杭州地区猫杯状病毒的分离鉴定及VP1基因序列分析

发布时间：2021-11-24 09:21

　　猫杯状病毒（feline calicivims, FCV）是引起猫呼吸道疾病的一种常见病原,呈世界性分布,常在猫群中爆发流行。为了解我国FCV的流行情况及分子生态学特征,本研究对杭州地区收集的48份疑似FCV感染病料,进行了PCR鉴定、病毒分离培养,以及基于VP1基因序列的系统发育树分析。RT-PCR鉴定的结果显示,有32份病料可判为阳性;这32份病料接种的F81细胞,均出现明显的细胞病变。VP1基因序列分析显示,32株分离毒间的核苷酸同源性为69.2%～99%,氨基酸同源性为82.1%～99.9%。与国外分离株相比,32株分离株同国内分离株的同源性更高。系统发育树分析显示,32株分离株有12株与国内分离株遗传关系较近,15株与英国株遗传关系较近,别外4株与多国分离株形成独立分支。对VP1 D-E区的B细胞线性表位分析发现,D区和conE区的2个表位比较保守,而5′HRV区的表位存在较大变异。尽管32个毒株分离于同一地区和相近的时间段,主要抗原VP1基因差异仍然较大,多数达20%～30%不等。以上结果表明,FCV在杭州地区广泛流行,且呈现明显的遗传多样性,给病毒的分子流行病学监测和疫苗... 

【文章来源】：畜牧与兽医. 2020,52(04)北大核心

【文章页数】：7 页

【部分图文】：

部分FCV的RT-PCR鉴定结果

取分离得到的32株疑似FCV病毒液,提取RNA后反转录得cDNA,用VP1特异性引物扩增,产物进行凝胶电泳后得到约2 000 bp大小的特异性条带,与预期2 007 bp大小相符,部分结果见图3。扩增产物的测序结果与NCBI数据库中FCV的VP1基因核苷酸序列相似度为69.2%～82.2%,表明32株分离毒确为FCV病毒,并依次命名为DF001-DF032。图3 部分FCV VP1基因的PCR扩增产物电泳图

部分FCV VP1基因的PCR扩增产物电泳图

【参考文献】：
期刊论文
[1]猫杯状病毒不同分离株免疫原性的比较[J]. 王一鸣,赵艳丽,赵立峰,应瑛,王开,胡桂学,杨松涛.  吉林农业大学学报. 2015(05)
[2]猫杯状病毒基因及其抗原多样性研究进展[J]. 赵艳丽,董宏伟,陈小庆,姜雪,刘秋艳,胡桂学.  中国预防兽医学报. 2014(03)
[3]ICTV第八次报告的最新病毒分类系统[J]. 洪健,周雪平.  Virologica Sinica. 2006(01)



本文编号：3515688