黄牛5个热适应基因的多态性与气候参数的相关性研究
发布时间：2022-02-04 23:13
热应激严重影响动物的产奶量、生长繁殖、免疫等多种性状,对畜牧业经济造成巨大损失。随着全球温室效应不断加剧,热应激已经为危害畜牧生产的重要因素之一。研究表明,催乳素释放激素基因（prolactin releasing hormone,PRLH）、超氧歧化酶1基因（superoxide dismutase 1,SOD1）、热休克蛋白家族成员7基因（heat shock protein family B member 7,HSPB7）、真核生物翻译起始因子2α激酶4基因（eukaryotic translation initiation factor 2 alpha kinase 4,EIF2AK4）、热休克因子1基因（heat shock factor 1,HSF1）在瘤牛中受到强选择,所以这些基因上的错义突变很有可能与耐热性相关。中国具有丰富的牛种资源,根据其地域分布,可被分为北方黄牛、中原黄牛和南方黄牛。此外,中国幅员辽阔,横跨寒温带、温带以及热带,南北温度差异悬殊,所以这些牛种是研究热适应性的理想模型。因此本研究选择5个热适应候选基因的5个错义突变（PRLH:AC0
【文章来源】：西北农林科技大学陕西省211工程院校985工程院校教育部直属院校
【文章页数】：62 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
牛PRLH基因部分片段PCR扩增产物检测
图 2-1 牛基因组 DNA 检测电泳图re 2-1 Genomic DNAwas detected by 2% agarose gel electrophores PRLH 基因的多态性检测因部分片段 PCR 扩增结果鉴定DNA 为模板，用引物 P1-PRLH 对 PRLH 基因第三外显凝胶电泳对 PRLH 基因扩增产物进行检测。从图 2-2 可一整齐、清晰、亮度也较好。通过与 Marker 对比可以5bp，与预期产物片段大小相符合，说明扩增产物是本研
图 2-3 牛 PRLH 基因 AC_000160.1: g.11764610 G>A 位点测序峰图Figure 2-3 The sequencing map forAC_000160.1: g.11764610 G>Alocus of bovine PRLH gene2.2.2.3 PRLH 基因 SNP 位点在中国黄牛中的分布统计 PRLH 基因 AC_000160.1:g.11764610 G>A 位点在中国黄牛品种以及安格斯牛和瘤牛品种中的基因型频率和基因频率，并根据基因频率绘制频率分布图（图 2-4）。由表 2-4 可得出，等位基因 G 和 A 在中国黄牛中的平均基因频率为 0.6276 和 0.3724。首先选用纯的普通牛（安格斯）和瘤牛（印度瘤牛）来验证 AC_000160.1:g.11764610 G>A位点的突变是否有普通牛-瘤牛特异性。结果显示等位基因 A 在安格斯牛中的频率为0.0000，在瘤牛中达到了 0.6364，证明该位点具有牛种特异性，即在普通牛中为 G 等位基因，瘤牛中为 A 等位基因。中国北方牛主要为普通牛，中国南方牛主要为瘤牛。等位基因 A 在中国北方黄牛、中原黄牛和南方黄牛三大类型的基因频率分别为 0.0351、0.2061 和 0.5488，由北到南呈上升趋势，具有明显的地理分布规律（图 2-4）。表 2-4 PRLH 基因 AC_000160.1: g.11764610 G>A 位点在 33 个牛品种中的基因型和基因频率Table 2-4 Genotypic and allele frequencies of the PRLH gene (AC_000160.1: g.11764610 G>A) across33 cattle breeds
【参考文献】：
期刊论文
[1]温湿度指数与奶牛生产性能的关系[J]. 薛白,王之盛,李胜利,王立志,王祖新. 中国畜牧兽医. 2010(03)
[2]热应激对荷斯坦奶牛生产性能和乳脂脂肪酸组成的影响[J]. 李征,梅成,郭智成. 中国乳品工业. 2009(09)
[3]综合营养措施对热应激奶牛的影响[J]. 陈志伟,丁忠锋,陈凯. 中国畜牧兽医. 2005(05)
[4]红细胞钾含量对奶牛耐热性的影响[J]. 赖登明,夏东,李如治,谭志明,谢伍生. 中国奶牛. 1997(02)
[5]主要气候因子对广州地区黑白花奶牛产奶量的影响[J]. 王前,林玲,陈惠珍. 中国畜牧杂志. 1993(02)
[6]乳牛耐热性的数量指标和遗传力[J]. 穆玉云. 中国畜牧杂志. 1990(05)
[7]气象因素对种公牛精液品质的影响[J]. 杨殿军,王力波,陈忠孝,郭雷,朱清华,李广忠,杨维义. 黑龙江畜牧兽医. 1989(02)
本文编号：3614119
【文章来源】：西北农林科技大学陕西省211工程院校985工程院校教育部直属院校
【文章页数】：62 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
牛PRLH基因部分片段PCR扩增产物检测
图 2-1 牛基因组 DNA 检测电泳图re 2-1 Genomic DNAwas detected by 2% agarose gel electrophores PRLH 基因的多态性检测因部分片段 PCR 扩增结果鉴定DNA 为模板，用引物 P1-PRLH 对 PRLH 基因第三外显凝胶电泳对 PRLH 基因扩增产物进行检测。从图 2-2 可一整齐、清晰、亮度也较好。通过与 Marker 对比可以5bp，与预期产物片段大小相符合，说明扩增产物是本研
图 2-3 牛 PRLH 基因 AC_000160.1: g.11764610 G>A 位点测序峰图Figure 2-3 The sequencing map forAC_000160.1: g.11764610 G>Alocus of bovine PRLH gene2.2.2.3 PRLH 基因 SNP 位点在中国黄牛中的分布统计 PRLH 基因 AC_000160.1:g.11764610 G>A 位点在中国黄牛品种以及安格斯牛和瘤牛品种中的基因型频率和基因频率，并根据基因频率绘制频率分布图（图 2-4）。由表 2-4 可得出，等位基因 G 和 A 在中国黄牛中的平均基因频率为 0.6276 和 0.3724。首先选用纯的普通牛（安格斯）和瘤牛（印度瘤牛）来验证 AC_000160.1:g.11764610 G>A位点的突变是否有普通牛-瘤牛特异性。结果显示等位基因 A 在安格斯牛中的频率为0.0000，在瘤牛中达到了 0.6364，证明该位点具有牛种特异性，即在普通牛中为 G 等位基因，瘤牛中为 A 等位基因。中国北方牛主要为普通牛，中国南方牛主要为瘤牛。等位基因 A 在中国北方黄牛、中原黄牛和南方黄牛三大类型的基因频率分别为 0.0351、0.2061 和 0.5488，由北到南呈上升趋势，具有明显的地理分布规律（图 2-4）。表 2-4 PRLH 基因 AC_000160.1: g.11764610 G>A 位点在 33 个牛品种中的基因型和基因频率Table 2-4 Genotypic and allele frequencies of the PRLH gene (AC_000160.1: g.11764610 G>A) across33 cattle breeds
【参考文献】：
期刊论文
[1]温湿度指数与奶牛生产性能的关系[J]. 薛白,王之盛,李胜利,王立志,王祖新. 中国畜牧兽医. 2010(03)
[2]热应激对荷斯坦奶牛生产性能和乳脂脂肪酸组成的影响[J]. 李征,梅成,郭智成. 中国乳品工业. 2009(09)
[3]综合营养措施对热应激奶牛的影响[J]. 陈志伟,丁忠锋,陈凯. 中国畜牧兽医. 2005(05)
[4]红细胞钾含量对奶牛耐热性的影响[J]. 赖登明,夏东,李如治,谭志明,谢伍生. 中国奶牛. 1997(02)
[5]主要气候因子对广州地区黑白花奶牛产奶量的影响[J]. 王前,林玲,陈惠珍. 中国畜牧杂志. 1993(02)
[6]乳牛耐热性的数量指标和遗传力[J]. 穆玉云. 中国畜牧杂志. 1990(05)
[7]气象因素对种公牛精液品质的影响[J]. 杨殿军,王力波,陈忠孝,郭雷,朱清华,李广忠,杨维义. 黑龙江畜牧兽医. 1989(02)
本文编号：3614119
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