鸭甲肝病毒3型SD1201株全基因组序列分析及部分致病性研究

发布时间：2022-07-14 12:24

　　鸭病毒性肝炎（Duck viral hepatitis, DVH）是由鸭肝炎病毒（Duck hepatitis virus,DHV）引起的雏鸭的一种高度致死性传染病，主要感染1～3周龄雏鸭。随着我国水禽业的发展，DVH发病率和死亡率均呈现上升趋势，已成为危害养鸭业健康发展的主要疾病之一。近年来，由鸭甲肝病毒3型（Duck hepatitisAvirus type3, DHAV-3）引起的DVH广泛流行于中国和韩国。DHAV-3型DVH的流行病学特点、临床症状和病理变化与DHAV-1型非常相似，所引起的DVH也难以鉴别。为深入了解DHAV-3基因组变异情况，本研究对1株DHAV-3山东分离株SD1201进行了全基因组序列测定分析与致病性研究。本研究主要包括以下内容：1、SD1201株DHAV-3的全基因组测序及结果分析本研究应用RT-PCR方法扩增了DHAV-3山东分离株SD1201的不同核酸片段，并对其进行了全基因组序列测定与分析。结果表明SD1201株的基因组结构为5’UTR-VP0-VP3-VP1-2A1-2A2-2B-2C-3A-3B-3C-3D-3’UTR，符合小核糖核酸病毒科... 

【文章页数】：58 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
符号及缩略词
目录
中文摘要
Abstract
1 前言
    1.1 鸭甲肝病毒的研究概述
        1.1.1 DHAV 病原学研究
        1.1.2 DHAV 的流行病学研究
        1.1.3 DHAV 的诊断方法
        1.1.4 DHAV 的预防与治疗
    1.2 荧光定量 RT-PCR 方法概述
        1.2.1 定义概述
        1.2.2 荧光定量 RT-PCR 分类
        1.2.3 荧光定量 RT-PCR 应用
    1.3 DHAV 的相关规律
        1.3.1 DHAV 的增殖规律
        1.3.2 致病机理
    1.4 DHAV 病毒分布规律的研究进展
    1.5 本研究的目的和意义
2 材料与方法
    2.1 材料
        2.1.1 菌（毒）株
        2.1.2 试验动物
        2.1.3 酶和相关试剂
        2.1.4 主要仪器
        2.1.5 实验所用的溶液及其配制
    2.2 方法
        2.2.1 试验一 SD1201 株 DHAV-3 的分离培养以及全基因组测序
        2.2.2 试验二 SD1201 株 DHAV-3 的致病性分析
        2.2.3 实验三用荧光定量 RT-PCR 方法检测 SD1201 株 DHAV-3 在雏鸭体内的病毒载量
3 结果与分析
    3.1 SD1201 株 DHAV-3 全基因组测序的结果分析
        3.1.1 目的片段扩增结果
        3.1.2 SD1201 株 DHAV-3 全基因结构同源性比对
        3.1.3 SD1201 株 DHAV-3 全基因同源性比对
        3.1.4 氨基酸序列进化树的构建和分析
        3.1.5 VP1 高变区氨基酸序列分析
        3.1.6 VP1 蛋白氨基酸序列的亲水性、抗原指数和表面可及性分析
    3.2 毒力检测的结果
        3.2.1 鸭胚半数致死量
        3.2.2 雏鸭半数致死量
        3.2.3 病理切片观察
    3.3 荧光定量检测雏鸭在各个部位的载量分布
        3.3.1 人工感染雏鸭的临床症状以及剖检变化
        3.3.2 DHAV-3 在雏鸭体内不同部位的的动态定量分布规律
4 讨论
    4.1 全基因组测序的结果讨论
    4.2 毒力测定
    4.3 检测 DHAV-3 荧光定量 RT-PCR 方法
5 结论
参考文献
致谢
攻读硕士期间发表论文情况
附录


【参考文献】：
期刊论文
[1]鸽源鸭甲肝病毒1型的分离与鉴定[J]. 施少华,陈红梅,陈珍,傅光华,万春和,程龙飞,苏敬良,黄瑜.  福建农业学报. 2012(11)
[2]基因C型鸭甲肝病毒VP1基因的克隆及原核表达[J]. 皮晋魁,聂培婷,黄秋雪,岳华,张焕容.  中国预防兽医学报. 2012(09)
[3]鸭甲型病毒性肝炎的研究进展[J]. 任丽倩,李晶,毕玉海,陈璨,张大丙,刘文军.  生物工程学报. 2012(07)
[4]鸭甲肝病毒基因A型和C型双重RT-PCR检测方法的建立[J]. 黄秋雪,汤承,聂培婷,岳华.  中国预防兽医学报. 2012(02)
[5]雏鸭感染鸭病毒性肝炎的组织病理学观察[J]. 伍莉,朱周福.  中国兽医杂志. 2011(05)
[6]鸭肝炎病毒分子流行病学分析[J]. 袁率珍,范书才,李虹,姜畔,张兵.  中国预防兽医学报. 2010(11)
[7]鸭肝炎病毒浙江分离株全基因组测序及其VP1基因的序列分析[J]. 邵泽香,韦强,鲍国连,崔言顺,刘燕,王春平,季权安,李建亮.  中国兽医学报. 2010(08)
[8]2007～2009年华南地区鸭肝炎病毒流行病学调查及分离株的VP1基因变异分析[J]. 何冉娅,于淼,张玉玲,张得玉,曹宗喜,张桂红.  中国动物传染病学报. 2010(01)
[9]鸭甲肝病毒VP1基因的克隆和序列分析[J]. 彭小薇,徐永亮,王笑言,付余,张大丙.  中国兽医杂志. 2009(09)
[10]基因C型鸭肝炎病毒的分离和鉴定[J]. 潘梦,付余,王笑言,徐永亮,温纳相,王丽艳,张大丙.  中国兽医杂志. 2009(03)

硕士论文
[1]新型鸭肝炎病毒全基因组测序及其VP1基因的克隆表达分析[D]. 赵立娜.山东农业大学 2010
[2]实时荧光定量RT-PCR检测1型鸭病毒性肝炎方法的建立和应用[D]. 杨苗.四川农业大学 2009



本文编号：3661119