四环素胁迫下小鼠肠道微生物群落变化及代谢毒理效应研究
发布时间:2021-12-09 10:55
抗生素广泛应用于人类和动物疾病预防和治疗中。此外,抗生素作为生长促进剂广泛运用于畜牧养殖业,提高饲料利用率,促进畜禽生长。抗生素的使用对肠道微生物群落产生巨大影响,而这些肠道微生物群落结构和功能对畜禽健康、生长起着重要作用。尽管抗生素的使用给畜牧业带来明显的效益,但其引发的耐药基因的增加和水平转移,对人类健康和生态安全构成了潜在威胁。本文研究旨在探讨盐酸四环素(tetracycline hydrochloride, TET)对小鼠代谢毒性以及肠道微生物结构与功能的影响,并评估其影响肠道微生物耐药性潜在风险。肝脏组织切片显示TET暴露诱发小鼠肝脏组织严重病变,且呈现显著剂量效应;停止暴露后中高浓度组肝脏组织病变难以彻底恢复。基于氢质谱核磁共振(’Hnuclear magnetic resonance spectroscopy,1H-NMR)的代谢组学实验及偏最小二乘判别法(partial least squares discriminant analysis, PLS-DA)分析结果显示不同剂量TET暴露均影响小鼠血清和尿液代谢,染毒组血清和尿液中众多代谢物质与对照组存在显著性差异,这些...
【文章来源】:南京大学江苏省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:96 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
Abstract
第1章 绪论
1.1 研究背景
1.1.1 抗生素应用与污染现状及潜在风险
1.1.2 毒理代谢组学研究进展
1.1.3 肠道微生物学研究进展
1.1.4 宏基因组学和高通量测序技术研究进展
1.2 选题依据与研究目的
1.3 研究内容和技术路线
参考文献
第2章 盐酸四环素暴露对小鼠代谢的影响
2.1 引言
2.2 材料和方法
2.2.1 小鼠暴露处理和样品收集
2.2.2 小鼠肝脏组织切片实验
2.2.3 小鼠尿液和血清代谢分析预处理
2.2.4 小鼠尿液和血清1~H-NMR代谢分析
2.3 试验结果
2.3.1 盐酸四环素暴露对小鼠表型和肝脏病理学的影响
2.3.2 盐酸四环素暴露对小鼠血清代谢的影响
2.3.3 盐酸四环素暴露对小鼠尿液代谢的影响
2.4 本章小结
参考文献
第3章 盐酸四环素暴露对小鼠胃肠道抗生素耐药的影响
3.1 引言
3.2 材料和方法
3.2.1 小鼠暴露处理和样品收集
3.2.2 小鼠胃肠道微生物总DNA提取
3.2.3 耐药基因PCR和qPCR
3.2.4 Illumina高通量测序及质量控制
3.2.5 耐药基因blast比对分析
3.2.6 可移动元件blast比对分析
3.3 结果与讨论
3.3.1 盐酸四环素暴露对小鼠胃肠道耐药基因丰度和多样性的影响
3.3.2 盐酸四环素暴露对小鼠胃肠道可移动元件的多样性和丰度的影响
3.4 本章小结
参考文献
第4章 盐酸四环素暴露对小鼠胃肠道菌群结构与功能的影响
4.1 引言
4.2 材料和方法
4.2.1 小鼠暴露处理和样品收集
4.2.2 小鼠胃肠道微生物总DNA提取
4.2.3 454-焦磷酸测序及质量控制
4.2.4 胃肠道微生物群落结构多样性分析
4.2.5 Illumina高通量测序及质量控制
4.2.6 COG功能数据库构建及微生物功能分析
4.3 结果与讨论
4.3.1 盐酸四环素暴露对小鼠胃肠道菌群结构的影响
4.3.2 盐酸四环素暴露对小鼠胃肠道菌群功能的影响
4.3.3 小鼠肠道菌群结构和功能与肝脏组织病变和尿液、血清代谢相关性结果
4.3.4 小鼠肠道菌群结构和功能与耐药基因相关性结果
4.4 本章小结
参考文献
第5章 结论与展望
5.1 结论
5.2 研究展望
第6章 创新点
项目支持
成果清单
致谢
【参考文献】:
期刊论文
[1]抗生素滥用的现状及解决对策[J]. 李成英,潘凌燕. 北方药学. 2013(06)
[2]454测序技术在微生物生态学研究中的应用[J]. 段曌,肖炜,王永霞,赖泳红,崔晓龙. 微生物学杂志. 2011(05)
[3]肝病患者精氨酸代琥珀酸裂解酶分泌及与肝病相关血清学指标的关系[J]. 唐晚若,陈江,朱益斌,杨国英. 中外医学研究. 2011(24)
[4]宏基因组技术及其应用研究进展[J]. 宋培勇,马莉莉,王庆容,李黛,魏志琴. 贵州农业科学. 2009(10)
[5]畜禽养殖中抗生素使用的现状、问题及对策[J]. 李振,王云建. 中国动物保健. 2009(07)
[6]抗生素抗性基因(ARGs)——一种新型环境污染物[J]. 罗义,周启星. 环境科学学报. 2008(08)
[7]宏基因组学(Metagenomics)的研究现状和发展趋势[J]. 贺纪正,张丽梅,沈菊培,朱永官. 环境科学学报. 2008(02)
[8]兽用抗生素在土壤环境中的行为及其生态毒理效应研究进展[J]. 李兆君,姚志鹏,张杰,梁永超. 生态毒理学报. 2008(01)
[9]环境中抗生素残留潜在风险及其研究进展[J]. 王冰,孙成,胡冠九. 环境科学与技术. 2007(03)
[10]土壤宏基因组学技术及其应用[J]. 沈菊培,张丽梅,郑袁明,朱永官,贺纪正. 应用生态学报. 2007(01)
本文编号:3530516
【文章来源】:南京大学江苏省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:96 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
Abstract
第1章 绪论
1.1 研究背景
1.1.1 抗生素应用与污染现状及潜在风险
1.1.2 毒理代谢组学研究进展
1.1.3 肠道微生物学研究进展
1.1.4 宏基因组学和高通量测序技术研究进展
1.2 选题依据与研究目的
1.3 研究内容和技术路线
参考文献
第2章 盐酸四环素暴露对小鼠代谢的影响
2.1 引言
2.2 材料和方法
2.2.1 小鼠暴露处理和样品收集
2.2.2 小鼠肝脏组织切片实验
2.2.3 小鼠尿液和血清代谢分析预处理
2.2.4 小鼠尿液和血清1~H-NMR代谢分析
2.3 试验结果
2.3.1 盐酸四环素暴露对小鼠表型和肝脏病理学的影响
2.3.2 盐酸四环素暴露对小鼠血清代谢的影响
2.3.3 盐酸四环素暴露对小鼠尿液代谢的影响
2.4 本章小结
参考文献
第3章 盐酸四环素暴露对小鼠胃肠道抗生素耐药的影响
3.1 引言
3.2 材料和方法
3.2.1 小鼠暴露处理和样品收集
3.2.2 小鼠胃肠道微生物总DNA提取
3.2.3 耐药基因PCR和qPCR
3.2.4 Illumina高通量测序及质量控制
3.2.5 耐药基因blast比对分析
3.2.6 可移动元件blast比对分析
3.3 结果与讨论
3.3.1 盐酸四环素暴露对小鼠胃肠道耐药基因丰度和多样性的影响
3.3.2 盐酸四环素暴露对小鼠胃肠道可移动元件的多样性和丰度的影响
3.4 本章小结
参考文献
第4章 盐酸四环素暴露对小鼠胃肠道菌群结构与功能的影响
4.1 引言
4.2 材料和方法
4.2.1 小鼠暴露处理和样品收集
4.2.2 小鼠胃肠道微生物总DNA提取
4.2.3 454-焦磷酸测序及质量控制
4.2.4 胃肠道微生物群落结构多样性分析
4.2.5 Illumina高通量测序及质量控制
4.2.6 COG功能数据库构建及微生物功能分析
4.3 结果与讨论
4.3.1 盐酸四环素暴露对小鼠胃肠道菌群结构的影响
4.3.2 盐酸四环素暴露对小鼠胃肠道菌群功能的影响
4.3.3 小鼠肠道菌群结构和功能与肝脏组织病变和尿液、血清代谢相关性结果
4.3.4 小鼠肠道菌群结构和功能与耐药基因相关性结果
4.4 本章小结
参考文献
第5章 结论与展望
5.1 结论
5.2 研究展望
第6章 创新点
项目支持
成果清单
致谢
【参考文献】:
期刊论文
[1]抗生素滥用的现状及解决对策[J]. 李成英,潘凌燕. 北方药学. 2013(06)
[2]454测序技术在微生物生态学研究中的应用[J]. 段曌,肖炜,王永霞,赖泳红,崔晓龙. 微生物学杂志. 2011(05)
[3]肝病患者精氨酸代琥珀酸裂解酶分泌及与肝病相关血清学指标的关系[J]. 唐晚若,陈江,朱益斌,杨国英. 中外医学研究. 2011(24)
[4]宏基因组技术及其应用研究进展[J]. 宋培勇,马莉莉,王庆容,李黛,魏志琴. 贵州农业科学. 2009(10)
[5]畜禽养殖中抗生素使用的现状、问题及对策[J]. 李振,王云建. 中国动物保健. 2009(07)
[6]抗生素抗性基因(ARGs)——一种新型环境污染物[J]. 罗义,周启星. 环境科学学报. 2008(08)
[7]宏基因组学(Metagenomics)的研究现状和发展趋势[J]. 贺纪正,张丽梅,沈菊培,朱永官. 环境科学学报. 2008(02)
[8]兽用抗生素在土壤环境中的行为及其生态毒理效应研究进展[J]. 李兆君,姚志鹏,张杰,梁永超. 生态毒理学报. 2008(01)
[9]环境中抗生素残留潜在风险及其研究进展[J]. 王冰,孙成,胡冠九. 环境科学与技术. 2007(03)
[10]土壤宏基因组学技术及其应用[J]. 沈菊培,张丽梅,郑袁明,朱永官,贺纪正. 应用生态学报. 2007(01)
本文编号:3530516
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