不同品系鸡Tmem9A/9B基因的克隆与表达分析

发布时间：2022-12-07 18:45

　　TMEM9（Transmembrane protein 9 domain family）作为一个跨膜蛋白家族,在从线虫到人类等不同物种间高度保守。目前,该家族已发现TMEM9A和TMEM9B两个成员。人TMEM9A蛋白定位于溶酶体和次级内体上,TMEM9B是一种重要糖蛋白,定位于溶酶体膜和初级内体膜上。目前,关于这两个基因的表达和功能特性研究报道较少。本研究以鸡为实验动物,克隆Tmem9A和Tmem9B基因并对其表达与功能特性进行初探,主要研究方法和实验结果如下:首先,本研究克隆了海兰褐鸡、AA⁺肉鸡和三黄鸡Tmem9A基因与AA⁺肉鸡和三黄鸡Tmem9B基因的全长编码序列并进行生物信息学分析。结果表明:海兰褐鸡、AA⁺肉鸡和三黄鸡Tmem9A基因编码序列全长均为576bp,Tmem9B基因全长均为570bp,不同品系鸡的这两个基因编码序列均存在SNP位点,但Tmem9A和Tmem9B基因均高度保守。通过对Tmem9A和Tmem9B的核苷酸序列和氨基酸序列比较分析,二者同源性分别为60%与50%左右,表明Tmem9A和T... 

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摘要
Abstract
第1章 绪论
    1.1 TMEM家族简介
        1.1.1 Tmem9A基因的研究进展
        1.1.2 Tmem9B基因的研究进展
    1.2 TMEM9与NF-κB信号通路
    1.3 TMEM9与溶酶体
        1.3.1 溶酶体跨膜蛋白
        1.3.2 TMEM9与溶酶体关系
    1.4 TMEM9与内体
        1.4.1 内体的功能
        1.4.2 内体膜蛋白
        1.4.3 TMEM9与内体关系
    1.5 本研究的目的和意义
第2章 不同品系鸡Tmem9A和Tmem9B基因的克隆与序列分析
    2.1 实验材料
        2.1.1 实验动物
        2.1.2 质粒与菌种
        2.1.3 酶和生化试剂
        2.1.4 引物
        2.1.5 主要仪器设备
    2.2 实验方法
        2.2.1 样品采集
        2.2.2 T-A克隆
        2.2.3 生物信息学分析
    2.3 结果与分析
        2.3.1 不同品系鸡Tmem9A和Tmem9B基因的克隆
        2.3.2 生物信息学分析
    2.4 讨论
        2.4.1 不同品系鸡Tmem9A序列生物信息学分析
        2.4.2 不同品系鸡Tmem9B序列生物信息学分析
        2.4.3 不同品系鸡Tmem9A序列和Tmem9B序列对比分析
    2.5 本章小结
第3章 不同品系鸡Tmem9A和Tmem9B基因的表达分析
    3.1 实验材料
        3.1.1 实验动物
        3.1.2 酶和生化试剂
        3.1.3 引物
        3.1.4 主要仪器设备
    3.2 实验方法
        3.2.1 样品采集
        3.2.2 不同品系鸡Tmem9A基因的表达谱分析
        3.2.3 不同品系鸡Tmem9B基因的表达谱分析
        3.2.4 统计分析
    3.3 结果与分析
        3.3.1 Tmem9A基因的表达特性分析
        3.3.2 Tmem9B基因的表达特性分析
    3.4 讨论
        3.4.1 Tmem9A基因的表达特性分析
        3.4.2 Tmem9B基因的表达特性分析
        3.4.3 Tmem9A和Tmem9B基因表达的异同
    3.5 本章小结
第4章 Tmem9A和Tmem9B基因在炎症和免疫反应中的表达特性分析
    4.1 实验材料
        4.1.1 实验动物
        4.1.2 酶和生化试剂
        4.1.3 引物
        4.1.4 主要仪器设备
    4.2 实验方法
        4.2.1 炎症模型雏鸡的制备和验证
        4.2.2 疫苗免疫模型雏鸡的制备和验证
        4.2.3 样品采集
        4.2.4 炎症模型中Tmem9A基因和Tmem9B基因的表达特性分析
        4.2.5 疫苗免疫模型中Tmem9A基因和Tmem9B基因的表达特性分析
        4.2.6 统计分析
    4.3 结果与分析
        4.3.1 炎症模型中Tmem9A基因和Tmem9B基因的表达特性分析
        4.3.2 疫苗免疫模型中Tmem9A基因和Tmem9B基因的表达特性分析
    4.4 讨论
        4.4.1 炎症模型中Tmem9A基因和Tmem9B基因的表达特性分析
        4.4.2 疫苗免疫模型中Tmem9A基因和Tmem9B基因的表达特性分析
    4.5 本章小结
结论
参考文献
攻读硕士学位期间发表学的术论文
致谢


【参考文献】：
期刊论文
[1]LPS诱导不同品系雏鸡炎症反应相关基因的差异表达分析[J]. 穆卫涛,常杨,赵冬雪,满朝来.  中国兽医学报. 2016(06)
[2]TMEM家族成员免疫功能的研究进展[J]. 魏晶,陈纪飞,王冰,王世仪,乔鋆,田飞,李芳.  中国免疫学杂志. 2016(01)
[3]鸡Tmem9B同源基因的克隆与序列分析[J]. 李宗恩,满朝来.  中国生物化学与分子生物学报. 2011(08)
[4]细胞水平筛选鉴定激活核因子κB通路的新基因TMEM9B[J]. 刘宇明,彭智,邓唯唯,石太平,马大龙.  生物化学与生物物理进展. 2009(11)
[5]溶酶体相关细胞器生物发生复合体相互作用组构成胞内体运输网络(英文)[J]. 李巍,冯雅琴,郝婵娟,郭小黎,崔艳艳,贺敏,何新.  遗传学报. 2007(08)

硕士论文
[1]鸡不同疫苗免疫反应中几个免疫相关基因的表达特性研究[D]. 赵冬雪.哈尔滨师范大学 2017
[2]LPS诱导鸡几个炎症反应相关基因的表达调控研究[D]. 穆卫涛.哈尔滨师范大学 2016



本文编号：3712646