3株临床分离的猪流行性腹泻病毒S基因克隆及序列分析

发布时间：2022-07-09 16:01

　　对临床分离鉴定的3株猪流行性腹泻病毒（PEDV）的S基因进行克隆及序列分析,对丰富我国PEDV的遗传衍化特征具有重要意义。S基因序列分析发现,JX18毒株与CV777亲缘关系较近,核苷酸同源性为99.71%,氨基酸同源性95.7%,属于G1-b进化分支。JX18毒株与CV777经典毒株S蛋白氨基酸序列相比较,不存在氨基酸的插入或缺失,在中和表位区及已鉴定抗原表位区仅有一处氨基酸突变。SD18、JingTai18与PEDV CV777亲缘关系较远,核苷酸同源性分别为93.64%和92.64%,S蛋白氨基酸序列同源性分别为93%和93.5%。SD18和JingTai18位于G2-b进化分支。SD18与JingTai18株与CV777经典毒株相比,S蛋白氨基酸序列中存在插入缺失及多位点的氨基酸突变。研究结果为进一步了解我国PEDV流行及变异情况提供了数据支持。 

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【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 材料
        1.1.1 试剂
        1.1.2 毒株
        1.1.3 仪器设备
    1.2 方法
        1.2.1 引物设计
        1.2.2 S基因扩增
        1.2.3 PEDV S基因蛋白质序列分析
2 结果
    2.1 PEDV S基因RT-PCR结果
    2.2 PEDV S基因序列及蛋白质序列分析
    2.3 PEDV S蛋白遗传进化分析
3 讨论


【参考文献】：
期刊论文
[1]PEDV中国流行株和疫苗株S蛋白免疫反应性差异分析[J]. 陈静,杨盼盼,雷喜梅,王晓梦,高冬生,常洪涛,杨霞,陈陆,赵军,王川庆.  中国兽医学报. 2015(10)
[2]猪流行性腹泻病毒S基因研究进展[J]. 陈弟诗,任玉鹏,张斌,李丽,聂艳如,周莉媛.  动物医学进展. 2014(07)
[3]PEDV S蛋白B细胞抗原表位的筛选和鉴定[J]. 孙东波,朗洪武,时洪艳,陈建飞,崔晓辰,王承宝,佟有恩,冯力.  生物化学与生物物理进展. 2007(09)



本文编号：3657404