中国地鼠口腔鳞癌相关circRNA的筛选及hsa c irc 0 127523功能机制的初步研究

发布时间：2022-07-08 15:24

　　目的:建立中国地鼠颊囊口腔鳞癌动物模型,通过二代高通量测序技术建立circRNA差异表达谱,并对筛选获得的差异极显著circRNAs进行表达水平的验证,结合数据库筛选出在口腔癌中起关键作用的hsa_circ₀12752,并在人口腔鳞癌细胞系中研究其功能作用。方法:通过二甲基苯丙蒽（9,10-Dimethy1-1,2-Benzanthracence,DMBA）涂抹法成功建立中国地鼠口腔鳞癌动物模型,HE染色观察病理结构和透射电镜观察超微结构对模型进行评价;对高通量测序结果的数据进行整合分析,筛选差异表达的circRNA并在组织样本中进行qRT-PCR表达量验证;通过miRanda（v3.3a）软件预测circRNA-miRNA-mRNA靶向关系并进行了qRT-PCR表达水平测定;结合UCSC、circBase和circBank数据库筛选到人口腔癌中差异表达的hsa_circ₀127523,在细胞水平通过CCK-8实验和Transwell小室实验检测hsa_circ₀

【文章页数】：89 页

【学位级别】：硕士

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中文摘要
Abstract
常用缩写词中英文对照表
前言
第一部分 中国地鼠口腔鳞癌动物模型建立
    1 材料与方法
        1.1 实验动物
        1.2 仪器与试剂
        1.3 实验方法
    2 结果
        2.1 中国地鼠口腔鳞癌模型肉眼观察
        2.2 中国地鼠口腔鳞癌颊囊组织光镜观察
        2.3 中国地鼠口腔鳞癌颊囊组织电镜超微结构观察
    3 讨论
    4 结论
第二部分 中国地鼠口腔颊囊组织中circRNA的全转录组测序及分析
    1 材料与方法
        1.1 动物组织
        1.2 仪器与试剂
        1.3 实验方法
        1.4 统计分析
    2 结果
        2.1 颊囊组织中RNA质检
        2.2 颊囊组织样本间相关性分析
        2.3 颊囊组织样本主成分分析(PCA)
        2.4 差异表达circRNAs的统计
        2.5 差异表达circRNAs聚类图和火山图分析
        2.6 差异circRNAs来源的宿主基因GO功能分析
        2.7 差异circRNAs来源的宿主基因KEGG通路分析
        2.8 circRNA与miRNA相互作用预测及构建互作网状图
        2.9 差异circRNA的表达量和环状结构验证
    3 讨论
    4 结论
第三部分 hsa_circ_0127523的验证及其对口腔鳞癌细胞生物学功能的影响
    1 材料与方法
        1.1 实验细胞
        1.2 仪器与试剂
        1.3 实验方法
        1.4 统计分析
    2 结果
        2.1 hsa_circ_0127523的分子结构
        2.2 检测si-hsa_circ_0127523在口腔癌细胞中的干扰效率
        2.3 沉默hsa_circ_0127523能够抑制口腔鳞癌细胞的增殖
        2.4 降低hsa_circ_0127523表达抑制口腔鳞癌细胞迁移及侵袭能力
        2.5 hsa_circ_0127523的靶miRNAs预测及表达量验证
    3 讨论
    4 结论
参考文献
综述
    参考文献
致谢
个人简介


【参考文献】：
期刊论文
[1]水牛PPARG来源环状RNA的鉴定及表达谱分析[J]. 冯雪,洪慧颖,孙晓菲,亐开兴,黄必志,魏雪锋,马云,黄洁萍.  中国畜牧兽医. 2019(12)
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[4]7,12-二甲基苯并[a]蒽诱发叙利亚地鼠颊鳞状细胞癌模型中Th1/Th2、Th17/Treg平衡变化研究[J]. 田原野,李洪远,李君萍,唐瞻贵.  口腔医学研究. 2018(12)
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博士论文
[1]CircEZH2靶向miR-22抑制TGEV诱导的线粒体损伤作用与机制研究[D]. 马雪连.西北农林科技大学 2019
[2]血浆外泌体miRNA作为早期肺腺癌诊断标记物研究[D]. 温佳新.中国人民解放军医学院 2019
[3]miR-29b沉默Ⅰ型胶原基因抑制青光眼手术后滤过道瘢痕形成的实验研究[D]. 李宁.中南大学 2012

硕士论文
[1]lncRNA DARS-AS1与PCBP1结合正反馈调控HIF通路促进乳腺癌转移的研究以及ALYREF在乳腺癌中的细胞功能研究[D]. 周祥明.广东药科大学 2019



本文编号：3657272