陆川猪ANKRD1基因克隆及其表达差异分析

发布时间：2022-10-27 21:17

　　【目的】克隆陆川猪心肌锚蛋白重复域1基因（ANKRD1）,并进行生物信息学及组织表达谱分析,为研究ANKRD1在陆川猪机体内的功能作用提供参考依据。【方法】根据NCBI已公布的野猪ANKRD1基因序列（NM₂13922.1）设计特异性引物,采用TRIzol法提取陆川猪心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、背最长肌和皮下脂肪的总RNA,反转录合成cDNA,并以此为模板进行ANKRD1基因克隆,通过MegAlign、Protaram、Protscale、MHMM Server和SignalP等在线分析软件进行生物信息学分析,最后以实时荧光定量PCR检测ANKRD1基因在陆川猪各组织中的表达情况。【结果】陆川猪ANKRD1基因蛋白编码区（CDS）序列全长960 bp,编码319个氨基酸残基,与NCBI已公布野猪ANKRD1基因（NM₂13922.1）的CDS序列存在4处碱基突变,但均为同义突变,二者的ANKRD1氨基酸序列同源性为99.6%。陆川猪ANKRD1基因编码蛋白分子量为36125.70 Da,理论等电点（pI）为7.09,属于稳定蛋白,其二级结构... 

【文章页数】：8 页

【文章目录】：
0 引言
1 材料与方法
    1.1 试验材料
    1.2 试验方法
        1.2.1 引物设计与合成
        1.2.2 陆川猪ANKRD1基因克隆
        1.2.3 实时荧光定量PCR
    1.3 陆川猪ANKRD1基因生物信息学分析
2 结果与分析
    2.1 陆川猪ANKRD1基因克隆结果
    2.2 陆川猪ANKRD1基因生物信息学分析结果
        2.2.1 陆川猪ANKRD1基因测序分析
        2.2.2 陆川猪ANKRD1蛋白理化性质
        2.2.3 陆川猪ANKRD1蛋白二、三级结构
        2.2.4 陆川猪ANKRD1蛋白亲/疏水性
        2.2.5 陆川猪ANKRD1蛋白信号肽和跨膜结构
        2.2.6 陆川猪ANKRD1蛋白磷酸化位点
        2.2.7 陆川猪ANKRD1蛋白糖基化位点
        2.2.8 陆川猪ANKRD1蛋白保守域及亚细胞定位
    2.3 ANKRD1基因在陆川猪不同组织中的表达情况
3 讨论
4 结论


【参考文献】：
期刊论文
[1]陆川猪MYL9基因克隆及其表达差异分析[J]. 焦迪,谢婉,潘鹏丞,陈宝剑,关志惠,杨秀荣,兰干球,郭亚芬,谢炳坤.  南方农业学报. 2019(03)
[2]陆川猪GPR1基因启动子甲基化及其mRNA表达分析[J]. 谢婉,焦迪,何剑雄,陈宝剑,关志惠,兰干球,郭亚芬,谢炳坤.  黑龙江畜牧兽医. 2018(17)
[3]miR-218对血管紧张素II诱导的心肌细胞肥大的影响[J]. 王译晗,朱海英,骆海燕,陆彩玲,高小博.  中国计划生育学杂志. 2018(06)
[4]陆川猪脂酰辅酶A氧化酶1基因克隆及序列分析[J]. 关志惠,陈宝剑,潘天彪,覃兆鲜,刘嘉琪,马青艳,农素群,谢炳坤.  中国畜牧兽医. 2017(03)
[5]陆川猪肌肉生长抑制素基因的克隆与序列分析[J]. 黄艳娜,李莉,韦玲静,郭晓萍,梁明振,兰干球,蒋钦杨.  南方农业学报. 2014(04)
[6]陆川猪胴体品质及肉质的研究[J]. 张家富,何若钢,江永强,覃小荣,黄伟杰,刘丁健,刘桂武,罗丽萍.  养猪. 2010(06)

硕士论文
[1]猪WFIKKN2基因启动子区甲基化及mRNA表达水平研究[D]. 何剑雄.广西大学 2018



本文编号：3697230