PRLR等基因在不同羽型坝上长尾鸡皮肤组织中的表达变化研究
发布时间：2022-01-12 03:33
快慢羽性状被用于雏鸡性别鉴定,并且快羽鸡与慢羽鸡存在生产性能的差异。为了研究不同羽型坝上长尾鸡PRLR、SPEF2等基因在羽毛发育差异中的作用,本研究采集胚胎19和20天以及出雏0日龄的快羽和慢羽坝上长尾鸡的主翼羽和覆主翼羽的羽毛,检测其长度;采集胚胎12、15、19日龄和出雏后0、15、20、35、56日龄的快羽坝上长尾鸡和慢羽坝上长尾鸡毛囊组织,提取DNA和RNA,利用RFLP对坝上长尾鸡的羽速类型进行检测,半定量RT-PCR检测PRLR两种剪接体的表达量,利用Protparam、PSORT II、SignalP4.1、TMHMM、SOPMA和SWISS-MODEL软件预测PRLR基因的两种剪接体编码蛋白的氨基酸理化性质和结构,并对PRLR基因启动子活性区域进行了探究;利用RT-qPCR检测PRLR（aPRLR）、SPEF2、FUSION、FST和BMP2基因的表达量,分析基因表达与羽毛发育间的关系。结果表明,坝上长尾鸡的羽速表型是由PRLR和SPEF2基因的重复造成,而与ev21未占位区重复序列无关。快羽主翼羽和覆主翼羽长度20胚龄均显著高于19胚龄（P<0.05）,而与出...
【文章来源】：河北农业大学河北省
【文章页数】：85 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
abstract
1 引言
1.1 毛囊的生长发育
1.2 催乳素受体的研究进展
1.2.1 PRLR与羽速的关系
1.2.2 PRLR基因定位
1.2.3 PRLR基因的结构
1.2.4 PRLR基因功能
1.2.5 PRLR基因表达
1.2.6 PRLR基因多态性
1.3 其它羽速相关基因的研究进展
1.3.1 FST基因
1.3.2 BMP2基因
1.4 本试验研究的目的和意义
2 材料与方法
2.1 试验材料
2.1.1 试验动物和样本采集
2.2 试验方法
2.2.1 主翼羽和覆主翼羽羽毛长度的测量
2.2.2 DNA提取
2.2.3 RNA提取
2.2.4 坝上长尾鸡羽速表型检测
2.2.5 PRLR基因剪接体半定量分析
2.2.6 PRLR氨基酸序列生物信息学分析
2.2.7 PRLR基因启动子分析
2.2.8 PRLR等基因表达定量分析
3 结果
3.1 DNA和mRNA的提取
3.1.1 鸡肝脏组织DNA提取结果
3.1.2 鸡毛囊组织mRNA提取结果
3.2 未占位区HaeIII酶切鉴定
3.3 两种羽型坝上长尾鸡主翼羽和覆主翼羽毛长度变化
3.4 PRLR基因剪接体半定量分析
3.4.1 PRLR剪接体类型检测
3.4.2 两种羽型、两种羽色和日龄对PRLR两种剪接体表达影响
3.4.3 两种羽色PRLRS2表达随日龄变化
3.4.4 不同日龄和羽型的PRLR两种剪接体的表达变化
3.4.5 不同日龄、羽色和羽型的PRLR两种剪接体的表达变化
3.5 PRLR基因氨基酸序列生物信息学分析
3.5.1 理化性质
3.5.2 序列比对
3.5.3 PRLRS1和PRLRS2信号肽预测
3.5.4 亚细胞定位
3.5.5 PRLRS1和PRLRS2蛋白跨膜结构域预测
3.5.6 PRLRS1和PRLRS2蛋白二级结构预测
3.5.7 PRLRS1和PRLRS1蛋白三级结构预测
3.6 快羽和慢羽坝上长尾鸡毛囊发育相关基因表达定量分析
3.6.1 两种羽型、两种羽色和八个时点坝上长尾鸡毛囊aPRLR、BMP2、SPEF2、FST和FUSION表达
3.6.2 不同日龄的两种羽色鸡FST、SPEF2、BMP2和aPRLR的表达变化
3.6.3 不同日龄的两种羽型鸡的FST、SPEF2、BMP2和aPRLR表达变化
3.6.4 不同日龄和羽色慢羽鸡FUSION表达变化
3.6.5 不同日龄的两种羽色和羽型鸡的BMP2、SPEF2、FST和aPRLR表达变化
3.7 PRLR突变位点分析
3.7.1 PRLR基因PCR扩增结果
3.7.2 PRLR突变位点
3.8 PRLR基因启动子分析
4 讨论
4.1 快慢羽羽毛长度与相关基因分析
4.2 PRLR基因启动子分析
4.3 PRLR突变位点分析
5 结论
参考文献
附录Ⅰ
附录Ⅱ
在读期间发表的论文
作者简介
致谢
附件
详细摘要
本文编号：3584020
【文章来源】：河北农业大学河北省
【文章页数】：85 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
abstract
1 引言
1.1 毛囊的生长发育
1.2 催乳素受体的研究进展
1.2.1 PRLR与羽速的关系
1.2.2 PRLR基因定位
1.2.3 PRLR基因的结构
1.2.4 PRLR基因功能
1.2.5 PRLR基因表达
1.2.6 PRLR基因多态性
1.3 其它羽速相关基因的研究进展
1.3.1 FST基因
1.3.2 BMP2基因
1.4 本试验研究的目的和意义
2 材料与方法
2.1 试验材料
2.1.1 试验动物和样本采集
2.2 试验方法
2.2.1 主翼羽和覆主翼羽羽毛长度的测量
2.2.2 DNA提取
2.2.3 RNA提取
2.2.4 坝上长尾鸡羽速表型检测
2.2.5 PRLR基因剪接体半定量分析
2.2.6 PRLR氨基酸序列生物信息学分析
2.2.7 PRLR基因启动子分析
2.2.8 PRLR等基因表达定量分析
3 结果
3.1 DNA和mRNA的提取
3.1.1 鸡肝脏组织DNA提取结果
3.1.2 鸡毛囊组织mRNA提取结果
3.2 未占位区HaeIII酶切鉴定
3.3 两种羽型坝上长尾鸡主翼羽和覆主翼羽毛长度变化
3.4 PRLR基因剪接体半定量分析
3.4.1 PRLR剪接体类型检测
3.4.2 两种羽型、两种羽色和日龄对PRLR两种剪接体表达影响
3.4.3 两种羽色PRLRS2表达随日龄变化
3.4.4 不同日龄和羽型的PRLR两种剪接体的表达变化
3.4.5 不同日龄、羽色和羽型的PRLR两种剪接体的表达变化
3.5 PRLR基因氨基酸序列生物信息学分析
3.5.1 理化性质
3.5.2 序列比对
3.5.3 PRLRS1和PRLRS2信号肽预测
3.5.4 亚细胞定位
3.5.5 PRLRS1和PRLRS2蛋白跨膜结构域预测
3.5.6 PRLRS1和PRLRS2蛋白二级结构预测
3.5.7 PRLRS1和PRLRS1蛋白三级结构预测
3.6 快羽和慢羽坝上长尾鸡毛囊发育相关基因表达定量分析
3.6.1 两种羽型、两种羽色和八个时点坝上长尾鸡毛囊aPRLR、BMP2、SPEF2、FST和FUSION表达
3.6.2 不同日龄的两种羽色鸡FST、SPEF2、BMP2和aPRLR的表达变化
3.6.3 不同日龄的两种羽型鸡的FST、SPEF2、BMP2和aPRLR表达变化
3.6.4 不同日龄和羽色慢羽鸡FUSION表达变化
3.6.5 不同日龄的两种羽色和羽型鸡的BMP2、SPEF2、FST和aPRLR表达变化
3.7 PRLR突变位点分析
3.7.1 PRLR基因PCR扩增结果
3.7.2 PRLR突变位点
3.8 PRLR基因启动子分析
4 讨论
4.1 快慢羽羽毛长度与相关基因分析
4.2 PRLR基因启动子分析
4.3 PRLR突变位点分析
5 结论
参考文献
附录Ⅰ
附录Ⅱ
在读期间发表的论文
作者简介
致谢
附件
详细摘要
本文编号：3584020
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