不同生物型BVDV的NS2-3基因生物信息学分析

发布时间：2022-02-15 20:39

　　为了探索牛病毒性腹泻病毒（Bovine viral diarrhea-mucosal virus, BVDV）NS2-3基因的生物学特征,试验以不同生物型（ncp型和cp型）BVDV NS2-3基因序列及其蛋白氨基酸序列为研究对象,应用生物信息学软件对不同生物型BVDV的NS2-3基因序列同源性、遗传进化关系、磷酸化位点、糖基化位点、酰基化位点、信号肽、亚细胞定位、同源重组及B细胞线性表位进行预测分析。结果表明:ncp JL株NS2-3基因核苷酸序列与ncp PI285株同源性较高,cp Singer Arg株NS2-3基因核苷酸序列与cp/ncp NADL株同源性较高;ncp JL株与ncp Nebraska株及ncp PI285株遗传进化关系较近,cp Singer Arg株与cp/ncp NADL株、cp BVDV-1株遗传进化关系较近;不同生物型NS2-3蛋白所含磷酸化位点及糖基化位点数量不同,但均含有信号肽;ncp JL株NS2-3蛋白定位于宿主细胞核,而cp Singer Arg株NS2-3蛋白定位于宿主细胞核和宿主细胞质中;ncp JL株和cp Singer Arg株都与... 

【文章来源】：黑龙江畜牧兽医. 2020,(23)北大核心

【文章页数】：6 页

【文章目录】：
1 材料
    1.1 毒株
    1.2 参考株
2 方法
    2.1 NS2-3基因核苷酸序列同源性分析
    2.2 遗传进化树的构建
    2.3 磷酸化位点预测
    2.4 糖基化位点、酰基化位点预测
    2.5 信号肽位点预测
    2.6 亚细胞定位分析
    2.7 同源重组分析
    2.8 B细胞线性表位预测
3 结果与分析
    3.1 NS2-3基因核苷酸序列同源性分析
    3.2 遗传进化树的构建
    3.3 磷酸化位点预测
    3.4 糖基化、酰基化位点预测
    3.5 信号肽位点预测
    3.6 亚细胞定位分析
    3.7 同源重组分析
    3.8 B细胞线性表位预测
4 讨论
5 结论


【参考文献】：
期刊论文
[1]牛病毒性腹泻病毒研究进展[J]. 韩慧,郑源强,石艳春.  畜禽业. 2019(07)
[2]牛病毒性腹泻病毒非结构蛋白研究进展[J]. 姚泽慧,刁乃超,李大帅,田甜,董守艺,童婷蓉,蔺晓谕,王慧慧,时坤,杜锐.  动物医学进展. 2019(07)
[3]牛病毒性腹泻病毒检测技术研究进展[J]. 于志超,陈林军,赵治国,崔强,延涵,王海艳,赵林立,李刚,郭文丽.  动物医学进展. 2019(01)
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[5]牦牛HSPB6基因的生物信息学和表达分析[J]. 刘东花,卫阳飞.  华北农学报. 2016(01)
[6]信号肽及其在蛋白质表达中的应用[J]. 韦雪芳,王冬梅,刘思,周鹏.  生物技术通报. 2006(06)
[7]蛋白糖基化与免疫[J]. 章晓联.  中国免疫学杂志. 2004(04)



本文编号：3627232