姜曲海猪和杜洛克猪肺炎支原体易感性差异的分子遗传机制研究
发布时间：2022-11-06 18:36
猪支原体肺炎（Mycoplasmal pneumonia of swine,MPS）又称为猪气喘病,广泛流行于世界各国的养猪场,对养猪业造成极为严重的经济损失。猪肺炎支原体（Mycoplasma hyopneumoniae,Mhp）是引起该病的主要病原菌。现有研究发现,不同猪种对Mhp感染表现出较大差异的易感性,中国地方猪种对Mhp的易感性高于引入猪种,如高繁殖力的姜曲海猪、二花脸猪、梅山猪等地方猪种相对于杜洛克猪、长白猪等引入猪种表现出严重的气喘病。但是,不同品种对Mhp易感性的分子遗传机制尚不清楚。因此,本研究以地方猪种（姜曲海猪）、培育猪种（苏姜猪）和引入猪种（长白猪和杜洛克猪）为研究对象,通过流行病学调查和人工感染试验,从临床症状、病理特征、体液免疫、基因表达等方面系统分析并验证中外猪种Mhp易感性的差异。此外,以姜曲海猪和杜洛克猪为素材,利用高通量测序技术测定并比较分析两个品种感染Mhp后肺组织中mRNA、lncRNA和miRNA表达模式的相同点和异同点,分析差异表达mRNA、lncRNA和miRNA在机体抵抗Mhp感染过程中的免疫调控作用,以进一步揭示中外猪种Mhp易感性差...
【文章页数】：137 页
【学位级别】：博士
【文章目录】：
摘要
Abstract
符号说明
第1章 文献综述
1.1 Mhp的研究进展
1.1.1 Mhp的发现及研究历程
1.1.2 Mhp病原学研究进展
1.1.3 Mhp感染的免疫应答
1.1.4 不同猪种Mhp免疫应答差异的研究
1.1.5 Mhp抗性基因的研究进展
1.2 高通量测序技术应用及研究进展
1.2.1 mRNA转录组测序
1.2.2 lncRNA转录组测序
1.2.3 miRNA转录组测序
1.3 本研究的目的和意义
第2章 江苏苏中地区猪支原体肺炎流行病学调查及分析
2.1 材料与方法
2.1.1 调查对象
2.1.2 样本采集
2.1.3 试验试剂
2.1.4 血清Mhp抗体检测
2.1.5 Mhp抗原检测
2.1.6 肺组织病理检测
2.2 结果与分析
2.2.1 血清Mhp抗体检测结果
2.2.2 呼吸道和肺组织Mhp抗原检测结果
2.2.3 肺组织病理检测结果
2.3 讨论
2.3.1 血清中Mhp抗体检测结果分析
2.3.2 呼吸道及肺组织Mhp抗原检测结果分析
2.3.3 肺组织病理检测结果分析
2.4 小结
第3章 姜曲海猪和杜洛克猪Mhp易感性差异的免疫基础研究
3.1 材料与方法
3.1.1 试验动物
3.1.2 主要试验试剂
3.1.3 Mhp感染试验
3.1.4 称重和临床评价
3.1.5 血液免疫蛋白检测
3.1.6 屠宰与肺组织病理检测
3.1.7 基因表达定量PCR检测
3.1.8 数据处理和分析
3.2 结果与分析
3.2.1 试验猪临床症状
3.2.2 试验猪体重变化
3.2.3 试验猪肺组织病理变化
3.2.4 血清抗体含量检测
3.2.5 血清IgG、IgM含量检测
3.2.6 基因表达检测
3.3 讨论
3.3.1 Mhp感染对临床症状、生长速度的影响
3.3.2 Mhp感染对肺组织损伤及血清抗体的影响
3.3.3 Mhp感染对血清IgG、IgM含量的影响
3.3.4 Mhp感染对基因表达的影响
3.3.5 Mhp感染模型的研究
3.4 小结
第4章 姜曲海猪与杜洛克猪感染Mhp后肺组织mRNA及lncRNA转录组差异分析
4.1 材料与方法
4.1.1 试验动物
4.1.2 主要试剂
4.1.3 Mhp感染试验及样本准备
4.1.4 转录组测序
4.1.5 测序数据处理及生物信息学分析
4.1.6 定量PCR验证测序数据
4.2 结果与分析
4.2.1 样本总RNA质量检测
4.2.2 测序数据分析
4.2.3 mRNA和lncRNA差异表达分析
4.2.4 差异表达mRNA的功能分析
4.2.5 差异表达lncRNA的功能分析
4.3 讨论
4.3.1 测序数据分析
4.3.2 差异表达mRNA介导的免疫应答模式分析
4.3.3 差异表达lncRNA靶基因及功能分析
4.4 小结
第5章 姜曲海猪与杜洛克猪感染Mhp后肺组织miRNA转录组差异分析
5.1 材料与方法
5.1.1 试验动物及样本准备
5.1.2 主要试剂
5.1.3 样本总RNA提取及质控
5.1.4 小RNA文库构建及测序
5.1.5 测序数据处理及生物信息学分析
5.1.6 定量PCR验证测序数据
5.1.7 ceRNA关联分析和关键免疫应答基因的筛选
5.1.8 免疫组织中基因表达检测
5.2 结果与分析
5.2.1 小RNA测序数据分析
5.2.2 miRNA的筛选及新miRNA预测
5.2.3 miRNA表达分析
5.2.4 差异表达miRNA的筛选
5.2.5 差异表达miRNA靶基因的预测
5.2.6 差异表达miRNA的功能分析
5.2.7 miRNA测序数据的验证
5.2.8 ceRNA关联分析及关键免疫应答基因的筛选结果
5.2.9 免疫组织中基因表达检测结果
5.3 讨论
5.3.1 小RNA测序数据分析
5.3.2 差异表达miRNA的免疫调控机制分析
5.3.3 ceRNA关联及关键免疫应答基因筛选结果分析
5.3.4 免疫组织中基因表达检测结果分析
5.4 小结
全文结论
论文创新点
论文有待改进之处和下一步研究计划
参考文献
附录
攻读学位期间取得的研究成果
致谢
【参考文献】：
期刊论文
[1]Ssc-miR-27b-3p在猪繁殖与呼吸综合征病毒感染中的作用分析[J]. 吴俊静,季子云,乔木,武华玉,刘贵生,彭先文,梅书棋. 湖北农业科学. 2018(S2)
[2]猪支原体肺炎病变对体重的影响[J]. 杜德燕,方鹏飞,朱冬梅,邹智坤,严成,郭健宝. 中国兽医杂志. 2018(06)
[3]B7家族新成员HHLA2的研究进展[J]. 王泽群,魏素菊. 中国免疫学杂志. 2018(05)
[4]miR-7-5p对氢醌诱导TK6细胞损伤作用[J]. 杨慧,陈玉婷,梁海荣,罗皓,高羽亭,翟璐,唐焕文. 中国职业医学. 2017(03)
[5]基于QTL的猪支原体肺炎候选基因的筛选与生物学注释[J]. 张程玥,张哲,张向喆,王起山,潘玉春. 农业生物技术学报. 2017(03)
[6]Mir-217通过Sirt1/HIF-1α信号通路介导高糖诱导的大鼠肾小球系膜细胞炎症反应及纤维化[J]. 邵滢,吕川,吴灿,周月宏,王秋月. 中华内分泌代谢杂志. 2016 (07)
[7]猪支原体肺炎发生的品种敏感差异及分子基础[J]. 方晓敏,赵为民,付言峰,涂枫,李碧侠,王学敏,赵芳,任守文. 中国农业科学. 2015(14)
[8]套式PCR检测中国江苏省猪场猪鼻支原体和猪肺炎支原体的感染（英文）[J]. Joyce Wanjiru Maingi,熊祺琰,韦艳娜,马庆红,纪燕,William Kimaru,华立忠,王佳,邵国青,鲍恩东. 中国人兽共患病学报. 2014(08)
[9]猪支原体肺炎研究进展[J]. 李莹莹,何颖,赵武,李斌,秦毅斌,卢冰霞,梁家幸,陆芹章. 动物医学进展. 2013(10)
[10]猪肺炎支原体致病机理研究进展[J]. 李彦伟,刘茂军,武昱孜,张旭,李桂兰,张映,邵国青. 动物医学进展. 2013(08)
博士论文
[1]断奶仔猪F18大肠杆菌抗性基因和lncRNA的筛选与调控机制分析[D]. 吴正常.扬州大学 2017
[2]猪肺炎支原体诱导猪肺泡巨噬细胞基因差异表达谱研究[D]. 王贵平.湖南农业大学 2015
本文编号：3704013
【文章页数】：137 页
【学位级别】：博士
【文章目录】：
摘要
Abstract
符号说明
第1章 文献综述
1.1 Mhp的研究进展
1.1.1 Mhp的发现及研究历程
1.1.2 Mhp病原学研究进展
1.1.3 Mhp感染的免疫应答
1.1.4 不同猪种Mhp免疫应答差异的研究
1.1.5 Mhp抗性基因的研究进展
1.2 高通量测序技术应用及研究进展
1.2.1 mRNA转录组测序
1.2.2 lncRNA转录组测序
1.2.3 miRNA转录组测序
1.3 本研究的目的和意义
第2章 江苏苏中地区猪支原体肺炎流行病学调查及分析
2.1 材料与方法
2.1.1 调查对象
2.1.2 样本采集
2.1.3 试验试剂
2.1.4 血清Mhp抗体检测
2.1.5 Mhp抗原检测
2.1.6 肺组织病理检测
2.2 结果与分析
2.2.1 血清Mhp抗体检测结果
2.2.2 呼吸道和肺组织Mhp抗原检测结果
2.2.3 肺组织病理检测结果
2.3 讨论
2.3.1 血清中Mhp抗体检测结果分析
2.3.2 呼吸道及肺组织Mhp抗原检测结果分析
2.3.3 肺组织病理检测结果分析
2.4 小结
第3章 姜曲海猪和杜洛克猪Mhp易感性差异的免疫基础研究
3.1 材料与方法
3.1.1 试验动物
3.1.2 主要试验试剂
3.1.3 Mhp感染试验
3.1.4 称重和临床评价
3.1.5 血液免疫蛋白检测
3.1.6 屠宰与肺组织病理检测
3.1.7 基因表达定量PCR检测
3.1.8 数据处理和分析
3.2 结果与分析
3.2.1 试验猪临床症状
3.2.2 试验猪体重变化
3.2.3 试验猪肺组织病理变化
3.2.4 血清抗体含量检测
3.2.5 血清IgG、IgM含量检测
3.2.6 基因表达检测
3.3 讨论
3.3.1 Mhp感染对临床症状、生长速度的影响
3.3.2 Mhp感染对肺组织损伤及血清抗体的影响
3.3.3 Mhp感染对血清IgG、IgM含量的影响
3.3.4 Mhp感染对基因表达的影响
3.3.5 Mhp感染模型的研究
3.4 小结
第4章 姜曲海猪与杜洛克猪感染Mhp后肺组织mRNA及lncRNA转录组差异分析
4.1 材料与方法
4.1.1 试验动物
4.1.2 主要试剂
4.1.3 Mhp感染试验及样本准备
4.1.4 转录组测序
4.1.5 测序数据处理及生物信息学分析
4.1.6 定量PCR验证测序数据
4.2 结果与分析
4.2.1 样本总RNA质量检测
4.2.2 测序数据分析
4.2.3 mRNA和lncRNA差异表达分析
4.2.4 差异表达mRNA的功能分析
4.2.5 差异表达lncRNA的功能分析
4.3 讨论
4.3.1 测序数据分析
4.3.2 差异表达mRNA介导的免疫应答模式分析
4.3.3 差异表达lncRNA靶基因及功能分析
4.4 小结
第5章 姜曲海猪与杜洛克猪感染Mhp后肺组织miRNA转录组差异分析
5.1 材料与方法
5.1.1 试验动物及样本准备
5.1.2 主要试剂
5.1.3 样本总RNA提取及质控
5.1.4 小RNA文库构建及测序
5.1.5 测序数据处理及生物信息学分析
5.1.6 定量PCR验证测序数据
5.1.7 ceRNA关联分析和关键免疫应答基因的筛选
5.1.8 免疫组织中基因表达检测
5.2 结果与分析
5.2.1 小RNA测序数据分析
5.2.2 miRNA的筛选及新miRNA预测
5.2.3 miRNA表达分析
5.2.4 差异表达miRNA的筛选
5.2.5 差异表达miRNA靶基因的预测
5.2.6 差异表达miRNA的功能分析
5.2.7 miRNA测序数据的验证
5.2.8 ceRNA关联分析及关键免疫应答基因的筛选结果
5.2.9 免疫组织中基因表达检测结果
5.3 讨论
5.3.1 小RNA测序数据分析
5.3.2 差异表达miRNA的免疫调控机制分析
5.3.3 ceRNA关联及关键免疫应答基因筛选结果分析
5.3.4 免疫组织中基因表达检测结果分析
5.4 小结
全文结论
论文创新点
论文有待改进之处和下一步研究计划
参考文献
附录
攻读学位期间取得的研究成果
致谢
【参考文献】：
期刊论文
[1]Ssc-miR-27b-3p在猪繁殖与呼吸综合征病毒感染中的作用分析[J]. 吴俊静,季子云,乔木,武华玉,刘贵生,彭先文,梅书棋. 湖北农业科学. 2018(S2)
[2]猪支原体肺炎病变对体重的影响[J]. 杜德燕,方鹏飞,朱冬梅,邹智坤,严成,郭健宝. 中国兽医杂志. 2018(06)
[3]B7家族新成员HHLA2的研究进展[J]. 王泽群,魏素菊. 中国免疫学杂志. 2018(05)
[4]miR-7-5p对氢醌诱导TK6细胞损伤作用[J]. 杨慧,陈玉婷,梁海荣,罗皓,高羽亭,翟璐,唐焕文. 中国职业医学. 2017(03)
[5]基于QTL的猪支原体肺炎候选基因的筛选与生物学注释[J]. 张程玥,张哲,张向喆,王起山,潘玉春. 农业生物技术学报. 2017(03)
[6]Mir-217通过Sirt1/HIF-1α信号通路介导高糖诱导的大鼠肾小球系膜细胞炎症反应及纤维化[J]. 邵滢,吕川,吴灿,周月宏,王秋月. 中华内分泌代谢杂志. 2016 (07)
[7]猪支原体肺炎发生的品种敏感差异及分子基础[J]. 方晓敏,赵为民,付言峰,涂枫,李碧侠,王学敏,赵芳,任守文. 中国农业科学. 2015(14)
[8]套式PCR检测中国江苏省猪场猪鼻支原体和猪肺炎支原体的感染（英文）[J]. Joyce Wanjiru Maingi,熊祺琰,韦艳娜,马庆红,纪燕,William Kimaru,华立忠,王佳,邵国青,鲍恩东. 中国人兽共患病学报. 2014(08)
[9]猪支原体肺炎研究进展[J]. 李莹莹,何颖,赵武,李斌,秦毅斌,卢冰霞,梁家幸,陆芹章. 动物医学进展. 2013(10)
[10]猪肺炎支原体致病机理研究进展[J]. 李彦伟,刘茂军,武昱孜,张旭,李桂兰,张映,邵国青. 动物医学进展. 2013(08)
博士论文
[1]断奶仔猪F18大肠杆菌抗性基因和lncRNA的筛选与调控机制分析[D]. 吴正常.扬州大学 2017
[2]猪肺炎支原体诱导猪肺泡巨噬细胞基因差异表达谱研究[D]. 王贵平.湖南农业大学 2015
本文编号：3704013
本文链接：https://www.wllwen.com/yixuelunwen/dongwuyixue/3704013.html
