牛源多杀性巴氏杆菌Oma87基因的分子特征、抗原性及遗传进化分析

发布时间：2022-01-06 08:23

　　为研究牛源多杀性巴氏杆菌（Pasteurella multocida,Pm）Oma87基因的分子特征及同源性,本研究对荚膜血清A型（capsular serotype A,Pm8）Oma87基因进行扩增、克隆和测序,利用在线软件对其进行分子特征、抗原性及遗传进化分析。结果显示,Oma87基因全长为2 376 bp,编码791个氨基酸;氨基酸序列分析发现,该蛋白为酸性的亲水性蛋白,稳定性高,具有信号肽结构但不存在跨膜区域;二、三级结构分析发现,该蛋白为无规则卷曲及多段延伸链所形成的"N"字型三维立体结构。遗传进化分析显示,新疆分离株Pm8 Oma87基因与其他不同地域的牛源A型Pm和部分猪源A型Pm的同源性较近,与其他型Pm的同源性较远;通过VaxiJen软件分析发现,Oma87蛋白的保护性抗原的总体预测值为0.5478,高于正常阈值0.4,证明Oma87蛋白可作为免疫原性蛋白,为进一步研究Oma87蛋白奠定了理论基础。 

【文章来源】：中国畜牧兽医. 2020,47(07)北大核心

【文章页数】：7 页

【部分图文】：

Oma87基因PCR扩增结果

将测序结果与GenBank 基因库参考序列进行同源性比对,本研究测得的牛源A型Pm8的Oma87基因与美国牛源A型Pm(USDA-ARS-USMARC-59962、USDA-ARS-USMARC-60381)、德国牛源A型Pm 36950以及中国猪源A型Pm(BS168、HB03)、美国猪源A型Pm标准菌株ATCC43137的Oma87基因序列同源性为100%;与缅甸、印度、伊朗和马来西亚牛源B型Pm(标准菌株NCTC10323、p52、Pm0001和PMX)的Oma87基因序列同源性为98.82%～99.12%;与中国山羊源A型Pm NH01、印度绵羊源D型Pm CSWRI/AH/PmD16的Oma87基因序列同源性为98.53%;与美国、德国和荷兰的人源Pm的Oma87基因序列同源性为95.58%～95.66%。系统进化树分析结果表明,中国新疆牛源A型Pm的Oma87基因序列与其他牛源A型Pm的Oma87基因相同,与部分猪源A型Pm的Oma87基因相同;与牛源B型Pm的Oma87序列不同,同源性大约为99%;与人源Pm Oma87基因的亲缘关系较远,同源性约为95.6%(图6)。图3 Oma87蛋白二级结构预测

Oma87蛋白二级结构预测

【参考文献】：
期刊论文
[1]羊源多杀性巴氏杆菌ompW基因的克隆及生物信息学分析[J]. 李宝宝,张振兴,黄海峰,张萌萌,郑义盈,王成强,章泸尹,安琪,杨小健,聂鑫,曹瑞勇,朱姝,王凤阳,杜丽.  中国畜牧兽医. 2019(01)



本文编号：3572115