云南省独龙牛环孢子虫分子流行病学调查

发布时间：2022-01-02 18:34

　　为了了解云南省独龙牛环孢子虫（Cyclospora）的分子流行病学情况,试验分四个季节从云南省怒江流域（鸠门当、古泉村、茨开镇、亚左洛村）和独龙江流域（独龙江乡）共五个地点采集1 129份独龙牛粪便样本,根据环孢子虫的18S rRNA基因序列设计引物进行巢式PCR扩增,以限制性内切酶BspEⅠ进行限制性片段长度多态性（RELP）分析。利用BLAST工具对测得的序列与NCBI上已发表的环孢子虫18S rRNA基因序列进行比对分析,通过生物学软件MEGA 6.0计算遗传距离并采用邻接法（NJ法）构建遗传进化树,以统计学软件SPSS对感染率进行分析。结果表明:从1 129份粪便样本中共检测出17份环孢子虫阳性样本,对测得序列进行同源性分析发现,5份样本与人环孢子虫亲缘关系较近（98.5%～99.4%）,11份样本与广州牛源环孢子虫亲缘关系较近（94.4%～98.8%）,1份样本与其他种类环孢子虫亲缘关系较远。独龙牛环孢子虫的总感染率为1.51%（17/1 129）,怒江流域和独龙江流域的感染率分别为1.00%（9/903）和3.54%（8/226）,两者比较差异显著（P<0.05）;五... 

【文章来源】：黑龙江畜牧兽医. 2020,(23)北大核心

【文章页数】：4 页

【部分图文】：

环孢子虫18S rRNA基因PCR扩增结果

经RELP分析,在24份PCR阳性样本中,有17份样本为环孢子虫阳性,其中怒江流域9份,独龙江流域8份。电泳结果显示环孢子虫片段被酶切为130 bp和370 bp两个片段,见图2(部分结果)。2.3 序列的遗传进化分析

通过同源性分析结果,在17份阳性样本中有5份样本与人环孢子虫亲缘关系较近,同源性为98.5%～99.4%,11份样本与广州牛源环孢子虫亲缘关系较近,同源性为94.4%～98.8%,1份样本与其他种类环孢子虫亲缘关系较远。序列分析结果显示,共有7份样本不同DNA序列,上传至GenBank中,获得的序列号分别为MK393852～MK393858,遗传进化分析结果见图3。2.4 环孢子虫感染情况的统计

【参考文献】：
期刊论文
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本文编号：3564676