miR-34b通过靶向SYISL调节成肌细胞增殖和分化
发布时间:2022-02-24 18:04
在畜牧生产中,骨骼肌生长发育及品质性状是评价产肉动物产肉性能的重要指标。在骨骼肌发育的调控网络中,非编码基因起着相当重要的调控作用,如目前研究较多的microRNA和lncRNA。本实验室前期发现长链非编码RNA-SYISL能够促进成肌细胞增殖,抑制成肌细胞分化。基于此,本研究通过生物信息学分析,预测miR-34b能够结合SYISL,首先利用对miR-34b的抑制和过表达技术研究了miR-34b对成肌细胞增殖和分化的影响,进一步的研究发现miR-34b可通过靶向SYISL来调控成肌细胞增殖和分化,具体的研究结果如下:1.利用荧光定量PCR技术研究了miR-34b在小鼠不同组织中的表达情况,发现miR-34b在腿肌中高表达,且在C2C12细胞分化过程中表达量逐渐上升。利用荧光定量PCR、Western Blot和细胞免疫荧光技术研究了抑制和过表达miR-34b后对成肌细胞增殖和分化相关基因影响,结果表明miR-34b抑制成肌细胞增殖,促进成肌细胞分化。2.利用生物信息学分析、双荧光素酶报告载体实验、RNA pull-down实验和RNA结合蛋白免疫沉淀(RNA Binding Prote...
【文章来源】:华中农业大学湖北省211工程院校教育部直属院校
【文章页数】:78 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
ABSTRACT
缩略词表
第一章 文献综述
1 骨骼肌生长发育及调控
1.1 骨骼肌的生长发育起源
1.2 骨骼肌增殖和分化的调控过程
2 非编码RNA特征及其在肌肉生长发育过程中的功能
2.1 非编码RNA的分类
2.2 MicroRNA
2.2.1 MicroRNA的生物发生
2.2.2 MicroRNA的作用机制
2.2.3 MicroRNA在肌肉发育中的作用
2.2.4 MiR-34 家族简介
2.3 长链非编码RNA(lncRNA)
2.3.1 LncRNA的基本特征
2.3.2 LncRNA与肌肉的生长发育
2.4 MicroRNA的研究方法
3 本研究的目的与意义
第二章 材料与方法
1 实验材料
1.1 细胞与动物
1.2 菌株和载体
1.3 主要试剂和试剂盒
1.4 常用试剂及配制
1.5 主要仪器和设备
1.6 应用的分析软件和生物信息学网站
2 试验方法
2.1 构建小鼠组织表达谱
2.1.1 小鼠组织样总RNA提取
2.1.2 RNA浓度和纯度检测
2.1.3 RNA反转录成c DNA
2.1.4 MiRNA茎环DNA的反转录
2.2 细胞培养
2.2.1 细胞复苏
2.2.2 细胞冻存
2.2.3 细胞的增殖培养
2.2.4 细胞的分化培养
2.3 MiR-34b抑制剂和模拟物的设计合成
2.4 SYISL双荧光素酶报告基因载体的构建
2.4.1 SYISL cDNA的克隆
2.4.2 琼脂糖凝胶电泳和成像
2.4.3 PCR产物的回收和克隆测序
2.5 pmirGLO-SYISL突变载体的构建
2.6 细胞转染
2.6.1 脂质体介导的微小RNA和超表达质粒的转染
2.6.2 脂质体介导的SYISL双荧光载体细胞转染及双荧光测定
2.7 细胞总RNA提取和c DNA制备
2.8 荧光定量PCR
2.8.1 荧光定量PCR体系
2.8.2 定量数据分析
2.8.3 荧光定量PCR引物
2.9 细胞和组织蛋白提取及浓度测定
2.10 Western Blot实验
2.10.1 SDS-PAGE凝胶制备
2.10.2 SDS-PAGE凝胶电泳
2.10.3 转膜
2.10.4 抗原抗体免疫反应
2.10.5 ECL化学发光检测
2.11 EdU染色
2.12 免疫荧光分析
2.13 RNA免疫沉淀(RIP)
2.13.1 裂解产物的准备
2.13.2 磁珠的准备
2.13.3 RNA沉淀反应
2.13.4 RNA的纯化
2.13.5 cDNA的合成
2.14 RNA pull-down实验
2.14.1 SYISL基因体外转录载体构建
2.14.2 SYISL基因体外转录
2.15 数据统计与分析
第三章 结果与分析
1 MiR-34b的组织表达谱
2 MiR-34b在成肌细胞不同分化时期的表达情况
3 MiR-34b对成肌细胞增殖的影响
3.1 MiR-34b inhibitor对 miR-34b的抑制效率检测
3.2 抑制miR-34b对成肌细胞增殖的影响
3.3 过表达miR-34b对成肌细胞增殖的影响
4 MiR-34b对成肌细胞分化的影响
4.1 抑制miR-34b对成肌细胞分化的影响
4.2 过表达miR-34b对成肌分化的影响
5 MiR-34b对 SYISL的影响
5.1 生物信息学预测miR-34b可靶向SYISL
5.2 SYISL双荧光素酶报告载体的构建和鉴定
5.3 在C2C12和Hela细胞中验证miR-34b与 SYISL结合
5.4 体外实验验证miR-34b可直接与SYISL和 AGO2 结合
5.5 miR-34b下调SYISL的表达量
6 MiR-34b通过靶向SYISL调节成肌细胞增殖和分化
7 MiR-34b促进SYNPO2 的表达
第四章 讨论
1 MiR-34b靶向SYISL
2 MiR-34b在成肌细胞增殖和分化过程中的功能
3 MiR-34b通过靶向SYISL调节成肌细胞增殖和分化
4 MiR-34b对 SYNPO2 基因表达的影响
第五章 小结
1 本研究主要结论
2 主要创新点
3 下一步计划
参考文献
致谢
本文编号:3643249
【文章来源】:华中农业大学湖北省211工程院校教育部直属院校
【文章页数】:78 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
ABSTRACT
缩略词表
第一章 文献综述
1 骨骼肌生长发育及调控
1.1 骨骼肌的生长发育起源
1.2 骨骼肌增殖和分化的调控过程
2 非编码RNA特征及其在肌肉生长发育过程中的功能
2.1 非编码RNA的分类
2.2 MicroRNA
2.2.1 MicroRNA的生物发生
2.2.2 MicroRNA的作用机制
2.2.3 MicroRNA在肌肉发育中的作用
2.2.4 MiR-34 家族简介
2.3 长链非编码RNA(lncRNA)
2.3.1 LncRNA的基本特征
2.3.2 LncRNA与肌肉的生长发育
2.4 MicroRNA的研究方法
3 本研究的目的与意义
第二章 材料与方法
1 实验材料
1.1 细胞与动物
1.2 菌株和载体
1.3 主要试剂和试剂盒
1.4 常用试剂及配制
1.5 主要仪器和设备
1.6 应用的分析软件和生物信息学网站
2 试验方法
2.1 构建小鼠组织表达谱
2.1.1 小鼠组织样总RNA提取
2.1.2 RNA浓度和纯度检测
2.1.3 RNA反转录成c DNA
2.1.4 MiRNA茎环DNA的反转录
2.2 细胞培养
2.2.1 细胞复苏
2.2.2 细胞冻存
2.2.3 细胞的增殖培养
2.2.4 细胞的分化培养
2.3 MiR-34b抑制剂和模拟物的设计合成
2.4 SYISL双荧光素酶报告基因载体的构建
2.4.1 SYISL cDNA的克隆
2.4.2 琼脂糖凝胶电泳和成像
2.4.3 PCR产物的回收和克隆测序
2.5 pmirGLO-SYISL突变载体的构建
2.6 细胞转染
2.6.1 脂质体介导的微小RNA和超表达质粒的转染
2.6.2 脂质体介导的SYISL双荧光载体细胞转染及双荧光测定
2.7 细胞总RNA提取和c DNA制备
2.8 荧光定量PCR
2.8.1 荧光定量PCR体系
2.8.2 定量数据分析
2.8.3 荧光定量PCR引物
2.9 细胞和组织蛋白提取及浓度测定
2.10 Western Blot实验
2.10.1 SDS-PAGE凝胶制备
2.10.2 SDS-PAGE凝胶电泳
2.10.3 转膜
2.10.4 抗原抗体免疫反应
2.10.5 ECL化学发光检测
2.11 EdU染色
2.12 免疫荧光分析
2.13 RNA免疫沉淀(RIP)
2.13.1 裂解产物的准备
2.13.2 磁珠的准备
2.13.3 RNA沉淀反应
2.13.4 RNA的纯化
2.13.5 cDNA的合成
2.14 RNA pull-down实验
2.14.1 SYISL基因体外转录载体构建
2.14.2 SYISL基因体外转录
2.15 数据统计与分析
第三章 结果与分析
1 MiR-34b的组织表达谱
2 MiR-34b在成肌细胞不同分化时期的表达情况
3 MiR-34b对成肌细胞增殖的影响
3.1 MiR-34b inhibitor对 miR-34b的抑制效率检测
3.2 抑制miR-34b对成肌细胞增殖的影响
3.3 过表达miR-34b对成肌细胞增殖的影响
4 MiR-34b对成肌细胞分化的影响
4.1 抑制miR-34b对成肌细胞分化的影响
4.2 过表达miR-34b对成肌分化的影响
5 MiR-34b对 SYISL的影响
5.1 生物信息学预测miR-34b可靶向SYISL
5.2 SYISL双荧光素酶报告载体的构建和鉴定
5.3 在C2C12和Hela细胞中验证miR-34b与 SYISL结合
5.4 体外实验验证miR-34b可直接与SYISL和 AGO2 结合
5.5 miR-34b下调SYISL的表达量
6 MiR-34b通过靶向SYISL调节成肌细胞增殖和分化
7 MiR-34b促进SYNPO2 的表达
第四章 讨论
1 MiR-34b靶向SYISL
2 MiR-34b在成肌细胞增殖和分化过程中的功能
3 MiR-34b通过靶向SYISL调节成肌细胞增殖和分化
4 MiR-34b对 SYNPO2 基因表达的影响
第五章 小结
1 本研究主要结论
2 主要创新点
3 下一步计划
参考文献
致谢
本文编号:3643249
本文链接:https://www.wllwen.com/yixuelunwen/dongwuyixue/3643249.html