牛体内、外囊胚全转录组测序及分析
发布时间：2022-02-08 13:03
体外胚胎生产技术以一种高效简单的辅助生殖技术获得广泛应用。体外受精技术是体外胚胎生产技术的重要组成部分。对动物养殖中的优良畜种的培育有重要的实践意义。同样玻璃化冷冻技术相比于其他冷冻保存方法具有花费较短的时间、简单易操作、产生较高的效率等优点,从而成为备受关注的技术。但体外生产胚胎与体内生产胚胎相比在卵裂率,妊娠率,产犊率等方面仍存在不足,这些可能与转录组异常相关（包括mRNA、lncRNA、circRNA）。本研究采用单细胞全转录组测序技术对牛体内生产的囊胚、新鲜牛卵母细胞体外培养受精的囊胚、玻璃化冷冻牛卵母细胞体外培养受精的囊胚进行全转录组分析（包括mRNA、lncRNA、circRNA）,同时由获得的数据进行差异表达mRNA,lncRNA,circRNA的生物信息学分析并进行初步探索,本试验主要研究结果如下:1、对牛体内、外囊胚进行全转录组测序对其mRNA模式进行探讨及生物学信息分析,与In vivo组和IVF组中差异表达基因有78个,其中60个上调,18个下调;In vivo组和VIVF组中差异表达基因表达362,其中305个上调,57个下调;IVF组和V...
【文章来源】：中国农业科学院北京市
【文章页数】：74 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
Invivo、IVF、V-IVF组与组之间共有的差异表达基因个数Fig.2-1NumberofdifferentiallyexpressedgenessharedbetweengroupsofInvivo、IVFV-IVFgroupDMRcluster
中国农业科学院硕士学位论文第二章牛体内、外囊胚mRNA的表达模式20图2-4Invivo和IVF组间DEG的KEGG富集散点图Fig.2-4KEGGenrichmentplotofDEGofInvivoandIVF注：纵轴代表通路名称，横轴代表富集因子（RichRatio），点的颜色和大小分别代表富集在某通路的富集显著性和差异表达基因个数2.4.6.2牛体内生产囊胚、玻璃化冷冻卵母细胞IVF囊胚差异表达基因的KEGG富集图如图2-5所示，体内生产囊胚、玻璃化冷冻卵母细胞IVF囊胚的差异表达基因的KEGG富集散点图富集通路是核糖体、溶酶体。图2-5Invivo和V-IVF组间DEGS的KEGG富集散点图Fig.2-5KEGGenrichmentplotofDEGsofInvivoandV-IVF注：纵轴代表通路名称，横轴代表富集因子（RichRatio），点的颜色和大小分别代表富集在某通路的富集显著性和差异表达基因个数
中国农业科学院硕士学位论文第二章牛体内、外囊胚mRNA的表达模式20图2-4Invivo和IVF组间DEG的KEGG富集散点图Fig.2-4KEGGenrichmentplotofDEGofInvivoandIVF注：纵轴代表通路名称，横轴代表富集因子（RichRatio），点的颜色和大小分别代表富集在某通路的富集显著性和差异表达基因个数2.4.6.2牛体内生产囊胚、玻璃化冷冻卵母细胞IVF囊胚差异表达基因的KEGG富集图如图2-5所示，体内生产囊胚、玻璃化冷冻卵母细胞IVF囊胚的差异表达基因的KEGG富集散点图富集通路是核糖体、溶酶体。图2-5Invivo和V-IVF组间DEGS的KEGG富集散点图Fig.2-5KEGGenrichmentplotofDEGsofInvivoandV-IVF注：纵轴代表通路名称，横轴代表富集因子（RichRatio），点的颜色和大小分别代表富集在某通路的富集显著性和差异表达基因个数
【参考文献】：
期刊论文
[1]Single-Cell Sequencing Technologies: Current and Future[J]. Jialong Liang,Wanshi Cai,Zhongsheng Sun. Journal of Genetics and Genomics. 2014(10)
[2]牛体外胚胎生产技术研究进展[J]. 侯银仙. 畜牧兽医科技信息. 2013(09)
[3]环氧合酶-1和环氧合酶-2在兔早期妊娠子宫内膜及早期胚胎中的表达[J]. 滕春波,徐立滨,李世杰,杨增明. 中国兽医学报. 2003(05)
硕士论文
[1]牛体内、外囊胚全基因组甲基化测序及分析[D]. 赵亚涵.中国农业科学院 2019
本文编号：3615114
【文章来源】：中国农业科学院北京市
【文章页数】：74 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
Invivo、IVF、V-IVF组与组之间共有的差异表达基因个数Fig.2-1NumberofdifferentiallyexpressedgenessharedbetweengroupsofInvivo、IVFV-IVFgroupDMRcluster
中国农业科学院硕士学位论文第二章牛体内、外囊胚mRNA的表达模式20图2-4Invivo和IVF组间DEG的KEGG富集散点图Fig.2-4KEGGenrichmentplotofDEGofInvivoandIVF注：纵轴代表通路名称，横轴代表富集因子（RichRatio），点的颜色和大小分别代表富集在某通路的富集显著性和差异表达基因个数2.4.6.2牛体内生产囊胚、玻璃化冷冻卵母细胞IVF囊胚差异表达基因的KEGG富集图如图2-5所示，体内生产囊胚、玻璃化冷冻卵母细胞IVF囊胚的差异表达基因的KEGG富集散点图富集通路是核糖体、溶酶体。图2-5Invivo和V-IVF组间DEGS的KEGG富集散点图Fig.2-5KEGGenrichmentplotofDEGsofInvivoandV-IVF注：纵轴代表通路名称，横轴代表富集因子（RichRatio），点的颜色和大小分别代表富集在某通路的富集显著性和差异表达基因个数
中国农业科学院硕士学位论文第二章牛体内、外囊胚mRNA的表达模式20图2-4Invivo和IVF组间DEG的KEGG富集散点图Fig.2-4KEGGenrichmentplotofDEGofInvivoandIVF注：纵轴代表通路名称，横轴代表富集因子（RichRatio），点的颜色和大小分别代表富集在某通路的富集显著性和差异表达基因个数2.4.6.2牛体内生产囊胚、玻璃化冷冻卵母细胞IVF囊胚差异表达基因的KEGG富集图如图2-5所示，体内生产囊胚、玻璃化冷冻卵母细胞IVF囊胚的差异表达基因的KEGG富集散点图富集通路是核糖体、溶酶体。图2-5Invivo和V-IVF组间DEGS的KEGG富集散点图Fig.2-5KEGGenrichmentplotofDEGsofInvivoandV-IVF注：纵轴代表通路名称，横轴代表富集因子（RichRatio），点的颜色和大小分别代表富集在某通路的富集显著性和差异表达基因个数
【参考文献】：
期刊论文
[1]Single-Cell Sequencing Technologies: Current and Future[J]. Jialong Liang,Wanshi Cai,Zhongsheng Sun. Journal of Genetics and Genomics. 2014(10)
[2]牛体外胚胎生产技术研究进展[J]. 侯银仙. 畜牧兽医科技信息. 2013(09)
[3]环氧合酶-1和环氧合酶-2在兔早期妊娠子宫内膜及早期胚胎中的表达[J]. 滕春波,徐立滨,李世杰,杨增明. 中国兽医学报. 2003(05)
硕士论文
[1]牛体内、外囊胚全基因组甲基化测序及分析[D]. 赵亚涵.中国农业科学院 2019
本文编号：3615114
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