鸡CTNNB1和pri-miR-458b SNPs与产蛋性状关联分析
发布时间：2021-12-17 12:48
产蛋性状是由复杂的基因网络调控的数量性状。鸡卵巢卵泡发育受多种基因调控,以CTNNB1为中心的Wnt信号通路和miRNA都可以参与调节卵巢卵泡发育。本课题组前期发现济宁百日鸡140日龄开产前后卵巢CTNNB1和miR-458b-5p差异表达,且表达趋势相反。并进一步研究发现miR-458b-5p通过靶向CTNNB1抑制体外培养的鸡等级卵泡颗粒细胞的增殖。本研究旨在探究鸡CTNNB1和pri-miR-458b的多态性及其与产蛋性状的关联,以济宁百日鸡为研究材料,通过混池测序寻找CTNNB1和pri-miR-458b的多态位点,再通过PCR产物直接测序的方法进行个体分型,将其与开产日龄、产蛋量进行关联分析,期望从中找到有价值的分子标记。主要研究结果如下:（1）CTNNB1基因5’调控区共检测出10个多态位点,低度多态位点有4个（-1295、-1249、-1154、-660,PIC<0.25）,其余位点均呈现中度多态（0.25<PIC<0.05）。pri-miR-458b共检测出30个多态位点,中度多态位点有6个（g.8954697、g.8954931、g.8954984、...
【文章来源】：山东农业大学山东省
【文章页数】：67 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
Wnt/β-Catenin信号通路示意图(MacDonaldetal.,2009)
山东农业大学硕士专业学位论文5鼠不育的结果一致(HernandezGiffordetal.,2009)。此外，通过Ctnnb1(Ex3)fl/fl和Ctnnb1fl/fl小鼠模型发现，FSH/cAMP信号通路激活颗粒细胞β-Catenin的转录，增强了FSH诱导的Cyp19的表达(Fanetal.,2010)。因此有可能一旦PI3K/AKT被FSH激活，使得β-Catenin能与SF1结合，启动下游靶基因Cyp19a1的转录，参与调节卵巢激素合成。图1-2PI3K/AKT与Wnt/β-Catenin信号通路相互作用(Boyeretal.,2010)Figure1-2InteractionsbetweenthePI3K/AKTandWnt/β-Cateninsignalingpathways(Boyeretal.,2010)1.2miRNA研究进展1.2.1miRNA发现及加工过程MicroRNAs(miRNAs)是一类长约22nt具有调控功能的非编码单链小RNA，由细胞内源产生的发卡（hairpin）结构转录本加工而来(Kim,2005)。最初miRNA是在线虫中发现的，1993年Lee等在线虫中发现了一种名为lin-4的基因，长22nt的lin-4并不编码蛋白，能够调节秀丽隐杆线虫细胞时序发育(Leeetal.,1993)。到2001年，人们发现了大量小RNA序列，将其统一命名为miRNA。随后的几年里，在各个物种中发现了大量的miRNA，从而开辟了一片全新而广阔的科学研究领域。动物miRNA是一类在进化上高度保守的基因。miRNA分布于基因组的各个位置，其中约有40%的miRNA位于编码基因的内含子区域，与宿主基因共享启动子和调控元件(Bartel,2004)。miRNA的加工成熟是一个复杂精密的过程，需要多种酶和辅助蛋白协调完成(Kim,2005)。在动物细胞核内，RNA聚合酶Ⅱ将miRNA基因转录为长数千nt且内部有
miRNAs的生物合成(Jungetal.,2015)
【参考文献】：
期刊论文
[1]Mechanism of miR-21 via Wnt/β-catenin signaling pathway in human A549 lung cancer cells and Lewis lung carcinoma in mice[J]. Dan Wu,Min Shi,Xiao-Dong Fan. Asian Pacific Journal of Tropical Medicine. 2015(06)
[2]MicroRNA与细胞信号通路的相互作用[J]. 李斌,郭燕华,徐辉,周惠,屈良鹄. 生物化学与生物物理进展. 2013(07)
[3]文昌鸡MTNR1B基因的多态性及其与产蛋性状的关系[J]. 李晓宁,王慧,于希江,姜运良,宋倩,闫超,唐辉. 畜牧兽医学报. 2012(04)
[4]家禽单核苷酸多态性研究与应用新进展[J]. 卢立志,李进军,田勇,傅衍. 农业生物技术学报. 2010(02)
硕士论文
[1]启动子区SNPs及DNA甲基化对缺血性脑卒中患者ABCA1基因表达的调控机制研究[D]. 王君.郑州大学 2019
[2]济宁百日鸡产蛋曲线拟合及ASMT基因5’调控区多态性分析[D]. 滕军.山东农业大学 2019
[3]miR-458b-5p调控基因CTNNB1对鸡卵泡颗粒细胞增殖的影响[D]. 张深.山东农业大学 2019
[4]鸡miR-1666前体区SNP对其成熟体生成和其靶基因调控的影响[D]. 王善禾.河南农业大学 2015
本文编号：3540153
【文章来源】：山东农业大学山东省
【文章页数】：67 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
Wnt/β-Catenin信号通路示意图(MacDonaldetal.,2009)
山东农业大学硕士专业学位论文5鼠不育的结果一致(HernandezGiffordetal.,2009)。此外，通过Ctnnb1(Ex3)fl/fl和Ctnnb1fl/fl小鼠模型发现，FSH/cAMP信号通路激活颗粒细胞β-Catenin的转录，增强了FSH诱导的Cyp19的表达(Fanetal.,2010)。因此有可能一旦PI3K/AKT被FSH激活，使得β-Catenin能与SF1结合，启动下游靶基因Cyp19a1的转录，参与调节卵巢激素合成。图1-2PI3K/AKT与Wnt/β-Catenin信号通路相互作用(Boyeretal.,2010)Figure1-2InteractionsbetweenthePI3K/AKTandWnt/β-Cateninsignalingpathways(Boyeretal.,2010)1.2miRNA研究进展1.2.1miRNA发现及加工过程MicroRNAs(miRNAs)是一类长约22nt具有调控功能的非编码单链小RNA，由细胞内源产生的发卡（hairpin）结构转录本加工而来(Kim,2005)。最初miRNA是在线虫中发现的，1993年Lee等在线虫中发现了一种名为lin-4的基因，长22nt的lin-4并不编码蛋白，能够调节秀丽隐杆线虫细胞时序发育(Leeetal.,1993)。到2001年，人们发现了大量小RNA序列，将其统一命名为miRNA。随后的几年里，在各个物种中发现了大量的miRNA，从而开辟了一片全新而广阔的科学研究领域。动物miRNA是一类在进化上高度保守的基因。miRNA分布于基因组的各个位置，其中约有40%的miRNA位于编码基因的内含子区域，与宿主基因共享启动子和调控元件(Bartel,2004)。miRNA的加工成熟是一个复杂精密的过程，需要多种酶和辅助蛋白协调完成(Kim,2005)。在动物细胞核内，RNA聚合酶Ⅱ将miRNA基因转录为长数千nt且内部有
miRNAs的生物合成(Jungetal.,2015)
【参考文献】：
期刊论文
[1]Mechanism of miR-21 via Wnt/β-catenin signaling pathway in human A549 lung cancer cells and Lewis lung carcinoma in mice[J]. Dan Wu,Min Shi,Xiao-Dong Fan. Asian Pacific Journal of Tropical Medicine. 2015(06)
[2]MicroRNA与细胞信号通路的相互作用[J]. 李斌,郭燕华,徐辉,周惠,屈良鹄. 生物化学与生物物理进展. 2013(07)
[3]文昌鸡MTNR1B基因的多态性及其与产蛋性状的关系[J]. 李晓宁,王慧,于希江,姜运良,宋倩,闫超,唐辉. 畜牧兽医学报. 2012(04)
[4]家禽单核苷酸多态性研究与应用新进展[J]. 卢立志,李进军,田勇,傅衍. 农业生物技术学报. 2010(02)
硕士论文
[1]启动子区SNPs及DNA甲基化对缺血性脑卒中患者ABCA1基因表达的调控机制研究[D]. 王君.郑州大学 2019
[2]济宁百日鸡产蛋曲线拟合及ASMT基因5’调控区多态性分析[D]. 滕军.山东农业大学 2019
[3]miR-458b-5p调控基因CTNNB1对鸡卵泡颗粒细胞增殖的影响[D]. 张深.山东农业大学 2019
[4]鸡miR-1666前体区SNP对其成熟体生成和其靶基因调控的影响[D]. 王善禾.河南农业大学 2015
本文编号：3540153
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