10株广西猪圆环病毒3型（PCV3）全基因组序列的遗传变异分析

发布时间：2022-07-08 15:05

　　为了解广西猪群猪圆环病毒3型（PCV3）的遗传变异情况,以PCV3阳性DNA为模板,利用PCR的方法分2段扩增PCV3全基因序列并进行拼接,获得10株PCV3全基因组序列,全长均为2 000 bp。10株广西PCV3全基因组序列之间的核苷酸同源性为98.6%～99.8%。与国内其他毒株的同源性为97.9%～99.8%;与国外其他毒株的同源性为98.8%～99.7%。10株广西PCV3 Cap基因的大小均为645 bp,编码214 aa。PCV3 Cap基因比较保守,10株广西PCV3 Cap基因与参考株相比,仅存在散在的突变位点。基于PCV3全基因和Cap基因构建的遗传进化树显示,两者结果基本相同,10株广西PCV3处于3a和3b两个亚群。本试验表明,广西地区猪群中流行的PCV3至少存在2个亚群,不同亚群PCV3毒株的致病性差异还有待进一步的研究。 

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【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 毒株来源
    1.2 主要试剂
    1.3 引物的设计与合成
    1.4 PCV3阳性样品DNA的提取
    1.5 PCV3 全基因组序列的扩增及测序
    1.6 序列分析和遗传进化树构建分析
2 结果
    2.1 PCV3全基因组的PCR扩增和序列测定
    2.2 PCV3全基因组序列测序分析
    2.3 PCV3全基因组遗传进化分析
    2.4 PCV3 Cap基因序列分析
3 讨论


【参考文献】：
期刊论文
[1]华南地区猪圆环病毒3型感染的分子流行病学调查与分析[J]. 刘相聪,申翰钦,张鹏飞,黎嘉豪,刘燕玲,张乐宜,宋长绪.  畜牧与兽医. 2018(06)



本文编号：3657246