硬蜱科四种蜱核糖体全基因组分析
发布时间：2021-12-09 12:31
蜱是一种吸血的外寄生虫,常寄生于家畜和人的体表。作为媒介昆虫,是仅次于蚊的第二大传播媒介。它能携带病原体在宿主之间传播,其中大多数是重要的人兽共患病原。蜱主要分为硬蜱科,软蜱科和纳蜱科,其中最常见且对人和家畜危害性最大的是硬蜱科。核糖体在细胞中广泛存在,核酸拷贝数较高,核糖体是分子分类方法的主要标记基因。因此,本研究对在东北地区人畜危害严重的四种硬蜱即森林革蜱、日本血蜱、全沟硬蜱和长角血蜱的核糖体基因组序列进行扩增及分析,为四种硬蜱的分子分类研究提供可靠依据。首先在东北地区采集各种蜱,对每只蜱进行形态学和分子生学鉴定;然后随机选择采至黑龙江省的森林革蜱、日本血蜱和全沟硬蜱各5只,同时选择吉林省和辽宁省的长角血蜱各5只,总计25只硬蜱进行核糖体序列的扩增;进一步对获得的序列进行拼接组装,并比较序列长度,组成及结构特点;最后进行同源性和进化分析。结果表明,首次获得了森林革蜱、日本血蜱、全沟硬蜱和长角血蜱四种25条硬蜱核糖体全基因组序列,长度为862911346 bp。不同种类蜱18S、28S和5.8S长度相近或相同,而ITS1和ITS2长度均能表现种属的特异性;IGS...
【文章来源】： 黑龙江八一农垦大学黑龙江省
【文章页数】：83 页
【文章目录】：
摘要
Abstract
1 文献综述
1.1 东北地区重要的硬蜱
1.1.1 森林革蜱
1.1.2 日本血蜱
1.1.3 全沟硬蜱
1.1.4 长角血蜱
1.2 蜱核糖体全基因组研究进展
1.2.1 蜱核糖体18S研究进展
1.2.2 蜱核糖体ITS1 研究进展
1.2.3 蜱核糖体5.8S研究进展
1.2.4 蜱核糖体ITS2 研究进展
1.2.5 蜱核糖体28S研究进展
1.2.6 蜱核糖体IGS研究进展
1.3 目的和意义
2 材料方法
2.1 材料
2.1.1 蜱虫样品
2.1.2 引物设计
2.1.3 主要试剂、仪器及应用软件
2.2 方法
2.2.1 采集蜱的方法
2.2.2 蜱的形态学鉴定
2.2.3 总DNA的提取
2.2.4 各蜱核糖体基因扩增
2.2.5 序列分析
2.2.6 同源性分析
2.2.7 序列分析
3 结果
3.1 蜱的形态学鉴定结果
3.2 核糖体各部分PCR扩增结果
3.2.1 18S PCR扩增结果
3.2.2 ITS1 PCR扩增结果
3.2.3 ITS2 PCR扩增结果
3.2.4 28S-1 PCR扩增结果
3.2.5 28S-2 PCR扩增结果
3.2.6 28S-3 PCR扩增结果
3.2.7 IGS PCR扩增结果
3.3 四种蜱核糖体全基因组分析
3.3.1 硬蜱科四种蜱核糖体长度分析
3.3.2 硬蜱科四种蜱核糖体A+T含量分析
3.3.3 硬蜱科四种蜱核糖体碱基突变和缺失
3.3.4 硬蜱科四种蜱核糖体种内差异分析
3.3.5 硬蜱科四种蜱核糖体种间差异分析
3.3.6 硬蜱科四种蜱核糖体IGS的侧翼与重复序列分析
3.4 同源性分析
3.4.1 硬蜱科四种蜱核糖体18S同源性分析
3.4.2 硬蜱科四种蜱核糖体ITS1 同源性分析
3.4.3 硬蜱科四种蜱核糖体5.8S同源性分析
3.4.4 硬蜱科四种蜱核糖体ITS2 同源性分析
3.4.5 硬蜱科四种蜱核糖体28S同源性分析
3.4.6 硬蜱科四种蜱核糖体IGS同源性分析
3.4.7 硬蜱科四种蜱核糖体全基因组同源性分析
3.5 进化分析
4 讨论
4.1 硬蜱科四种蜱的鉴定要点
4.2 硬蜱科四种蜱核糖体全基因组的结构特征
4.3 同源性分析
4.4 基于核糖体18S、ITS1、5.8S、ITS2、28S和 IGS的进化树
5 结论
参考文献
致谢
个人简历
【参考文献】：
期刊论文
[1]DNA条形码技术在鉴定绥芬河口岸日本血蜱和嗜群血蜱中的应用 [J]. 王艳梅,程成,鞠文东,徐宁,耿聪,韩茜宇,刘岩,焦丹,黄洋. 口岸卫生控制. 2019(03)
[2]Internal transcribed spacer guided multiplex PCR for species identification of Convolvulus prostratus and Evolvulus alsinoides [J]. Sonal Sharma,Neeta Shrivastava. Acta Pharmaceutica Sinica B. 2016(03)
[3]牡丹江镜泊湖区蜱中伯氏疏螺旋体与嗜吞噬细胞无形体感染的研究 [J]. 韩华,石华,王玥,史慧勤,张亚明,张文佳,高晓丽,杨振洲. 中华卫生杀虫药械. 2015(02)
[4]天津市蜱及蜱媒病原体的初步调查 [J]. 吴彤宇,王伟,陈树斌,秦娜,张静,李培羽,李今越. 中国媒介生物学及控制杂志. 2013(03)
[5]硬蜱的危害及防治 [J]. 谭善杰. 山东畜牧兽医. 2011(04)
[6]全沟硬蜱及相关疾病 [J]. 秦少青. 畜牧兽医科技信息. 2010(10)
[7]黑龙江中俄边境口岸全沟硬蜱中分离到人巴贝西原虫 [J]. 付维明,何浩,呼满霞,崔永民,杨丽炜. 中国国境卫生检疫杂志. 2010(02)
[8]用随机扩增多态DNA(RAPD)区分青海血蜱与日本血蜱 [J]. 常德辉,杨银书,陶冶,赵红斌,第五进学,张继军. 中国媒介生物学及控制杂志. 2005(03)
[9]北京东灵山地区鼠类体外寄生蜱类群落的研究 [J]. 郭天宇,许荣满,野京成,史秀丽. 中国媒介生物学及控制杂志. 2001(04)
[10]全沟硬蜱复组及其媒介作用 [J]. 周洪福,许菊,陈明中. 中国媒介生物学及控制杂志. 2001(02)
硕士论文
[1]中朝边境地区蜱种及蜱传立克次体的调查研究[D]. 关浩.沈阳农业大学. 2019
[2]陕西省部分地区蜱源人兽共患无形体与立克次体的遗传多样性[D]. 王一涵.西北农林科技大学. 2019
[3]我国两种新发立克次体经媒介蜱垂直传播规律的研究[D]. 袁婷婷.安徽医科大学. 2019
[4]完达山林区蜱分布及携带病原情况调查[D]. 付雪.黑龙江八一农垦大学. 2017
[5]吉林省和黑龙江省蜱种分布及3种重要蜱传微生物分子流行病学调查[D]. 刘欢欢.吉林农业大学. 2017
[6]长角血蜱的野外生态学研究[D]. 郑洪远.河北师范大学. 2009
[7]5.8S rDNA和ITS序列同源性分析在酸马奶酵母菌分子生物学鉴定中的应用[D]. 苟荣.新疆农业大学. 2008
本文编号：3530636
【文章来源】： 黑龙江八一农垦大学黑龙江省
【文章页数】：83 页
【文章目录】：
摘要
Abstract
1 文献综述
1.1 东北地区重要的硬蜱
1.1.1 森林革蜱
1.1.2 日本血蜱
1.1.3 全沟硬蜱
1.1.4 长角血蜱
1.2 蜱核糖体全基因组研究进展
1.2.1 蜱核糖体18S研究进展
1.2.2 蜱核糖体ITS1 研究进展
1.2.3 蜱核糖体5.8S研究进展
1.2.4 蜱核糖体ITS2 研究进展
1.2.5 蜱核糖体28S研究进展
1.2.6 蜱核糖体IGS研究进展
1.3 目的和意义
2 材料方法
2.1 材料
2.1.1 蜱虫样品
2.1.2 引物设计
2.1.3 主要试剂、仪器及应用软件
2.2 方法
2.2.1 采集蜱的方法
2.2.2 蜱的形态学鉴定
2.2.3 总DNA的提取
2.2.4 各蜱核糖体基因扩增
2.2.5 序列分析
2.2.6 同源性分析
2.2.7 序列分析
3 结果
3.1 蜱的形态学鉴定结果
3.2 核糖体各部分PCR扩增结果
3.2.1 18S PCR扩增结果
3.2.2 ITS1 PCR扩增结果
3.2.3 ITS2 PCR扩增结果
3.2.4 28S-1 PCR扩增结果
3.2.5 28S-2 PCR扩增结果
3.2.6 28S-3 PCR扩增结果
3.2.7 IGS PCR扩增结果
3.3 四种蜱核糖体全基因组分析
3.3.1 硬蜱科四种蜱核糖体长度分析
3.3.2 硬蜱科四种蜱核糖体A+T含量分析
3.3.3 硬蜱科四种蜱核糖体碱基突变和缺失
3.3.4 硬蜱科四种蜱核糖体种内差异分析
3.3.5 硬蜱科四种蜱核糖体种间差异分析
3.3.6 硬蜱科四种蜱核糖体IGS的侧翼与重复序列分析
3.4 同源性分析
3.4.1 硬蜱科四种蜱核糖体18S同源性分析
3.4.2 硬蜱科四种蜱核糖体ITS1 同源性分析
3.4.3 硬蜱科四种蜱核糖体5.8S同源性分析
3.4.4 硬蜱科四种蜱核糖体ITS2 同源性分析
3.4.5 硬蜱科四种蜱核糖体28S同源性分析
3.4.6 硬蜱科四种蜱核糖体IGS同源性分析
3.4.7 硬蜱科四种蜱核糖体全基因组同源性分析
3.5 进化分析
4 讨论
4.1 硬蜱科四种蜱的鉴定要点
4.2 硬蜱科四种蜱核糖体全基因组的结构特征
4.3 同源性分析
4.4 基于核糖体18S、ITS1、5.8S、ITS2、28S和 IGS的进化树
5 结论
参考文献
致谢
个人简历
【参考文献】：
期刊论文
[1]DNA条形码技术在鉴定绥芬河口岸日本血蜱和嗜群血蜱中的应用 [J]. 王艳梅,程成,鞠文东,徐宁,耿聪,韩茜宇,刘岩,焦丹,黄洋. 口岸卫生控制. 2019(03)
[2]Internal transcribed spacer guided multiplex PCR for species identification of Convolvulus prostratus and Evolvulus alsinoides [J]. Sonal Sharma,Neeta Shrivastava. Acta Pharmaceutica Sinica B. 2016(03)
[3]牡丹江镜泊湖区蜱中伯氏疏螺旋体与嗜吞噬细胞无形体感染的研究 [J]. 韩华,石华,王玥,史慧勤,张亚明,张文佳,高晓丽,杨振洲. 中华卫生杀虫药械. 2015(02)
[4]天津市蜱及蜱媒病原体的初步调查 [J]. 吴彤宇,王伟,陈树斌,秦娜,张静,李培羽,李今越. 中国媒介生物学及控制杂志. 2013(03)
[5]硬蜱的危害及防治 [J]. 谭善杰. 山东畜牧兽医. 2011(04)
[6]全沟硬蜱及相关疾病 [J]. 秦少青. 畜牧兽医科技信息. 2010(10)
[7]黑龙江中俄边境口岸全沟硬蜱中分离到人巴贝西原虫 [J]. 付维明,何浩,呼满霞,崔永民,杨丽炜. 中国国境卫生检疫杂志. 2010(02)
[8]用随机扩增多态DNA(RAPD)区分青海血蜱与日本血蜱 [J]. 常德辉,杨银书,陶冶,赵红斌,第五进学,张继军. 中国媒介生物学及控制杂志. 2005(03)
[9]北京东灵山地区鼠类体外寄生蜱类群落的研究 [J]. 郭天宇,许荣满,野京成,史秀丽. 中国媒介生物学及控制杂志. 2001(04)
[10]全沟硬蜱复组及其媒介作用 [J]. 周洪福,许菊,陈明中. 中国媒介生物学及控制杂志. 2001(02)
硕士论文
[1]中朝边境地区蜱种及蜱传立克次体的调查研究[D]. 关浩.沈阳农业大学. 2019
[2]陕西省部分地区蜱源人兽共患无形体与立克次体的遗传多样性[D]. 王一涵.西北农林科技大学. 2019
[3]我国两种新发立克次体经媒介蜱垂直传播规律的研究[D]. 袁婷婷.安徽医科大学. 2019
[4]完达山林区蜱分布及携带病原情况调查[D]. 付雪.黑龙江八一农垦大学. 2017
[5]吉林省和黑龙江省蜱种分布及3种重要蜱传微生物分子流行病学调查[D]. 刘欢欢.吉林农业大学. 2017
[6]长角血蜱的野外生态学研究[D]. 郑洪远.河北师范大学. 2009
[7]5.8S rDNA和ITS序列同源性分析在酸马奶酵母菌分子生物学鉴定中的应用[D]. 苟荣.新疆农业大学. 2008
本文编号：3530636
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