基于转录组对Alternaria oxytropis中苦马豆素合成相关基因的筛选与分析
发布时间:2021-11-25 12:30
小花棘豆是世界草原危害较大的毒草之一,它可产生一种有毒的吲哚里西啶类次生代谢产物-苦马豆素(swainsonine,SW)。SW能抑制动物细胞α-甘露糖苷酶Ⅰ和高尔基体α-甘露糖苷酶Ⅱ的活性,使细胞空泡变性,失去正常功能,中毒严重者甚至会死亡。在医学领域,SW一直被作为研究糖蛋白N-寡糖合成的工具药,上世纪80年代时又发现其具有良好的免疫调节和抗肿瘤作用,成为关注热点。课题组前期研究发现SW由小花棘豆内生真菌Alternaria oxytropis合成,而酵母氨酸还原酶(酵母氨酸脱氢酶)在真菌SW合成中具有重要作用。利用同源重组技术敲除该内生真菌的酵母氨酸还原酶基因(sac),获得缺失突变株M1,发现其SW水平降低。鉴于Alternaria oxytropis内生真菌SW合成途径中很多细节未知,故本研究对该内生真菌的野生株OW7.8和突变株M1进行了高通量转录组测序(RNA-Seq),基于测序结果我们筛选了与SW生物合成相关的Unigene,对所选Unigene的表达模式进行了qRT-PCR检测分析,继而从候选基因中选择可能与SW合成的关键基因进行克隆,为研究内生真菌中SW的合成途径及...
【文章来源】:内蒙古师范大学内蒙古自治区
【文章页数】:82 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
疯草内生真菌苦马豆素的部分合成代谢途径推测[38]
图 1-4 稻瘟病菌、棘豆链格孢的“SWN”基因簇的结构和基因簇在支架(超级聚合体)或重叠群上的位置[54]Figure1-4 Structure of the "SWN" gene cluster and the location of the gene cluster on thescaffold (superpolymer) or contig indicated are in Magnaporthe and A. oxytropis[54]
图 1-5 稻瘟病菌中苦马豆素生物合成途径推测[54]Figure1-5 Speculated swainsonine metabolic pathway in Magnaporthe[54]3 转录组测序的研究进展
【参考文献】:
期刊论文
[1]真菌中苦马豆素生物合成途径的研究进展[J]. 李欣,卢萍. 生命的化学. 2018(06)
[2]不同添加物对小花棘豆内生真菌酵母氨酸还原酶基因缺失突变株M1合成苦马豆素的影响[J]. 萨如拉,席领军,卢萍,高峰,杜玲. 生命科学研究. 2018(04)
[3]α-甘露糖苷酶的研究进展[J]. 王铎,张美萍,王义. 生命科学. 2018(06)
[4]光照和培养基对内生真菌棘豆链格孢Alternaria oxytropis苦马豆素含量的影响[J]. 李欣,卢萍,吕桂芬,袁博. 菌物学报. 2018(05)
[5]小花棘豆Embellisia内生真菌原生质体的制备与再生研究[J]. 呼吉雅,卢萍,牛艳芳. 生物技术通报. 2015(05)
[6]不同因素对疯草内生真菌合成苦马豆素的影响[J]. 张蕾蕾,余永涛,何生虎,赵清梅,葛松. 畜牧兽医学报. 2015(01)
[7]豆科植物疯草中内生真菌及其作用[J]. 崔振,李彦忠. 草业科学. 2014(09)
[8]中国西部天然草地疯草生态及动物疯草中毒研究与防控现状[J]. 周启武,赵宝玉,路浩,王姗姗,张樑,温伟利,杨晓雯. 中国农业科学. 2013(06)
[9]小花棘豆(Oxytropis glabra)内生真菌固体培养条件优化研究[J]. 何珊,卢萍,包睿媛. 内蒙古师范大学学报(自然科学汉文版). 2012(01)
[10]疯草研究进展[J]. 余永涛,王建华. 农业科学研究. 2011(02)
博士论文
[1]疯草内生真菌合成苦马豆素的研究[D]. 杨国栋.西北农林科技大学 2012
硕士论文
[1]小花棘豆Alternaria oxytropis内生真菌苦马豆素合成代谢中酵母氨酸还原酶基因的影响[D]. 萨如拉.内蒙古师范大学 2018
[2]疯草棘豆蠕孢菌哌可酸氧化酶基因突变菌株的构建[D]. 任祯慧.西北农林科技大学 2018
[3]酵母氨酸还原酶基因对小花棘豆内生真菌苦马豆素合成代谢的影响[D]. 席领军.内蒙古师范大学 2017
[4]疯草棘豆蠕孢菌吡咯啉5-羧化-还原酶基因敲除菌株的构建[D]. 权海云.西北农林科技大学 2017
[5]基于RNA-Seq技术的Undifilum oxytropis中苦马豆素含量相关基因的分析[D]. 张峰华.西北农林科技大学 2017
[6]小花棘豆Embellisia内生真菌酵母氨酸还原酶基因对苦马豆素合成影响的研究[D]. 哈布拉.内蒙古师范大学 2016
[7]小花棘豆Embellisia内生真菌酵母氨酸还原酶基因缺失突变株的构建及筛选鉴定[D]. 呼吉雅.内蒙古师范大学 2015
[8]小花棘豆Embellisia内生真菌酵母氨酸还原酶基因的克隆及其缺失载体的构建[D]. 王思远.内蒙古师范大学 2014
本文编号:3518143
【文章来源】:内蒙古师范大学内蒙古自治区
【文章页数】:82 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
疯草内生真菌苦马豆素的部分合成代谢途径推测[38]
图 1-4 稻瘟病菌、棘豆链格孢的“SWN”基因簇的结构和基因簇在支架(超级聚合体)或重叠群上的位置[54]Figure1-4 Structure of the "SWN" gene cluster and the location of the gene cluster on thescaffold (superpolymer) or contig indicated are in Magnaporthe and A. oxytropis[54]
图 1-5 稻瘟病菌中苦马豆素生物合成途径推测[54]Figure1-5 Speculated swainsonine metabolic pathway in Magnaporthe[54]3 转录组测序的研究进展
【参考文献】:
期刊论文
[1]真菌中苦马豆素生物合成途径的研究进展[J]. 李欣,卢萍. 生命的化学. 2018(06)
[2]不同添加物对小花棘豆内生真菌酵母氨酸还原酶基因缺失突变株M1合成苦马豆素的影响[J]. 萨如拉,席领军,卢萍,高峰,杜玲. 生命科学研究. 2018(04)
[3]α-甘露糖苷酶的研究进展[J]. 王铎,张美萍,王义. 生命科学. 2018(06)
[4]光照和培养基对内生真菌棘豆链格孢Alternaria oxytropis苦马豆素含量的影响[J]. 李欣,卢萍,吕桂芬,袁博. 菌物学报. 2018(05)
[5]小花棘豆Embellisia内生真菌原生质体的制备与再生研究[J]. 呼吉雅,卢萍,牛艳芳. 生物技术通报. 2015(05)
[6]不同因素对疯草内生真菌合成苦马豆素的影响[J]. 张蕾蕾,余永涛,何生虎,赵清梅,葛松. 畜牧兽医学报. 2015(01)
[7]豆科植物疯草中内生真菌及其作用[J]. 崔振,李彦忠. 草业科学. 2014(09)
[8]中国西部天然草地疯草生态及动物疯草中毒研究与防控现状[J]. 周启武,赵宝玉,路浩,王姗姗,张樑,温伟利,杨晓雯. 中国农业科学. 2013(06)
[9]小花棘豆(Oxytropis glabra)内生真菌固体培养条件优化研究[J]. 何珊,卢萍,包睿媛. 内蒙古师范大学学报(自然科学汉文版). 2012(01)
[10]疯草研究进展[J]. 余永涛,王建华. 农业科学研究. 2011(02)
博士论文
[1]疯草内生真菌合成苦马豆素的研究[D]. 杨国栋.西北农林科技大学 2012
硕士论文
[1]小花棘豆Alternaria oxytropis内生真菌苦马豆素合成代谢中酵母氨酸还原酶基因的影响[D]. 萨如拉.内蒙古师范大学 2018
[2]疯草棘豆蠕孢菌哌可酸氧化酶基因突变菌株的构建[D]. 任祯慧.西北农林科技大学 2018
[3]酵母氨酸还原酶基因对小花棘豆内生真菌苦马豆素合成代谢的影响[D]. 席领军.内蒙古师范大学 2017
[4]疯草棘豆蠕孢菌吡咯啉5-羧化-还原酶基因敲除菌株的构建[D]. 权海云.西北农林科技大学 2017
[5]基于RNA-Seq技术的Undifilum oxytropis中苦马豆素含量相关基因的分析[D]. 张峰华.西北农林科技大学 2017
[6]小花棘豆Embellisia内生真菌酵母氨酸还原酶基因对苦马豆素合成影响的研究[D]. 哈布拉.内蒙古师范大学 2016
[7]小花棘豆Embellisia内生真菌酵母氨酸还原酶基因缺失突变株的构建及筛选鉴定[D]. 呼吉雅.内蒙古师范大学 2015
[8]小花棘豆Embellisia内生真菌酵母氨酸还原酶基因的克隆及其缺失载体的构建[D]. 王思远.内蒙古师范大学 2014
本文编号:3518143
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