牛MBL2基因多态性及其与精液品质和公牛后裔生产性能的相关性研究

发布时间：2022-02-10 00:41

　　本实验利用测序和PCR-SSCP的方法,检测了218头中国荷斯坦种公牛甘露糖结合凝集素（Mannan-Binding Lectin-C, MBL2）基因的单核苷酸多态性。利用生物信息学的方法对发现的SNPs位点进行了分析,并分析了其多态性与精液品质和公牛后裔产奶性能及乳房炎抗性的相关性,以及MBL2基因在健康及患乳房炎奶牛不同组织的表达情况。结果如下：1.在牛MBL2基因启动子区发现3个新的突变位点,分别为g.895A/T、g.905 A/G和g.956 T/C；在外显子1 （exon 1）发现4个突变位点,即g.1164 G/A、g.1197 C/A、 g.1198 G/A和g.1207 T/C；在外显子2（exon 2）发现了一个新的突变位点g.1676 C/T。分析发现,g.1164 G/A和g.1197 C/A为非同义突变,分别导致其编码的第31位和第42位氨基酸发生精氨酸-谷氨酰胺（R-Q）和脯氨酸-谷氨酰胺（P-Q）替换。只有g.1164G/A和g.1676 C/T位点满足Hardy-Weinberg平衡（p>0.05）。测序发现g.905 A/G和g.956T/C紧... 

【文章来源】：南京农业大学江苏省211工程院校教育部直属院校

【文章页数】：69 页

【学位级别】：硕士

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摘要
ABSTRACT
缩略词
第一章 文献综述
    1 MBL的研究进展
        1.1 MBL的发现
        1.2 MBL的结构
        1.3 MBL基因
        1.4 MBL功能
            1.4.1 MBL与病原体识别
            1.4.2 MBL与补体系统激活
            1.4.3 MBL与吞噬作用
            1.4.4 MBL与炎症反应
            1.4.5 MBL与自身识别
            1.4.6 MBL的其它作用
        1.5 MBL单核苷酸多态性研究
        1.6 MBL在动物中的研究
    2 后裔测定
    3 精液品质
    4 本研究的目的及意义
    参考文献
第二章 公牛MBL2基因单核苷酸多态性及其与精液品质和后裔生产性能的相关性
    1 材料与方法
        1.1 材料
            1.1.1 实验动物
            1.1.2 主要仪器设备
            1.1.3 药品及试剂
        1.2 实验方法
            1.2.1 基因组DNA的提取
            1.2.2 引物设计与PCR扩增
            1.2.3 测序分析
            1.2.4 基因分型
            1.2.5 物种间MBL2基因同源性分析
            1.2.6 牛MBL2基因5'调控区序列的生物信息学分析
            1.2.7 蛋白质二级结构分析
        1.3 统计分析
            1.3.1 基因型频率和等位基因频率
            1.3.2 多态信息指数
            1.3.3 Hardy-Weinberg平衡检验
            1.3.4 相关性分析
    2 结果与分析
        2.1 测序结果
        2.2 PCR-SSCP分型
        2.3 公牛MBL2基因基因型频率、等位基因频率及遗传参数
        2.4 物种间MBL2基因同源性分析
        2.5 牛MBL2基因5'调控区生物信息学分析
        2.6 MBL-C蛋白质二级结构域预测
        2.7 相关性分析
            2.7.1 不同基因型与精液品质的相关性
            2.7.2 不同基因型与公牛后裔生产性能及乳房炎抗性的相关性
    3 讨论
        3.1 MBL2基因座位群体遗传特性分析
        3.2 牛MBL2基因5'调控区生物信息学分析
        3.3 蛋白质结构分析
        3.4 MBL2基因多态性与精液品质的相关性
        3.5 MBL2基因多态性与后裔产奶性能及乳房炎抗性的相关性
    参考文献
第三章 MBL2基因在健康和患乳房炎奶牛中的表达差异
    1 材料与方法
        1.1 材料
            1.1.1 组织样品
            1.1.2 主要仪器设备
            1.1.3 药品及试剂
        1.2 实验方法
            1.2.1 引物设计
            1.2.2 总RNA的提取
            1.2.3 反转录
            1.2.4 荧光定量PCR
    2 结果与分析
        2.1 总RNA的提取及质量
        2.2 健康和患乳房炎奶牛不同组织中MBL2基因表达
    3 讨论
    参考文献
全文结论
研究创新点
附录
攻读学位期间发表的论文
致谢


【参考文献】：
期刊论文
[1]荷斯坦牛HSP70-1和HSP32基因SNP位点与生产性能及乳房炎抗性的相关性研究[J]. 蒋小强,白井岩,吴洁,李莲,李倩倩,王根林.  南京农业大学学报. 2013(03)
[2]奶牛遗传改良——牧场效益的重要基础[J]. 张沅.  中国乳业. 2013(01)
[3]c-myb转录因子与细胞增殖分化[J]. 范晨,王梁华,焦炳华.  生命的化学. 2011(05)
[4]MBL1基因第一内含子与第二外显子多态性与中国荷斯坦牛乳腺炎和乳品质的关联分析[J]. 刘梅,鞠志花,李秋玲,王洪梅,黄金明,李建斌,仲跻峰,王长法.  中国农业科学. 2010(11)
[5]反复自然流产患者甘露聚糖结合凝集素和生殖相关抗体的检测及意义[J]. 张金蓉,王艾丽,党洁明.  中国实验诊断学. 2008(10)
[6]奶牛产奶性状候选基因研究进展[J]. 张晓东,殷宗俊.  中国奶牛. 2007(11)
[7]男性不育症患者X染色体雄激素受体基因外显子1、3、4状态筛选研究[J]. 魏魏,董长垣,刘军,苗聪秀.  中国优生与遗传杂志. 2007(06)
[8]北美种公牛选育与后裔测定方法简介[J]. 张胜利,石万海.  中国奶牛. 2007(S1)
[9]后裔测定青年公牛的标记辅助BLUP选择[J]. 张豪,张沅,张勤.  科学通报. 2002(20)
[10]标记与QTL不完全连锁下标记辅助选择的相对效率[J]. 刘会英,张勤,张沅.  科学通报. 2001(15)

硕士论文
[1]荷斯坦公牛SPAG11基因、Tf基因多态性及与精子质量性状的关联性分析[D]. 刘新颜.山东师范大学 2011



本文编号：3617934