命科学版). 2016(04)
博士论文
[1]Behcet病患者肠道微生物宏基因组学的研究[D]. 张旎.重庆医科大学 2018
[2]鹅肥肝形成过程中差异表达miRNA筛选及miRNA-33的表达调控研究[D]. 郑云.扬州大学 2017
[3]两核苷酸实时合成测序技术及其应用研究[D]. 浦丹.东南大学 2015
[4]青藏高原传统发酵牦牛奶中乳酸菌多样性及其益生功能研究[D]. 丁武蓉.兰州大学 2014
[5]应用焦磷酸测序技术对不同人群肠道微生物群落结构的研究[D]. 郭壮.江南大学 2013
[6]高通量基因组数据的处理、分析与建模[D]. 王丛茂.上海交通大学 2012
[7]四倍体鲫鲤BAC文库构建及其演化分析[D]. 陈禹保.湖南师范大学 2011
硕士论文
[1]奶牛肠道微生物群落结构与多样性研究[D]. 高凤.河北工程大学 2017
[2]脂联素受体对鹅肥肝的保护作用及其表达调控研究[D]. 杨彪.扬州大学 2016
本文编号：3500250
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