2017-2019年山东省部分地区猪瘟流行病学调查
发布时间:2021-11-28 07:15
为掌握近年来山东地区猪瘟病毒(CSFV)的流行及其遗传变异情况,本研究对2017年1月-2019年12月从山东省济南市、泰安市、聊城市、青岛市等10个地区采集的1 687份疑似猪瘟感染猪病料运用反转录PCR方法进行了病毒核酸检测,将CSFV检测为阳性的样品进行E2基因和CSFV全基因扩增和测序,利用生物信息学软件DNAStar和Mega 7.0对CSFV的E2蛋白以及全基因序列进行遗传进化分析。另外,将这些地区采集的4 866份血清样本进行了抗体ELISA检测。结果显示,1 687份病料中病原检测有188份阳性,总阳性率为11.1%,其中2017-2019年病原检测阳性率分别为8.5%、13.1%、15.1%,抗原阳性率逐年上升且呈不稳定性,提示规模化猪场猪瘟兔化弱毒疫苗的免疫存在一定的风险和压力;采集的4 866份血清样本中4 146份呈现抗体阳性(85.2%),统计得到2017-2019年抗体阳性率分别为84.3%、83.0%、92.3%,抗体阳性率呈现上升趋势,说明山东省规模化养殖场猪群猪瘟疫苗免疫保护的整体水平逐年提高;从阳性病料中扩增获得了5株CSFV全基因组序列和5株病毒E...
【文章来源】:中国畜牧兽医. 2020,47(06)北大核心
【文章页数】:12 页
【部分图文】:
2017-2019年每季度抗体阳性率
通过反转录PCR分段扩增,获得1~11段基因片段大小依次为1 090、1 533、1 304、1 525、1 114、1 255、1 399、1 293、1 377、1 324、922 bp(图4),与预期相符。将11个不同基因片段测序结果拼接,获得5株分离株的全部序列,分别命名为SDQD-19、SDSH-19、SDLC-19、SDLL-19、SDNJ-19,并将5株分离毒株分别连接pMDTM18-T载体后随机挑选2~3个阳性克隆进行测序。2.4 CSFV 全基因组序列的同源性比对
对各分离毒株间及其与GenBank中登录的28株CSFV参考毒株进行同源性比对发现,5株测序毒株之间的核苷酸同源性为98.8%~99.5%;5株分离毒株与参考毒株的同源性在83.0%~99.0%之间,其中与2.1d亚型的CSFV全基因组序列的同源性最高,在97.5%~99.0%之间(图5)。2.5 CSFV E2蛋白氨基酸同源性比对
【参考文献】:
期刊论文
[1]新型猪瘟疫苗的研究进展[J]. 任鹏举,李鹏,张秋雨,王亚平,武乐祎,王选年. 中国畜牧兽医. 2018(07)
[2]猪瘟免疫失败的原因及其防制对策[J]. 王美君,侯艳红,倪娇,焦连国,孙雨,赵亚荣. 中国畜牧兽医. 2011(02)
[3]1株山东猪瘟病毒流行毒株全基因组的克隆与序列分析[J]. 吴旭锦,朱小甫,朱辉. 西北农林科技大学学报(自然科学版). 2009(11)
[4]猪瘟病毒流行病学、病原致病特性及猪瘟综合防制研究[J]. 王琴. 中国农业科技导报. 2006(05)
本文编号:3523961
【文章来源】:中国畜牧兽医. 2020,47(06)北大核心
【文章页数】:12 页
【部分图文】:
2017-2019年每季度抗体阳性率
通过反转录PCR分段扩增,获得1~11段基因片段大小依次为1 090、1 533、1 304、1 525、1 114、1 255、1 399、1 293、1 377、1 324、922 bp(图4),与预期相符。将11个不同基因片段测序结果拼接,获得5株分离株的全部序列,分别命名为SDQD-19、SDSH-19、SDLC-19、SDLL-19、SDNJ-19,并将5株分离毒株分别连接pMDTM18-T载体后随机挑选2~3个阳性克隆进行测序。2.4 CSFV 全基因组序列的同源性比对
对各分离毒株间及其与GenBank中登录的28株CSFV参考毒株进行同源性比对发现,5株测序毒株之间的核苷酸同源性为98.8%~99.5%;5株分离毒株与参考毒株的同源性在83.0%~99.0%之间,其中与2.1d亚型的CSFV全基因组序列的同源性最高,在97.5%~99.0%之间(图5)。2.5 CSFV E2蛋白氨基酸同源性比对
【参考文献】:
期刊论文
[1]新型猪瘟疫苗的研究进展[J]. 任鹏举,李鹏,张秋雨,王亚平,武乐祎,王选年. 中国畜牧兽医. 2018(07)
[2]猪瘟免疫失败的原因及其防制对策[J]. 王美君,侯艳红,倪娇,焦连国,孙雨,赵亚荣. 中国畜牧兽医. 2011(02)
[3]1株山东猪瘟病毒流行毒株全基因组的克隆与序列分析[J]. 吴旭锦,朱小甫,朱辉. 西北农林科技大学学报(自然科学版). 2009(11)
[4]猪瘟病毒流行病学、病原致病特性及猪瘟综合防制研究[J]. 王琴. 中国农业科技导报. 2006(05)
本文编号:3523961
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