羊口疮病毒强弱毒株免疫相关基因的比较分析

发布时间：2021-11-21 11:22

　　通过对采集到的青岛市某发病羊场羊口疮病料（强毒）在山羊成纤维细胞上连续传90代（弱毒）后,分别进行病毒基因组提取,并对提取到的基因组分别命名为ORFV-QD和ORFV-RD。根据GenBank上发表的ORFV全基因组序列设计并合成3对特异性引物,分别扩增ORFV-QD和ORFVRD的B2L基因、F1L基因和VIR基因片段,并将扩增得到的基因组片段分别克隆到pMD-19T载体上,转化到DH5α感受态细胞中,对重组质粒进行鉴定后送至测序公司进行测序,用DNASTAR软件对测序结果进行拼接及3组基因之间核苷酸同源性比较分析,将测序结果与NCBI上已公布的13组ORFV全基因组相应基因核苷酸序列进行同源性比对分析、构建系统进化树及氨基酸序列比对分析。结果表明,3组基因与参考序列的B2L基因、F1L基因和VIR基因核苷酸同源性分别为92.1%～98.4%、96.1%～99.1%和94.6%～100%。将2株病毒基因组与参考序列进行氨基酸序列比较分析,结果显示2株病毒基因组之间并没有较为明显的差异。 

【文章来源】：畜牧与饲料科学. 2020,41(05)

【文章页数】：11 页

【部分图文】：

B2L基因PCR扩增结果

用上述设计的F1L基因引物，采用PCR方法从ORFV-QD毒株中扩增出1条1 029 bp的目的条带，从ORFV-RD毒株中扩增出1条1 012 bp的目的条带，分别命名为ORFV-QD-F1L和OR-FV-RD-F1L。凝胶电泳结果如图2所示。2.3 VIR基因的PCR扩增

在对基因片段的序列测序结果进行分析后，可知B2L基因大小为1 137 bp，可编码379个氨基酸残基。F1L基因大小为1 012 bp，可编码338个氨基酸残基。VIR基因大小为552 bp，可编码184个氨基酸残基。利用DNASTAR软件对测序获得的基因片段序列与Gen Bank中发布的13组ORFV序列（见表4）进行同源性比对分析。ORFV-QD-B2L与参考毒株同源性为93.9%～98.4%,ORFV-RD-B2L与参考毒株同源性为92.1%～96.6%（见图7);ORFV-QD-F1L与参考毒株同源性为96.1%～99.1%,ORFV-RD-F1L与参考毒株同源性为96.3%～97.8%（见图8);ORFV-QD-VIR与参考毒株同源性为94.6%～100%,ORFV-RD-VIR与参考毒株同源性则为94.4%～99.3%（见图9）。图5 F1L基因PCR鉴定结果

【参考文献】：
期刊论文
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硕士论文
[1]羊口疮病毒生物学特性研究[D]. 涂明亮.内蒙古农业大学 2016
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[3]羊口疮病毒的分离鉴定及B2L囊膜蛋白单克隆抗体的制备[D]. 谭强.黑龙江八一农垦大学 2014



本文编号：3509420