金华猪PPARGC1A基因克
发布时间：2022-08-01 11:02
试验旨在研究过氧化物酶体增殖物激活受体γ辅助激活因子1α（PPARGC1A）在金华猪和大白猪中的遗传特征和表达情况,探究PPARGC1A基因在mRNA水平和蛋白质水平的表达模式。以金华猪和大白猪为试验动物,分别提取背脂组织的总RNA,根据GenBank中公布的猪PPARGC1A基因序列（登录号:NM213963.2）设计编码区和实时定量PCR引物,以猪GAPDH基因和β-actin蛋白作为内参,应用多种生物信息学方法对PPARGC1A基因编码蛋白进行功能分析,并通过实时荧光定量PCR及Western blotting检测其在金华猪背脂中的表达水平。结果表明,金华猪PPARGC1A基因CDS区全长2 361 bp,编码786个氨基酸,该蛋白分子大小90 336.01 u,其中丝氨酸（ser）所占比例最高（13.7%）,色氨酸（Trp）所占比例最低（0.8%）。同源性比对结果显示,金华猪PPARGC1A基因与山羊、牛和绵羊的同源性较高,分别为95.0%、94.9%和94.9%,在物种进化中具有较强的保守性;金华猪PPARGC1A蛋白不稳定指数为74.88,属于不稳定亲...
【文章页数】：10 页
【文章目录】：
1 材料及方法
1.1 样本采集
1.2 主要试剂
1.3 金华猪PPARGC1A基因克隆
1.4 金华猪PPARGC1A基因生物信息学分析
1.5 实时荧光定量PCR检测
1.6 Western blotting分析
1.7 数据分析
2 结 果
2.1 金华猪PPARGC1A基因的克隆
2.2 金华猪PPARGC1A基因序列分析
2.3 金华猪PPARGC1A基因同源性比对及系统进化树分析
2.4 金华猪PPARGC1A生物信息学分析
2.4.1 金华猪PPARGC1A蛋白理化性质分析
2.4.2 金华猪PPARGC1A蛋白亲/疏水性分析
2.4.3 金华猪PPARGC1A蛋白跨膜结构预测与分析
2.4.4 金华猪PPARGC1A蛋白卷曲螺旋预测与分析
2.4.5 金华猪PPARGC1A蛋白二级结构预测
2.4.6 金华猪PPARGC1A蛋白三级结构预测
2.5 猪PPARGC1A基因组织表达分析
2.6 Western blotting分析
3 讨 论
4 结 论
【参考文献】：
期刊论文
[1]牛肌内脂肪沉积影响因素及相关基因研究进展[J]. 吕亚宁,叶文文,兰旅涛. 中国草食动物科学. 2019(04)
[2]猪肉中脂肪酸组成的品种差异及脂肪酸沉积的调控机制[J]. 农秋雲,刘嘉琪,单体中. 动物营养学报. 2019(06)
[3]影响猪脂肪沉积主要候选基因的研究进展[J]. 瞿秋红,黄叶,蒋钦杨,黄艳娜. 动物营养学报. 2019(07)
[4]能量水平和激素对脂肪代谢酶基因的调控研究进展[J]. 张雨,施力光,荀文娟,刘强. 动物营养学报. 2019(08)
[5]PPARGC1A/NRF1/TFAM通路核心基因在湖羊睾丸发育过程中的表达变化[J]. 安世钰,张国敏,尤佩华,孟繁星,刘建玲,张婷婷,杨花,樊懿萱,王锋. 南京农业大学学报. 2019(02)
[6]PPARGC1启动子甲基化与Ⅱ型糖尿病发病相关性分析[J]. 梁爽,王伟伟,孙力,邹广慧,董志武. 分子诊断与治疗杂志. 2019(02)
[7]Neonatal vitamin A injection promotes cattle muscle growth and increases oxidative muscle fibers[J]. Bo Wang,Wei Nie,Xing Fu,Jeanene M de Avila,Yannan Ma,Mei-Jun Zhu,Martin Maquivar,Steven M Parish,Jan R Busboom,Mark L Nelson,Min Du. Journal of Animal Science and Biotechnology. 2019(01)
[8]滩羊Eph A3基因克隆表达分析及生物信息学初步研究[J]. 徐芹芹,刘玉芳,康晓龙,方美英. 中国畜牧杂志. 2019(03)
[9]三个品种马PPARGC1A基因PCR-SSCP多态性分析[J]. 刘婷婷,孟军,王建文,姚新奎,韩煜茹,晏华春,张亚昂,曾亚琦,王宁,朱文强. 新疆农业科学. 2015(10)
[10]中国荷斯坦奶牛PPARGC1A基因内含子9的SNP与产奶性状的相关分析[J]. 王杰,原清会,张明,曾长军,赖松家. 四川农业大学学报. 2010(02)
博士论文
[1]秦川牛PPARGC1A基因功能验证及遗传变异研究[D]. 李密杰.西北农林科技大学 2013
硕士论文
[1]蒙古马运动候选基因PPARGC1A多态性和表达量研究[D]. 乌日古木拉.内蒙古农业大学 2012
本文编号：3667329
【文章页数】：10 页
【文章目录】：
1 材料及方法
1.1 样本采集
1.2 主要试剂
1.3 金华猪PPARGC1A基因克隆
1.4 金华猪PPARGC1A基因生物信息学分析
1.5 实时荧光定量PCR检测
1.6 Western blotting分析
1.7 数据分析
2 结 果
2.1 金华猪PPARGC1A基因的克隆
2.2 金华猪PPARGC1A基因序列分析
2.3 金华猪PPARGC1A基因同源性比对及系统进化树分析
2.4 金华猪PPARGC1A生物信息学分析
2.4.1 金华猪PPARGC1A蛋白理化性质分析
2.4.2 金华猪PPARGC1A蛋白亲/疏水性分析
2.4.3 金华猪PPARGC1A蛋白跨膜结构预测与分析
2.4.4 金华猪PPARGC1A蛋白卷曲螺旋预测与分析
2.4.5 金华猪PPARGC1A蛋白二级结构预测
2.4.6 金华猪PPARGC1A蛋白三级结构预测
2.5 猪PPARGC1A基因组织表达分析
2.6 Western blotting分析
3 讨 论
4 结 论
【参考文献】：
期刊论文
[1]牛肌内脂肪沉积影响因素及相关基因研究进展[J]. 吕亚宁,叶文文,兰旅涛. 中国草食动物科学. 2019(04)
[2]猪肉中脂肪酸组成的品种差异及脂肪酸沉积的调控机制[J]. 农秋雲,刘嘉琪,单体中. 动物营养学报. 2019(06)
[3]影响猪脂肪沉积主要候选基因的研究进展[J]. 瞿秋红,黄叶,蒋钦杨,黄艳娜. 动物营养学报. 2019(07)
[4]能量水平和激素对脂肪代谢酶基因的调控研究进展[J]. 张雨,施力光,荀文娟,刘强. 动物营养学报. 2019(08)
[5]PPARGC1A/NRF1/TFAM通路核心基因在湖羊睾丸发育过程中的表达变化[J]. 安世钰,张国敏,尤佩华,孟繁星,刘建玲,张婷婷,杨花,樊懿萱,王锋. 南京农业大学学报. 2019(02)
[6]PPARGC1启动子甲基化与Ⅱ型糖尿病发病相关性分析[J]. 梁爽,王伟伟,孙力,邹广慧,董志武. 分子诊断与治疗杂志. 2019(02)
[7]Neonatal vitamin A injection promotes cattle muscle growth and increases oxidative muscle fibers[J]. Bo Wang,Wei Nie,Xing Fu,Jeanene M de Avila,Yannan Ma,Mei-Jun Zhu,Martin Maquivar,Steven M Parish,Jan R Busboom,Mark L Nelson,Min Du. Journal of Animal Science and Biotechnology. 2019(01)
[8]滩羊Eph A3基因克隆表达分析及生物信息学初步研究[J]. 徐芹芹,刘玉芳,康晓龙,方美英. 中国畜牧杂志. 2019(03)
[9]三个品种马PPARGC1A基因PCR-SSCP多态性分析[J]. 刘婷婷,孟军,王建文,姚新奎,韩煜茹,晏华春,张亚昂,曾亚琦,王宁,朱文强. 新疆农业科学. 2015(10)
[10]中国荷斯坦奶牛PPARGC1A基因内含子9的SNP与产奶性状的相关分析[J]. 王杰,原清会,张明,曾长军,赖松家. 四川农业大学学报. 2010(02)
博士论文
[1]秦川牛PPARGC1A基因功能验证及遗传变异研究[D]. 李密杰.西北农林科技大学 2013
硕士论文
[1]蒙古马运动候选基因PPARGC1A多态性和表达量研究[D]. 乌日古木拉.内蒙古农业大学 2012
本文编号：3667329
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