山羊LPL基因遗传多态性及其与肌内脂肪含量的关联分析
发布时间：2022-07-03 19:59
脂蛋白脂酶（Lipoprotein lipase, LPL）基因是一种在脂肪代谢过程中起关键作用的蛋白水解酶。LPL基因已被看做是影响IMF的候选基因。提高山羊脂肪沉积能力,有利于获得与山羊肌肉脂肪性状相关的标记位点。本研究选用安徽白山羊、波尔山羊、马头山羊、济宁青山羊、岷山黑裘皮羊、临朐奶山羊等6种山羊群体为试验动物,采用PCR-SSCP分析方法研究LPL基因的多态型,并运用GLM模型,对检测出来的的SNP及其与羊IMF的关联分析。1.根据GenBank上公开发表的相关山羊LPL基因,设计引物P1-P1o,应用PCR-SSCP分析方法在LPL基因上发现P1-SSCP多态位点,该位点上具有五种基因型AA、BB、AB、AC 和 BC。序列测定结果表明,P1-SSCP的变异是由碱基G→287A的替换造成的。在P6-SSCP多态位点上发现三种基因型AA、BB、 AB。序列测定结果表明,P6-SSCP变异是由碱基G→16997A的替换造成,Gln→Ser。 在?P7-SSCP多态位点上发现三种基因型AA、 BB、 AB。序列测定结果表明,P7-SSCP变异是由碱基A→18313C替换造成,导致...
【文章页数】：57 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
Abstract
前言
1 脂蛋白脂酶基因(LPL)的研究进展
1.1 LPL基因的定位及序列分析
1.2 人类LPL的研究进展及其在疾病上的研究
1.3 猪的LPL基因研究进展
1.4 牛的LPL研究进展
1.5 禽类的LPL研究进展
2 SNP研究与PCR-SSCP方法
2.1 SNP及其研究方法
2.2 SSCP技术的建立、原理及其特点
2.3 PCR-SSCP方法与肌内脂肪性状的研究进展
3 研究目的与意义
第二章 材料与方法
1 试验群体
2 试验器材及试剂、软件
2.1 主要仪器设备
2.2 主要药品和试剂
2.3 软件工具
3 主要试剂的配置方法
3.1 溶液配制
4 试验方法
4.1 肌内脂肪含量(IMF)测定
4.2 血液DNA的提取
5 试验引物设计与筛选
6 PCR扩增与产物检测
6.1 引物的稀释分装
6.2 PCR反应体系及反应程序的建立
6.3 10%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳
6.4 多态片段的回收纯化与测序
7 统计分析方法
7.1 基因频率和基因型频率的计算
7.2 不同位点遗传多态性分析
7.3 基因型效应与肌内脂肪含量的关联分析
三.结果与分析
1 山羊血液中DNA基因组提取结果
2 山羊LPL第1外显子克隆及序列分析
2.1 PCR扩增结果
2.2 山羊LPL第1外显子PCR-SSCP结果
2.3 山羊LPL基因第1外显子G-287A多态位点的遗传分析结果
3 山羊LPL第6外显子克隆及序列分
3.1 PCR扩增结果
3.2 山羊LPL第6外显子PCR-SSCP结果
3.3 山羊LPL基因第6外显子G-16997A多态位点的遗传分析结果
4 山羊LPL第7外显子克隆及序列分析
4.1 PCR扩增结果
4.2 山羊LPL基因第7外显子多态位点的遗传分析结果
4.3 山羊LPL基因第7外显子A-18313C多态位点的遗传分析结果
5 群体动力学分析
5.1 群体间SNP分布
5.2 LPL三处突变位点基因型与品种的关系
5.3 不同基因型与脂肪沉积的相关性
5.4 LPL-P1、P6、P7位点多态性与脂肪沉积的相关性
5.5 6个山羊群体间的遗传距离分析
5.6 6个山羊群体的系统发育分析
第四章 讨论
1 血液样品的采集
2 影响PCR扩增的因素
3 PCR-SSCP技术的主要影响因素
4 山羊LPL基因多态性及其与脂肪沉积关联分析
第五章 结论
参考文献
致谢
个人简介
【参考文献】：
期刊论文
[1]肌肉生成抑制素基因多态性与鹅肌内脂肪沉积的相关性分析[J]. 汤青萍,章双杰,郭军,邹剑敏. 现代农业科技. 2011(17)
[2]中国西门塔尔牛MC3R和MC4R基因组织表达谱及其在脂肪组织中表达水平与背膘厚度的相关性研究[J]. 黄萌,许尚忠,李俊雅,高雪,陈金宝. 畜牧兽医学报. 2011(04)
[3]猪THRSP基因5′侧翼区序列转录调控活性的鉴定[J]. 陈华,陈宏权,周倩倩,张翼鹏,魏汉卿,李春苗,章孝荣,彭英林. 畜牧兽医学报. 2011(03)
[4]猪甲状腺激素应答Spot14基因编码区多态性与猪产脂能力的关联性[J]. 周倩倩,陈宏权,魏汉卿,秦婕,陈华,张翼鹏. 生物化学与生物物理进展. 2011(01)
[5]猪脂肪细胞决定和分化因子1基因（ADD1）中一个新SNP的特性及其对肉质性状影响[J]. 李长龙,萨晓婴,高会江,孟和,潘玉春. 农业生物技术学报. 2010(04)
[6]猪FIT1基因第2外显子多态性与猪脂肪沉积性状的相关性[J]. 李德臻,何君贤,雷明刚,徐德全,蒋思文,熊远著. 遗传. 2010(04)
[7]绵羊肌肉IGF-Ⅰ基因表达的发育性变化研究（英文）[J]. 黄治国,谢庄. Agricultural Science ＆ Technology. 2009(02)
[8]猪LPL基因部分序列的克隆及多态性分析[J]. 王研,谢雨彤,刘娣. 中国农学通报. 2009(06)
[9]陕北白绒山羊HSL基因外显子1的SNPs及其与部分生产性状的相关分析[J]. 刘俊霞,罗军,滕炎玲,绳贺军,林先滋,余刚. 西北农林科技大学学报(自然科学版). 2009(01)
[10]山羊IGFBP-3基因的遗传分析及其与经济性状的关系[J]. 李美玉,李兰,闵令江,王建民. 畜牧兽医学报. 2008(12)
博士论文
[1]延边黄牛肉质性状相关功能基因研究[D]. 金鑫.延边大学 2010
[2]猪脂蛋白脂酶（LPL）和激素敏感脂肪酶（HSL）基因的序列和多态性分析及体外表达的研究[D]. 张振波.华中农业大学 2005
硕士论文
[1]猪肌内脂肪含量候选基因H-FABP研究及预测模型构建[D]. 马小军.中国农业科学院 2012
[2]昭乌达羊肉与乌拉特羊肉肉品质特性及其PRKAG3、LPL、PPAR基因表达差异的研究[D]. 陶晓臣.内蒙古农业大学 2011
[3]牦牛LPL和H-FABP基因多态与生长发育性状相关性研究[D]. 邢成锋.中国农业科学院 2009
[4]滩羊H-FABP基因和ADD1基因遗传多态性及其与肌内脂肪含量的关联分析[D]. 乔海云.中国农业科学院 2009
[5]鸡H-FABP基因PCR-SSCP分析及其与脂肪性状的相关研究[D]. 王彦.四川农业大学 2006
[6]长金猪及其肉质性状候选基因的研究[D]. 孙万元.浙江大学 2004
本文编号：3655552
【文章页数】：57 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
Abstract
前言
1 脂蛋白脂酶基因(LPL)的研究进展
1.1 LPL基因的定位及序列分析
1.2 人类LPL的研究进展及其在疾病上的研究
1.3 猪的LPL基因研究进展
1.4 牛的LPL研究进展
1.5 禽类的LPL研究进展
2 SNP研究与PCR-SSCP方法
2.1 SNP及其研究方法
2.2 SSCP技术的建立、原理及其特点
2.3 PCR-SSCP方法与肌内脂肪性状的研究进展
3 研究目的与意义
第二章 材料与方法
1 试验群体
2 试验器材及试剂、软件
2.1 主要仪器设备
2.2 主要药品和试剂
2.3 软件工具
3 主要试剂的配置方法
3.1 溶液配制
4 试验方法
4.1 肌内脂肪含量(IMF)测定
4.2 血液DNA的提取
5 试验引物设计与筛选
6 PCR扩增与产物检测
6.1 引物的稀释分装
6.2 PCR反应体系及反应程序的建立
6.3 10%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳
6.4 多态片段的回收纯化与测序
7 统计分析方法
7.1 基因频率和基因型频率的计算
7.2 不同位点遗传多态性分析
7.3 基因型效应与肌内脂肪含量的关联分析
三.结果与分析
1 山羊血液中DNA基因组提取结果
2 山羊LPL第1外显子克隆及序列分析
2.1 PCR扩增结果
2.2 山羊LPL第1外显子PCR-SSCP结果
2.3 山羊LPL基因第1外显子G-287A多态位点的遗传分析结果
3 山羊LPL第6外显子克隆及序列分
3.1 PCR扩增结果
3.2 山羊LPL第6外显子PCR-SSCP结果
3.3 山羊LPL基因第6外显子G-16997A多态位点的遗传分析结果
4 山羊LPL第7外显子克隆及序列分析
4.1 PCR扩增结果
4.2 山羊LPL基因第7外显子多态位点的遗传分析结果
4.3 山羊LPL基因第7外显子A-18313C多态位点的遗传分析结果
5 群体动力学分析
5.1 群体间SNP分布
5.2 LPL三处突变位点基因型与品种的关系
5.3 不同基因型与脂肪沉积的相关性
5.4 LPL-P1、P6、P7位点多态性与脂肪沉积的相关性
5.5 6个山羊群体间的遗传距离分析
5.6 6个山羊群体的系统发育分析
第四章 讨论
1 血液样品的采集
2 影响PCR扩增的因素
3 PCR-SSCP技术的主要影响因素
4 山羊LPL基因多态性及其与脂肪沉积关联分析
第五章 结论
参考文献
致谢
个人简介
【参考文献】：
期刊论文
[1]肌肉生成抑制素基因多态性与鹅肌内脂肪沉积的相关性分析[J]. 汤青萍,章双杰,郭军,邹剑敏. 现代农业科技. 2011(17)
[2]中国西门塔尔牛MC3R和MC4R基因组织表达谱及其在脂肪组织中表达水平与背膘厚度的相关性研究[J]. 黄萌,许尚忠,李俊雅,高雪,陈金宝. 畜牧兽医学报. 2011(04)
[3]猪THRSP基因5′侧翼区序列转录调控活性的鉴定[J]. 陈华,陈宏权,周倩倩,张翼鹏,魏汉卿,李春苗,章孝荣,彭英林. 畜牧兽医学报. 2011(03)
[4]猪甲状腺激素应答Spot14基因编码区多态性与猪产脂能力的关联性[J]. 周倩倩,陈宏权,魏汉卿,秦婕,陈华,张翼鹏. 生物化学与生物物理进展. 2011(01)
[5]猪脂肪细胞决定和分化因子1基因（ADD1）中一个新SNP的特性及其对肉质性状影响[J]. 李长龙,萨晓婴,高会江,孟和,潘玉春. 农业生物技术学报. 2010(04)
[6]猪FIT1基因第2外显子多态性与猪脂肪沉积性状的相关性[J]. 李德臻,何君贤,雷明刚,徐德全,蒋思文,熊远著. 遗传. 2010(04)
[7]绵羊肌肉IGF-Ⅰ基因表达的发育性变化研究（英文）[J]. 黄治国,谢庄. Agricultural Science ＆ Technology. 2009(02)
[8]猪LPL基因部分序列的克隆及多态性分析[J]. 王研,谢雨彤,刘娣. 中国农学通报. 2009(06)
[9]陕北白绒山羊HSL基因外显子1的SNPs及其与部分生产性状的相关分析[J]. 刘俊霞,罗军,滕炎玲,绳贺军,林先滋,余刚. 西北农林科技大学学报(自然科学版). 2009(01)
[10]山羊IGFBP-3基因的遗传分析及其与经济性状的关系[J]. 李美玉,李兰,闵令江,王建民. 畜牧兽医学报. 2008(12)
博士论文
[1]延边黄牛肉质性状相关功能基因研究[D]. 金鑫.延边大学 2010
[2]猪脂蛋白脂酶（LPL）和激素敏感脂肪酶（HSL）基因的序列和多态性分析及体外表达的研究[D]. 张振波.华中农业大学 2005
硕士论文
[1]猪肌内脂肪含量候选基因H-FABP研究及预测模型构建[D]. 马小军.中国农业科学院 2012
[2]昭乌达羊肉与乌拉特羊肉肉品质特性及其PRKAG3、LPL、PPAR基因表达差异的研究[D]. 陶晓臣.内蒙古农业大学 2011
[3]牦牛LPL和H-FABP基因多态与生长发育性状相关性研究[D]. 邢成锋.中国农业科学院 2009
[4]滩羊H-FABP基因和ADD1基因遗传多态性及其与肌内脂肪含量的关联分析[D]. 乔海云.中国农业科学院 2009
[5]鸡H-FABP基因PCR-SSCP分析及其与脂肪性状的相关研究[D]. 王彦.四川农业大学 2006
[6]长金猪及其肉质性状候选基因的研究[D]. 孙万元.浙江大学 2004
本文编号：3655552
本文链接：https://www.wllwen.com/yixuelunwen/dongwuyixue/3655552.html
