宁夏地区牛源金黄色葡萄球菌β-内酰胺酶的分析及作用方式的研究
发布时间:2022-07-13 20:34
旨在深入了解宁夏地区牛源金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus, SA)所产生β-内酰胺酶的进化及结构特征并揭示其作用方式。分别以药敏试验和PCR方法检测5种β-内酰胺类药物耐药情况和耐药基因;通过生物信息学手段对检出的β-内酰胺酶BlaZ作进化分析及结构功能预测;利用分子对接和动力学模拟,分析BlaZ的作用方式。结果表明,青霉素类药物的耐药率明显高于头孢菌素;blaZ基因检出率为82.37%,并检出SA中较少报道的blaZTEM-1基因,检出率为26.05%;进化分析可知,BlaZ属于A型β-内酰胺酶,包含63个重要且承受进化压力的踪迹残基;分子对接发现,BlaZ易与青霉素类药物及阿维巴坦等抑制剂结合并形成稳定复合物;动力学模拟显示,BlaZ的结构柔性小于同型酶TEM-1和TEM-52,其中Ω-loop区域柔性存在差异(P<0.05)且能影响与药物的作用,即该区域柔性与结合活性呈正相关;BlaZ分别与氨苄西林和头孢噻呋结合时结构稳定性差异显著(P<0.05)。宁夏地区牛源SA产生的β-内酰胺酶BlaZ属A型,并从菌株中检出blaZ...
【文章页数】:11 页
【文章目录】:
1 材料与方法
1.1 材料
1.1.1 试验菌株
1.1.2 培养基及试剂
1.2 方法
1.2.1 药敏试验
1.2.2 基因组DNA提取
1.2.3 β-内酰胺酶基因检测
1.2.4 进化分析
1.2.5 结构预测
1.2.6 结构对比
1.2.7 分子对接
1.2.8 分子动力学模拟
2 结 果
2.1 药敏试验
2.2 β-内酰胺酶基因检测
2.3 进化分析
2.4 结构预测
2.5 结构对比
2.6 分子对接
2.7 分子动力学模拟
2.8 抑制剂与β-内酰胺酶作用分析
3 讨 论
4 结 论
本文编号:3660722
【文章页数】:11 页
【文章目录】:
1 材料与方法
1.1 材料
1.1.1 试验菌株
1.1.2 培养基及试剂
1.2 方法
1.2.1 药敏试验
1.2.2 基因组DNA提取
1.2.3 β-内酰胺酶基因检测
1.2.4 进化分析
1.2.5 结构预测
1.2.6 结构对比
1.2.7 分子对接
1.2.8 分子动力学模拟
2 结 果
2.1 药敏试验
2.2 β-内酰胺酶基因检测
2.3 进化分析
2.4 结构预测
2.5 结构对比
2.6 分子对接
2.7 分子动力学模拟
2.8 抑制剂与β-内酰胺酶作用分析
3 讨 论
4 结 论
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