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细粒棘球绦虫TSP33基因的克

发布时间:2021-11-20 22:59
  旨在分析细粒棘球绦虫TSP33基因的结构及其在细粒棘球绦虫不同发育阶段的表达情况,预测其作为细粒棘球绦虫诊断抗原的潜在价值。从GenBank中获得Eg-TSP33的cDNA序列并设计特异性引物,提取原头蚴总RNA,反转录cDNA,以cDNA为模板进行PCR扩增,将PCR产物克隆到大肠埃希菌中,测序并进行生物信息学分析。TSP33cDNA全长864bp,编码277个氨基酸,Eg-TSP33的预测分子质量为32.11ku,预测等电点为8.62。RT-PCR结果显示,Eg-TSP33在细粒棘球绦虫成虫、包囊壁及原头蚴中均有表达,且在包囊壁中表达量较多。结果说明,Eg-TSP33可能在细粒棘球绦虫发育过程中可能具有重要作用,为Eg-TSP33分子的诊断价值研究奠定了基础。 

【文章来源】:动物医学进展. 2020,41(06)北大核心

【文章页数】:5 页

【部分图文】:

细粒棘球绦虫TSP33基因的克


Eg-TSP33基因的PCR扩增

阶段,蛋白,氨基酸,残基


Eg-TSP33全长由864个核苷酸组成,编码287个氨基酸,分子质量为32.1ku,等电点理论值为8.62,含有4537个原子,有23个带正电荷的氨基酸残基和17个带负电荷的氨基酸残基。该蛋白在液体中的不稳定系数为40.24(>40),为不稳定蛋白。Eg-TSP33亲水性疏水性平均值为0.665,为疏水蛋白。经分析,该蛋白为可溶性蛋白。2.4 Eg-TSP33二级结构和三级结构

二级结构,三级结构,预测分析,软件


使用软件SOPMA对Eg-TSP33进行二级结构预测(图3),结果显示,该蛋白α螺旋占56.79%,无规则卷曲占26.48%,延伸链占12.54%,β转角占4.18%。通过SWISS-MODEL软件对Eg-TSP33的三级结构进行预测分析,结果显示Eg-TSP33的三级结构如图4所示。图4 SWISS-MODEL预测Eg-TSP33三级结构

【参考文献】:
期刊论文
[1]多房棘球蚴四跨膜蛋白的生物信息学分析[J]. 杨宇,张耀刚,张灵强,任利,樊海宁.  中国病原生物学杂志. 2019(02)
[2]棘球蚴(包虫)病预防疫苗的研制与应用[J]. 张文宝,张壮志,郑雪婷,李军.  中国人兽共患病学报. 2018(09)
[3]四跨膜蛋白超家族Tetraspanins在肿瘤及纤维化疾病中的作用概况[J]. 李春艳,高胜兰,刘刚.  现代医院. 2018(03)
[4]细粒棘球绦虫原头蚴蛋白表达谱分析[J]. 王正荣,薄新文,张艳艳,马勋,王智欣,卢平萍.  畜牧兽医学报. 2017(08)



本文编号:3508252

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