COX17、EPOR、VEGF-A基因的多态性与藏羊高海拔低氧适应性的关联性研究
发布时间：2022-07-20 13:09
为解析藏羊高原低氧适应的分子机制，本研究以分布在不同海拔高度的不同绵羊群体为研究对象，选择与氧、能量代谢相关的COX17、 EPOR、 VEGF-A基因为候选基因，利用DNA混合池、直接测序法和高分辨率溶解曲线对COX17、EPOR、VEGF-A进行基因分型，分析其在不同绵羊群体中基因多态性，并进行COX17、EPOR、VEGF-A基因多态性与藏羊不同群体高海拔低氧适应的关联性分析，以期为藏羊遗传资源的保护利用与新品种选育提供科学依据。1.COX17基因多态性与藏羊高海拔低氧适应性的关联性研究在不同海拔高度的绵羊群体中COX17基因内含子区发现2个SNP位点，SNP1（g.402T/C），SNP2（g.408T/C），其基因型和等位基因频率在低海拔和中海拔与高海拔绵羊群体间均差异显著（P<0.05），在高海拔与中海拔绵羊群体间差异均不显著（P>0.05）。SNP1（g.402T/C）、SNP2（g.408T/C）在中海拔与高海拔绵羊群体中的优势基因型均为TT，在低海拔绵羊群体中CC为优势基因型，三个绵羊群体中SNP1、SNP2均处于紧密连锁不平衡状态（D’>0.75，...
【文章页数】：55 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
Summary
缩略词对照表
目录
第一章 文献综述
1.藏羊遗传资源的现状
2.低氧适应性的研究进展
2.1 藏羊低氧适应性的研究进展
2.2 COX17 基因的研究进展
2.3 EPOR 基因的研究进展
2.4 VEGF-A 基因的研究进展
3. SNP 的简介
3.1 SNP 的定义和特点
3.2 SNP 的检测方法
4.高分辨率溶解曲线
4.1 HRM 的原理
4.2 HRM 的工作流程
5.本研究的目的与意义
第二章 材料与方法
1.材料
1.1 COX17、EPOR 基因多态性与藏羊高海拔低氧适应性的关联性研究试验样本
1.2 VEGF-A 基因多态性与藏羊高海拔低氧适应性的关联性研究试验样本
1.3 试剂
1.4 仪器设备
2.试验方法
2.1 基因组 DNA 的提取和稀释
2.2 DNA 混合池构建
2.3 引物设计
2.4 PCR 扩增
2.5 DNA 测序
2.6 基于 HRM 小片段法 COX17、EPOR 基因分型
2.7 统计分析
2.8 生物信息学分析
第三章 结果与分析
1.COX17 基因多态性与藏羊高海拔低氧适应性的关联性研究
1.1 COX17 基因混合池测序
1.2 基于 HRM 小片段法 COX17 基因分型
1.3 COX17 基因多态性与藏羊高海拔低氧适应性的关联性分析
1.4. COX17 基因的生物信息学分析
2.EPOR 基因多态性与藏羊高海拔低氧适应性的关联性分析
2.1 EPOR 基因混合池测序
2.2 基于 HRM 小片段法 EPOR 基因分型
2.3 EPOR 基因的多态性、连锁不平衡和单倍型分析结果
2.4 EPOR 基因生物信息学分析
3.VEGF-A 基因多态性与藏羊高海拔低氧适应性的关联性分析
3.1 VEGF-A 基因混合池测序
3.2 VEGF-A 基因的多态性、连锁不平衡和单倍型分析
3.3 VEGF-A 基因的生物信息学分析
第四章 讨论
1. COX17 基因试验讨论
2. EPOR 基因试验讨论
3. VEGF-A 试验讨论
第五章 全文结论
参考文献
致谢
作者简介
导师简介
【参考文献】：
期刊论文
[1]藏羊脑动脉系统结构特征与高原适应性研究[J]. 王欣荣,吴建平. 家畜生态学报. 2013(08)
[2]牦牛、黄牛和绵羊EPO基因部分片段遗传多态性分析[J]. 许海霞,吴建平,张利平,赵生国,王欣荣,郎侠,李文彬. 中国兽医学报. 2013(06)
[3]促红细胞生成素对干细胞作用的研究进展[J]. 刘燕,李法琦. 中国老年学杂志. 2013(09)
[4]青海藏羊发展措施及对策[J]. 才让太. 中国畜牧兽医文摘. 2013(02)
[5]青海天峻县高原型藏羊毛纤维物理性能分析[J]. 孙彧,孙梅,乔海生. 青海畜牧兽医杂志. 2012(06)
[6]高原哺乳动物低氧感受器的研究进展[J]. 胡明军,邓霄禹,江明锋. 中国畜牧兽医. 2012(09)
[7]藏系绵羊遗传多样性的研究进展[J]. 徐琳娜,李国林. 畜牧兽医杂志. 2012(04)
[8]牛RHOQ基因的电子克隆与生物信息学分析[J]. 吴晓云,阎萍,梁春年,郭宪,包鹏甲,裴杰,丁学智,褚敏,刘文博,焦斐,刘建. 生物技术通报. 2012(06)
[9]鲁西牛ANGPTL6基因的3个多态位点与其生长性状的关联性分析[J]. 李爱民,马云,杨东英,蓝贤勇,胡沈荣,雷初朝,张春雷,陈宏. 中国农业科学. 2012(11)
[10]海西州高原型藏羊种质资源调查[J]. 王光明. 畜牧与兽医. 2012(04)
硕士论文
[1]高住高练低训对大鼠心肌线粒体呼吸链酶复合物活性的影响[D]. 吴刚.西北师范大学 2012
本文编号：3664062
【文章页数】：55 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
Summary
缩略词对照表
目录
第一章 文献综述
1.藏羊遗传资源的现状
2.低氧适应性的研究进展
2.1 藏羊低氧适应性的研究进展
2.2 COX17 基因的研究进展
2.3 EPOR 基因的研究进展
2.4 VEGF-A 基因的研究进展
3. SNP 的简介
3.1 SNP 的定义和特点
3.2 SNP 的检测方法
4.高分辨率溶解曲线
4.1 HRM 的原理
4.2 HRM 的工作流程
5.本研究的目的与意义
第二章 材料与方法
1.材料
1.1 COX17、EPOR 基因多态性与藏羊高海拔低氧适应性的关联性研究试验样本
1.2 VEGF-A 基因多态性与藏羊高海拔低氧适应性的关联性研究试验样本
1.3 试剂
1.4 仪器设备
2.试验方法
2.1 基因组 DNA 的提取和稀释
2.2 DNA 混合池构建
2.3 引物设计
2.4 PCR 扩增
2.5 DNA 测序
2.6 基于 HRM 小片段法 COX17、EPOR 基因分型
2.7 统计分析
2.8 生物信息学分析
第三章 结果与分析
1.COX17 基因多态性与藏羊高海拔低氧适应性的关联性研究
1.1 COX17 基因混合池测序
1.2 基于 HRM 小片段法 COX17 基因分型
1.3 COX17 基因多态性与藏羊高海拔低氧适应性的关联性分析
1.4. COX17 基因的生物信息学分析
2.EPOR 基因多态性与藏羊高海拔低氧适应性的关联性分析
2.1 EPOR 基因混合池测序
2.2 基于 HRM 小片段法 EPOR 基因分型
2.3 EPOR 基因的多态性、连锁不平衡和单倍型分析结果
2.4 EPOR 基因生物信息学分析
3.VEGF-A 基因多态性与藏羊高海拔低氧适应性的关联性分析
3.1 VEGF-A 基因混合池测序
3.2 VEGF-A 基因的多态性、连锁不平衡和单倍型分析
3.3 VEGF-A 基因的生物信息学分析
第四章 讨论
1. COX17 基因试验讨论
2. EPOR 基因试验讨论
3. VEGF-A 试验讨论
第五章 全文结论
参考文献
致谢
作者简介
导师简介
【参考文献】：
期刊论文
[1]藏羊脑动脉系统结构特征与高原适应性研究[J]. 王欣荣,吴建平. 家畜生态学报. 2013(08)
[2]牦牛、黄牛和绵羊EPO基因部分片段遗传多态性分析[J]. 许海霞,吴建平,张利平,赵生国,王欣荣,郎侠,李文彬. 中国兽医学报. 2013(06)
[3]促红细胞生成素对干细胞作用的研究进展[J]. 刘燕,李法琦. 中国老年学杂志. 2013(09)
[4]青海藏羊发展措施及对策[J]. 才让太. 中国畜牧兽医文摘. 2013(02)
[5]青海天峻县高原型藏羊毛纤维物理性能分析[J]. 孙彧,孙梅,乔海生. 青海畜牧兽医杂志. 2012(06)
[6]高原哺乳动物低氧感受器的研究进展[J]. 胡明军,邓霄禹,江明锋. 中国畜牧兽医. 2012(09)
[7]藏系绵羊遗传多样性的研究进展[J]. 徐琳娜,李国林. 畜牧兽医杂志. 2012(04)
[8]牛RHOQ基因的电子克隆与生物信息学分析[J]. 吴晓云,阎萍,梁春年,郭宪,包鹏甲,裴杰,丁学智,褚敏,刘文博,焦斐,刘建. 生物技术通报. 2012(06)
[9]鲁西牛ANGPTL6基因的3个多态位点与其生长性状的关联性分析[J]. 李爱民,马云,杨东英,蓝贤勇,胡沈荣,雷初朝,张春雷,陈宏. 中国农业科学. 2012(11)
[10]海西州高原型藏羊种质资源调查[J]. 王光明. 畜牧与兽医. 2012(04)
硕士论文
[1]高住高练低训对大鼠心肌线粒体呼吸链酶复合物活性的影响[D]. 吴刚.西北师范大学 2012
本文编号：3664062
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