豆状带绦虫密码子分析与四个功能基因的研究
发布时间：2021-12-24 17:29
豆状带绦虫呈世界性分布,成虫寄生于犬、狐狸等终末宿主的小肠,其中绦期幼虫-----豆状囊尾蚴寄生于家兔等兔形目动物的肝脏被膜、肠系膜及大网膜等处,引起家兔的豆状囊尾蚴病。我国是养兔大国,豆状囊尾蚴病流行于24个省区,是家兔的主要寄生虫病之一。本论文在前人研究工作的基础上,进一步对豆状带绦虫生物学、密码子使用情况及功能基因进行了分析和研究,为兔豆状囊尾蚴病诊断试剂及基因工程疫苗的研究提供候选抗原。主要研究内容与结果如下：1、豆状带绦虫生物学研究观察并记录了5只实验犬在人工感染豆状囊尾蚴后的节片排出特征及虫卵感染家兔后豆状囊尾蚴在兔体内的分布特点,结果显示：5只犬在感染豆状囊尾蚴后的第39～57d开始排出节片,最多一天排出158片。孕节中虫卵含量在60～26,480个之间。平均虫卵大小为（41.32±4.53）μm ×（36.23±4.92）μm。虫卵孵化大约需要4～5min。6只健康家兔每只经口感染5000个虫卵,感染后第55d剖杀。检测发现,豆状囊尾蚴主要寄生部位为兔的胃大网膜和直肠浆膜,肝脏被膜数量则较少。2、豆状带绦虫转录组和包括豆状带绦虫在内的43个扁形动物（吸虫和绦虫）线粒体全...
【文章来源】：四川农业大学四川省 211工程院校
【文章页数】：133 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
图１－７豆状带练虫头节上的钩（１０ｘ２０）??Ｆｉｇ．?１－７．?Ｈｏｏｋｓ?ｏｆ?７＾?ｐｉｓｉｆｏｒｍｉｓ?（１０?ｘ?２０）．??
２．１基因的核酸含量??重构基因的ＧＣ含量在２７％与６９．８〇／。之间，标准差为３．９０。大部分重构基因的??ＧＣ含量在４０％￣６０％之间（图２－１）。为理解核酸含量分布，我们测定了不同类型重??构基因的ＧＣ含量，ＧＣ３Ｓ含量及ＥＮＣ值（见表２－１谨构基因平均ＧＣ含量为４９．８４〇／〇。??ＥＮＣ?值在?２７．５５?和?６１?之间，平均为?５５．７８?（ＳＤ＝４．５５）。??巧扣１??化扣－?Ｂ｜＿??ＬＪｌ??日扣?０．巧?０．巧?０巧?０也０?０，６５??Ｇ＋Ｃ?ｃｏｎｔｅｎｔ（％）??图２－１豆状带练虫重构基因ＧＣ含量分布??Ｆｉｇ．?２－１?Ｄｉｓｔｒ化ｕｔｉｏｎ?ｏｆ?ｒｅｃｏｎｓｔｒｕｃ化ｄ?ｇｅｎｅｓ?ＧＣ?ｃｏｎｔｅｎｔｓ?ｉｎ?１／７叫切义??Ｉ??２６??
差的贡献值分别为１６．６％和９．９％，其余各轴对变异方差的贡献较小。大多数基因点??都靠近坐标轴形成一个楠球形，其在第一主轴上的值范围在－０．５２６到１．１４之间（图??３－３Ａ；图３－３Ｂ）。大多数ＷＣ／Ｇ结尾的密码子的位置在Ａ／Ｕ结尾密码子的上面，这支??持基因核酸组成是基因间同义密码子使用差异的基础。??为探索核酸组成与密码子偏好使用的关系，我们计算了基因在第一主轴上的位??置、ＧＣ、ＧＣ３Ｓ与ＮＣ值的相关系数。基因在第一轴上的位置与其ｇＣ３ｓ含量、ＧＣ??含量和ＮＣ值显著相关（ｒ?＝?０．３６７，０．２７５和０．７６９），另外ＮＣ值与ＧＣ３Ｓ含量和ＧＣ??含量也是显著相关（ｒ＝０．４６９和０．４０８）
【参考文献】：
期刊论文
[1]猪囊尾蚴半胱氨酸蛋白酶TsCL-1基因的原核表达条件优化及多抗制备[J]. 宋军科,于三科,骆学农,窦永喜,林青,才学鹏. 中国兽医学报. 2012(12)
[2]亚洲带绦虫六钩蚴Ta 8基因的克隆表达及免疫原性分析[J]. 王宇,程金芝,黄江,戴佳琳,陈小睿,廖兴江. 中国人兽共患病学报. 2012(11)
[3]猪带绦虫CDC37基因及其蛋白结构特征的生物信息学分析[J]. 刘玉江,陈晓睿,黄江,戴佳琳,廖兴江. 贵阳医学院学报. 2012(04)
[4]猪囊尾蚴GP50编码基因的克隆和序列分析[J]. 王朝兰,汤冬生,王业梅,姚勇,汪学龙. 蚌埠医学院学报. 2012(03)
[5]生物信息学法分析猪带绦虫苹果酸脱氢酶结构与功能[J]. 蓝磊,廖兴江,黄江,戴佳琳. 贵阳医学院学报. 2012(01)
[6]猪囊尾蚴抗原基因Ag1V1的克隆及其序列分析[J]. 张红超,闫民朝,宁长申,菅复春. 中国兽医杂志. 2012(02)
[7]我国细粒棘球绦虫新疆分离株AgB8/3亚基克隆表达及其检测囊型包虫病价值分析[J]. 高春花,崔刚,汪俊云,杨玥涛,石锋,朱慧慧. 中国人兽共患病学报. 2011(11)
[8]多头带绦虫Tm7基因的表达及间接ELISA检测方法的建立[J]. 安晓雪,杨光友,王颖旺,牟静,阳爱国,古小彬,杨应东,韦雷飞,文建国,王淑贤,边尧. 畜牧兽医学报. 2011(09)
[9]亚洲带绦虫60S核糖体蛋白L8基因的克隆表达和免疫学分析[J]. 王宇,戴佳琳,黄江,廖兴江. 中国人兽共患病学报. 2011(08)
[10]猪囊尾蚴基质金属蛋白酶-9在猪肌肉和脑组织的表达分布[J]. 方文,肖靓靓,包怀恩,牟荣. 动物医学进展. 2011(07)
博士论文
[1]猪囊尾蚴dUTPase的表达、活性分析及结构预测[D]. 刘振勇.中国农业科学院 2007
[2]猪带绦虫六钩蚴45W-4B和TSO18重组基因工程疫苗的研究[D]. 骆学农.中国农业科学院 2005
[3]猪带绦虫六钩蚴TSOL18重组基因工程疫苗的研制[D]. 袁改玲.中国农业科学院 2005
[4]猪带绦虫囊虫病DNA疫苗的中试及免疫效力研究[D]. 郭瀛军.第二军医大学 2004
[5]猪带绦虫六钩蚴cDNA表达文库的构建及免疫原基因的筛选、克隆与表达[D]. 景志忠.中国农业科学院 2003
[6]带科主要绦虫45W和14ku/18ku基因变异的研究[D]. 贾万忠.中国农业科学院 2003
硕士论文
[1]猪带绦虫六钩蚴HSP的克隆表达及差异蛋白研究[D]. 王哲.吉林农业大学 2011
[2]多头带绦虫多头蚴Tm7基因的克隆与原核表达[D]. 安晓雪.四川农业大学 2010
[3]多头带绦虫四川株六钩蚴Tm45W基因的克隆与原核表达[D]. 牟静.四川农业大学 2010
[4]多头带绦虫Tm18基因的克隆与原核表达[D]. 王颖旺.四川农业大学 2010
[5]猪囊尾蚴半胱氨酸蛋白酶TsCL-1基因的原核表达及生物学特性研究[D]. 宋军科.西北农林科技大学 2010
[6]TSOL18基因的克隆及其表达产物的抗原性与毒性研究[D]. 刘立军.甘肃农业大学 2009
[7]多头带绦虫硫氧还蛋白过氧化物酶基因的克隆、表达及抗原性研究[D]. 李永光.甘肃农业大学 2009
[8]猪带绦虫六钩蚴TSOL16基因的克隆、表达与免疫原性分析[D]. 马全英.新疆农业大学 2007
[9]犬抗细粒棘球绦虫保护性抗原EgM9重组蛋白引起免疫应答变化规律的研究[D]. 郭宝平.新疆农业大学 2007
[10]猪囊尾蚴T24基因的克隆、表达与免疫原性分析[D]. 李海龙.石河子大学 2006
本文编号：3550900
【文章来源】：四川农业大学四川省 211工程院校
【文章页数】：133 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
图１－７豆状带练虫头节上的钩（１０ｘ２０）??Ｆｉｇ．?１－７．?Ｈｏｏｋｓ?ｏｆ?７＾?ｐｉｓｉｆｏｒｍｉｓ?（１０?ｘ?２０）．??
２．１基因的核酸含量??重构基因的ＧＣ含量在２７％与６９．８〇／。之间，标准差为３．９０。大部分重构基因的??ＧＣ含量在４０％￣６０％之间（图２－１）。为理解核酸含量分布，我们测定了不同类型重??构基因的ＧＣ含量，ＧＣ３Ｓ含量及ＥＮＣ值（见表２－１谨构基因平均ＧＣ含量为４９．８４〇／〇。??ＥＮＣ?值在?２７．５５?和?６１?之间，平均为?５５．７８?（ＳＤ＝４．５５）。??巧扣１??化扣－?Ｂ｜＿??ＬＪｌ??日扣?０．巧?０．巧?０巧?０也０?０，６５??Ｇ＋Ｃ?ｃｏｎｔｅｎｔ（％）??图２－１豆状带练虫重构基因ＧＣ含量分布??Ｆｉｇ．?２－１?Ｄｉｓｔｒ化ｕｔｉｏｎ?ｏｆ?ｒｅｃｏｎｓｔｒｕｃ化ｄ?ｇｅｎｅｓ?ＧＣ?ｃｏｎｔｅｎｔｓ?ｉｎ?１／７叫切义??Ｉ??２６??
差的贡献值分别为１６．６％和９．９％，其余各轴对变异方差的贡献较小。大多数基因点??都靠近坐标轴形成一个楠球形，其在第一主轴上的值范围在－０．５２６到１．１４之间（图??３－３Ａ；图３－３Ｂ）。大多数ＷＣ／Ｇ结尾的密码子的位置在Ａ／Ｕ结尾密码子的上面，这支??持基因核酸组成是基因间同义密码子使用差异的基础。??为探索核酸组成与密码子偏好使用的关系，我们计算了基因在第一主轴上的位??置、ＧＣ、ＧＣ３Ｓ与ＮＣ值的相关系数。基因在第一轴上的位置与其ｇＣ３ｓ含量、ＧＣ??含量和ＮＣ值显著相关（ｒ?＝?０．３６７，０．２７５和０．７６９），另外ＮＣ值与ＧＣ３Ｓ含量和ＧＣ??含量也是显著相关（ｒ＝０．４６９和０．４０８）
【参考文献】：
期刊论文
[1]猪囊尾蚴半胱氨酸蛋白酶TsCL-1基因的原核表达条件优化及多抗制备[J]. 宋军科,于三科,骆学农,窦永喜,林青,才学鹏. 中国兽医学报. 2012(12)
[2]亚洲带绦虫六钩蚴Ta 8基因的克隆表达及免疫原性分析[J]. 王宇,程金芝,黄江,戴佳琳,陈小睿,廖兴江. 中国人兽共患病学报. 2012(11)
[3]猪带绦虫CDC37基因及其蛋白结构特征的生物信息学分析[J]. 刘玉江,陈晓睿,黄江,戴佳琳,廖兴江. 贵阳医学院学报. 2012(04)
[4]猪囊尾蚴GP50编码基因的克隆和序列分析[J]. 王朝兰,汤冬生,王业梅,姚勇,汪学龙. 蚌埠医学院学报. 2012(03)
[5]生物信息学法分析猪带绦虫苹果酸脱氢酶结构与功能[J]. 蓝磊,廖兴江,黄江,戴佳琳. 贵阳医学院学报. 2012(01)
[6]猪囊尾蚴抗原基因Ag1V1的克隆及其序列分析[J]. 张红超,闫民朝,宁长申,菅复春. 中国兽医杂志. 2012(02)
[7]我国细粒棘球绦虫新疆分离株AgB8/3亚基克隆表达及其检测囊型包虫病价值分析[J]. 高春花,崔刚,汪俊云,杨玥涛,石锋,朱慧慧. 中国人兽共患病学报. 2011(11)
[8]多头带绦虫Tm7基因的表达及间接ELISA检测方法的建立[J]. 安晓雪,杨光友,王颖旺,牟静,阳爱国,古小彬,杨应东,韦雷飞,文建国,王淑贤,边尧. 畜牧兽医学报. 2011(09)
[9]亚洲带绦虫60S核糖体蛋白L8基因的克隆表达和免疫学分析[J]. 王宇,戴佳琳,黄江,廖兴江. 中国人兽共患病学报. 2011(08)
[10]猪囊尾蚴基质金属蛋白酶-9在猪肌肉和脑组织的表达分布[J]. 方文,肖靓靓,包怀恩,牟荣. 动物医学进展. 2011(07)
博士论文
[1]猪囊尾蚴dUTPase的表达、活性分析及结构预测[D]. 刘振勇.中国农业科学院 2007
[2]猪带绦虫六钩蚴45W-4B和TSO18重组基因工程疫苗的研究[D]. 骆学农.中国农业科学院 2005
[3]猪带绦虫六钩蚴TSOL18重组基因工程疫苗的研制[D]. 袁改玲.中国农业科学院 2005
[4]猪带绦虫囊虫病DNA疫苗的中试及免疫效力研究[D]. 郭瀛军.第二军医大学 2004
[5]猪带绦虫六钩蚴cDNA表达文库的构建及免疫原基因的筛选、克隆与表达[D]. 景志忠.中国农业科学院 2003
[6]带科主要绦虫45W和14ku/18ku基因变异的研究[D]. 贾万忠.中国农业科学院 2003
硕士论文
[1]猪带绦虫六钩蚴HSP的克隆表达及差异蛋白研究[D]. 王哲.吉林农业大学 2011
[2]多头带绦虫多头蚴Tm7基因的克隆与原核表达[D]. 安晓雪.四川农业大学 2010
[3]多头带绦虫四川株六钩蚴Tm45W基因的克隆与原核表达[D]. 牟静.四川农业大学 2010
[4]多头带绦虫Tm18基因的克隆与原核表达[D]. 王颖旺.四川农业大学 2010
[5]猪囊尾蚴半胱氨酸蛋白酶TsCL-1基因的原核表达及生物学特性研究[D]. 宋军科.西北农林科技大学 2010
[6]TSOL18基因的克隆及其表达产物的抗原性与毒性研究[D]. 刘立军.甘肃农业大学 2009
[7]多头带绦虫硫氧还蛋白过氧化物酶基因的克隆、表达及抗原性研究[D]. 李永光.甘肃农业大学 2009
[8]猪带绦虫六钩蚴TSOL16基因的克隆、表达与免疫原性分析[D]. 马全英.新疆农业大学 2007
[9]犬抗细粒棘球绦虫保护性抗原EgM9重组蛋白引起免疫应答变化规律的研究[D]. 郭宝平.新疆农业大学 2007
[10]猪囊尾蚴T24基因的克隆、表达与免疫原性分析[D]. 李海龙.石河子大学 2006
本文编号：3550900
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