两种新型鸭源Megrivirus的检测

发布时间：2021-12-30 11:13

　　为了了解鸭源微RNA病毒的一个新病毒种Duck Megrivirus（DMV）在重庆市鸭群中的感染及变异情况,试验采用RT-PCR技术,应用DMV基因组3CD序列特异性引物,对重庆市6个地区的活禽粪便样品进行分子检测,并使用CLUSTAL W、MEGA 5.0软件对阳性样品序列进行同源性分析和遗传进化树的构建。结果表明:从60份活禽粪便样品中检出17份阳性样品,阳性率为28%（17/60）,17份阳性样品的扩增产物均为DMV的283 bp 3CD序列。基于序列同源性分析,可将17株DMV分为3类,其中A类有15株病毒,与已知的DMV核苷酸序列同源性为96%～100%;B类有1株病毒（DMV-2/CN/Chongqing-8/2016）,与已知的DMV核苷酸序列同源性为88%; C类有1株病毒（DMV-3/CN/Chongqing-10/2016）,与已知的DMV核苷酸序列同源性为86%。对B类和C类这2株新型DMV（DMV-2/CN/Chongqing-8/2016和DMV-3/CN/Chongqing-10/2016）的氨基酸序列进行遗传进化分析, 2株DMV均聚在Megriviru... 

【文章来源】：黑龙江畜牧兽医. 2020,(13)北大核心

【文章页数】：4 页

【部分图文】：

微RNA病毒株遗传进化树的构建结果

【参考文献】：
博士论文
[1]用通用PCR和宏基因组学发现鸭和鹅的新病毒[D]. 王府民.中国农业大学 2017



本文编号：3558079