苏尼特羊CAST基因多态性分析与肉品质相关性研究

发布时间：2022-08-11 10:33

　　本试验利用PCR-SSCP技术对90只苏尼特羊的CAST基因的第六外显子和3非翻译区进行多态性分析，并研究了其中12只12月龄的母本苏尼特羊的不同基因型与肉质性状的关联性。结果表明：在9对引物中，引物P1、P4、P5、P6扩增的目的片段出现了多态位点。经测序后发现，P1引物扩增产物出现了2个突变位点分别为在56bp处A/G替换；在184bp的A/C替换，碱基的突变导致了在该区域出现了三种基因型，分别命名为AA、AB、AC；P4引物的扩增产物出现了三种基因型（AA、BB、BC）是由于该区域两个碱基的缺失和3个碱基替换，分别为在105bpCA碱基的缺失，在117bpG/A的替换，在201bpA/G替换，以及在131bpA/C/G的替换。P5引物扩增产物在32bp处出现了C/T碱基的替换使得在该区域出现了两种基因型（AA、AB）；P6引物扩增产物出现了3个突变位点，分别为135bpT/C的替换，在142bpC/T的替换，以及在151bpA/C的替换，碱基突变导致了在该区域出现了3种基因型（AA、BB、BC）。后经数据分析得出引物P1、P4、P5扩增产物的多态信息含量（PIC）分别为0.28、... 

【文章页数】：52 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
Abstract
1 引言
    1.1 苏尼特羊的简介
    1.2 钙蛋白酶抑制蛋白的概述
        1.2.1 钙蛋白酶抑制蛋白的结构
        1.2.2 钙蛋白酶抑制蛋白及钙蛋白酶系统对肉品质的影响
        1.2.3 CAST 基因与肉品质的相关性研究
    1.3 单核苷酸多态性遗传标记(SNP)的概述
        1.3.1 单核苷酸多态性遗传标记(SNP)的简介
        1.3.2 PCR-SSCP 技术的简介
        1.3.3 几种经典分子标记的比较
    1.4 基因与肉质相关性的研究进展
    1.5 本研究的目的和意义
2 材料与方法
    2.1 试验材料
        2.1.1 试验群体
        2.1.2 仪器及设备
        2.1.3 主要的试剂
        2.1.4 主要药品及试剂的配制
    2.2 试验方法
        2.2.1 实验技术路线
        2.2.2 血样的采集及肉质的测定
        2.2.3 DNA 的提取及检测
        2.2.4 目的基因的扩增
        2.4.5 聚丙烯酞胺凝胶电泳 PCR-SSCP 分析
        2.4.6 苏尼特羊 CAST 基因的克隆测序
        2.4.7 数据分析方法
3 结果与分析
    3.1 血液基因组 DNA 电泳结果
    3.2 CAST 基因 PCR 扩增结果
        3.2.1 引物 P1 的 PCR 扩增结果
        3.2.2 引物 P2 的 PCR 扩增结果
        3.2.3 引物 P3 的 PCR 扩增结果
        3.2.4 引物 P4 的 PCR 扩增结果
        3.2.5 引物 P5 的 PCR 扩增结果
        3.2.6 引物 P6 的 PCR 扩增结果
        3.2.7 引物 P9 的 PCR 扩增结果
        3.2.8 PCR 扩增结果小结
    3.3 CAST 基因 PCR-SSCP 检测结果
        3.3.1 引物 P1 的 SSCP 检测结果
        3.3.2 引物 P2 的 PCR 检测结果
        3.3.3 引物 P3 PCR 检测结果
        3.3.4 引物 P4 的 PCR 检测结果
        3.3.5 引物 P5 的 PCR 检测结果
        3.3.6 引物 P6 的 PCR 检测结果
        3.3.7 引物 P9 的 PCR 检测结果
    3.4 苏尼特羊 CAST 基因不同基因型的 DNA 测序
        3.4.1 P1 位点的不同基因型测序结果
        3.4.2 P4 位点的不同基因型测序结果
        3.4.3 P5 位点的不同基因型测序结果
        3.4.4 P6 位点的不同基因型测序结果
    3.5 苏尼特羊 CAST 基因基因频率和基因型频率分析
    3.6 苏尼特羊 CAST 遗传多态性分析
    3.7 苏尼特羊 CAST 基因与肉质性状相关性分析
        3.7.1 肉质性状的统计
        3.7.2 P1 位点的不同基因型对肉质性状的影响
        3.7.3 P4 位点的不同基因型对肉质性状的影响
        3.7.4 P5 位点的不同基因型对肉质性状的影响
        3.7.5 P6 位点的不同基因型对肉质性状的影响
4 讨论
    4.1 试验材料的选择
    4.2 影响 PCR-SSCP 检测的因素
        4.2.1 影响 PCR 反应因素
        4.2.2 SSCP 分析的影响因素
    4.3 基因突变与苏尼特羊肉质性状的分析
5 结论
致谢
参考文献
作者简介


【参考文献】：
期刊论文
[1]SNP分子标记的研究及其应用进展[J]. 唐立群,肖层林,王伟平.  中国农学通报. 2012(12)
[2]PCR-SSCP技术研究现状[J]. 张利,黎晓敏.  饲料博览. 2011(06)
[3]动物钙蛋白酶系统基因与肉质嫩度关联研究进展[J]. 马丽娜,李颖康.  畜牧与饲料科学. 2011(01)
[4]钙蛋白酶系统及其与肉质关系的研究[J]. 崔岩,张勇.  饲料广角. 2010(23)
[5]后基因组时代下作物的SNP分型方法[J]. 赵琼一,李信,周德贵,何飞,周少川,罗达.  分子植物育种. 2010(01)
[6]钙蛋白酶抑制蛋白（CAST）基因型与营养水平互作对猪胴体性状的影响[J]. 彭英林,柳小春,施启顺,杨仕柳,朱吉,左剑波.  农业生物技术学报. 2009(05)
[7]MyoG基因多态性与优质肉鸡屠宰性状和肉质性状的相关性分析[J]. 王琼,刘益平,蒋小松,杨朝武,杜华瑞,邱莫寒,朱庆.  遗传. 2007(09)
[8]SNPs检测方法研究进展[J]. 唐棣,王志民.  上海交通大学学报(农业科学版). 2007(04)
[9]肉牛CAST基因分子多态性与肉品质性状相关性的研究[J]. 邓桂馨,张银花,梁鸿斌.  北京农学院学报. 2007(03)
[10]CAST基因及钙蛋白酶系统的研究进展[J]. 李静,朱庆.  安徽农业科学. 2007(15)

硕士论文
[1]凉山半细毛羊MyoD基因多态性分析及其与体重性状的相关研究[D]. 王琪.四川农业大学 2009
[2]绵羊CAPN1、CAST基因mRNA的发育性表达规律及其对肉品质的影响[D]. 燕凤.西北农林科技大学 2008



本文编号：3674498