肉鸭胸肌肌纤维形态与肉色的遗传分析
发布时间:2022-12-17 14:15
2019年,我国出栏肉鸭44.30亿只,位居世界第一位,鸭肉是仅次于猪肉和鸡肉的第三大肉类消费产品。当前我国居民食品消费需求已由数量转入质量,对畜产品肉质的要求越来越高,高品质优质禽肉具有巨大的市场需求,培育优质肉鸭品种是产业重大需求。骨骼肌是动物躯体最重要的组成部分,占体重的40%~50%。肌纤维形态和肉色与肉品质密切相关,解析鸭肌纤维组织形态与肉色的遗传基础将为优质肉鸭新品种选育提供理论基础,本研究精确测定了绿头野鸭×北京鸭F2资源群体以及双亲的胸肌肌纤维形态及肉色表型,并结合群体全基因组遗传变异数据进行全基因组关联分析,鉴定肌纤维及肉色性状的因果基因。首先对鸭胸肌肌纤维与肉色性状的遗传参数进行估计,试验采集了479只绿头野鸭×北京鸭F2资源群体、10只北京鸭和10只野鸭的胸肌肌纤维直径、肌纤维密度、肌纤维面积三个指标。结果表明北京鸭肌纤维直径、面积均大于野鸭和F2资源群体且差异显著(P<0.05),肌纤维密度均小于野鸭和F2资源群体。F2代群体三个指标均值介于北京鸭和野鸭...
【文章页数】:51 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
abstract
主要符号对照表
第一章 绪论
1.1 研究目的及意义
1.2 国内外研究现状
1.2.1 肉品质评价指标
1.2.2 肌纤维概述
1.2.3 肌纤维形态和肉色性状与肉品质的关系
1.2.4 影响肌纤维组织学形态的因素
1.2.5 全基因组关联分析简介
1.2.6 影响肉色性状的基因定位工作
1.3 研究内容与技术路线
1.3.1 研究内容
1.3.2 技术路线
第二章 鸭胸肌肌纤维与肉色性状的遗传参数估计
2.1 前言
2.2 材料与方法
2.2.1 试验动物
2.2.2 饲养管理
2.2.3 样品采集
2.2.4 肌肉石蜡切片制作
2.2.5 切片的显微镜观察和数据采集
2.2.6 肉色性状数据采集
2.2.7 统计分析
2.3 结果
2.3.1 F_2群体肌纤维与肉色表型
2.3.2 不同鸭群体胸肌肌纤维性状比较
2.3.3 肌纤维与肉色性状遗传力估计
2.3.4 肌纤维与肉色性状表型和遗传相关
2.4 讨论
2.4.1 肌纤维形态与肉色表型值
2.4.2 肌纤维与肉色性状遗传力估算
2.4.3 肌纤维与肉色性状表型和遗传相关
2.5 小结
第三章 鸭胸肌肌纤维直径全基因组关联分析及精细定位
3.1 前言
3.2 材料与方法
3.2.1 试验动物
3.2.2 样品采集
3.2.3 家禽外周血基因组DNA提取与质量检测
3.2.4 基因组重测序和数据质量控制
3.2.5 全基因组水平变异位点的鉴定和分型
3.2.6 全基因组关联分析
3.2.7 北京鸭和野鸭受选择区间筛选
3.2.8 拓展单倍型分析
3.2.9 肌肉组织总RNA提取和质量控制
3.2.10 RNA-seq文库构建和测序
3.2.11 RNA-seq数据质控和分析
3.3 结果
3.3.1 肌纤维直径全基因组关联分析
3.3.2 精细定位
3.4 讨论
3.4.1 肌纤维直径受单基因调控
3.4.2 F_2群体GWAS信号在驯化过程中受人工选择
3.4.3 TASP1影响肌纤维直径的通路假说
3.5 小结
第四章 鸭胸肌肉色性状全基因组关联分析及精细定位
4.1 前言
4.2 材料与方法
4.2.1 试验动物
4.2.2 样品采集
4.2.3 家禽外周血基因组DNA提取和质量检测
4.2.4 基因组重测序和数据质量控制
4.2.5 全基因组水平变异位点的鉴定和分型
4.2.6 全基因组关联分析
4.2.7 肌肉组织总RNA提取和质量控制
4.2.8 RNA-seq文库构建和测序
4.2.9 RNA-seq数据质控和分析
4.3 结果
4.3.1 全基因组关联分析
4.3.2 候选基因分析
4.4 讨论
4.4.1 肉色性状受单基因调控
4.4.2 GWAS信号区间候选基因分析
4.4.3 SELENOT基因影响肉色黄度b*
4.5 小结
第五章 结论
5.1 全文结论
5.2 有待进一步研究的问题
参考文献
致谢
作者简介
【参考文献】:
期刊论文
[1]黄麻羽肉鸡体重、体尺与肌肉品质的相关性研究[J]. 杨鹏,王克文,赵洁. 饲料研究. 2019(05)
[2]金陵白鸭的肉质特性研究[J]. 何宗亮,匡伟,姚远,郗正林,伍冠锁,杨硕. 安徽农业科学. 2019(07)
[3]苏太猪宰后72 h pH和肉色性状的全基因组关联分析[J]. 周李生,杨杰,刘先先,张志燕,杨斌,麻骏武. 中国农业科学. 2014(03)
[4]品种和部位对鸭肉肉质的影响[J]. 王健,臧大存,左伟勇,展跃平,施帅,段修军. 家畜生态学报. 2008(06)
[5]不同类型鸭肉用性能及嫩度差异的比较[J]. 王健,臧大存,左伟勇,展跃平,施帅,段修军. 黑龙江畜牧兽医. 2008(09)
[6]鹅的肌肉品质及其组织学分析[J]. 林树茂,刘为民,景栋林,张绮琼,郭金彪. 安徽农业科学. 2006(15)
[7]北京油鸡品种资源特性描述[J]. 赵桂苹,陈继兰,文杰,郑麦青,李小华. 中国家禽. 2005(23)
[8]优质鸡肉质的特点及其评定方法[J]. 刘景,李忠荣,冯玉兰. 福建畜牧兽医. 2004(06)
[9]优质鸡内涵与选育[J]. 陈宽维,陈国宏,李慧芳,张学余,耿拓宇. 中国家禽. 2003(19)
[10]淘汰蛋鸡与普通肉鸡肌肉品质的比较研究[J]. 徐幸莲,周光宏,刘海斌. 食品工业科技. 2001(06)
博士论文
[1]基于GWAS的猪肉品质性状候选基因研究[D]. 李娜.中国农业大学 2016
硕士论文
[1]硒通过miR-365-3p靶向SelT调控鸡骨骼肌发育机理的研究[D]. 邢梦媛.东北农业大学 2018
本文编号:3720074
【文章页数】:51 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
abstract
主要符号对照表
第一章 绪论
1.1 研究目的及意义
1.2 国内外研究现状
1.2.1 肉品质评价指标
1.2.2 肌纤维概述
1.2.3 肌纤维形态和肉色性状与肉品质的关系
1.2.4 影响肌纤维组织学形态的因素
1.2.5 全基因组关联分析简介
1.2.6 影响肉色性状的基因定位工作
1.3 研究内容与技术路线
1.3.1 研究内容
1.3.2 技术路线
第二章 鸭胸肌肌纤维与肉色性状的遗传参数估计
2.1 前言
2.2 材料与方法
2.2.1 试验动物
2.2.2 饲养管理
2.2.3 样品采集
2.2.4 肌肉石蜡切片制作
2.2.5 切片的显微镜观察和数据采集
2.2.6 肉色性状数据采集
2.2.7 统计分析
2.3 结果
2.3.1 F_2群体肌纤维与肉色表型
2.3.2 不同鸭群体胸肌肌纤维性状比较
2.3.3 肌纤维与肉色性状遗传力估计
2.3.4 肌纤维与肉色性状表型和遗传相关
2.4 讨论
2.4.1 肌纤维形态与肉色表型值
2.4.2 肌纤维与肉色性状遗传力估算
2.4.3 肌纤维与肉色性状表型和遗传相关
2.5 小结
第三章 鸭胸肌肌纤维直径全基因组关联分析及精细定位
3.1 前言
3.2 材料与方法
3.2.1 试验动物
3.2.2 样品采集
3.2.3 家禽外周血基因组DNA提取与质量检测
3.2.4 基因组重测序和数据质量控制
3.2.5 全基因组水平变异位点的鉴定和分型
3.2.6 全基因组关联分析
3.2.7 北京鸭和野鸭受选择区间筛选
3.2.8 拓展单倍型分析
3.2.9 肌肉组织总RNA提取和质量控制
3.2.10 RNA-seq文库构建和测序
3.2.11 RNA-seq数据质控和分析
3.3 结果
3.3.1 肌纤维直径全基因组关联分析
3.3.2 精细定位
3.4 讨论
3.4.1 肌纤维直径受单基因调控
3.4.2 F_2群体GWAS信号在驯化过程中受人工选择
3.4.3 TASP1影响肌纤维直径的通路假说
3.5 小结
第四章 鸭胸肌肉色性状全基因组关联分析及精细定位
4.1 前言
4.2 材料与方法
4.2.1 试验动物
4.2.2 样品采集
4.2.3 家禽外周血基因组DNA提取和质量检测
4.2.4 基因组重测序和数据质量控制
4.2.5 全基因组水平变异位点的鉴定和分型
4.2.6 全基因组关联分析
4.2.7 肌肉组织总RNA提取和质量控制
4.2.8 RNA-seq文库构建和测序
4.2.9 RNA-seq数据质控和分析
4.3 结果
4.3.1 全基因组关联分析
4.3.2 候选基因分析
4.4 讨论
4.4.1 肉色性状受单基因调控
4.4.2 GWAS信号区间候选基因分析
4.4.3 SELENOT基因影响肉色黄度b*
4.5 小结
第五章 结论
5.1 全文结论
5.2 有待进一步研究的问题
参考文献
致谢
作者简介
【参考文献】:
期刊论文
[1]黄麻羽肉鸡体重、体尺与肌肉品质的相关性研究[J]. 杨鹏,王克文,赵洁. 饲料研究. 2019(05)
[2]金陵白鸭的肉质特性研究[J]. 何宗亮,匡伟,姚远,郗正林,伍冠锁,杨硕. 安徽农业科学. 2019(07)
[3]苏太猪宰后72 h pH和肉色性状的全基因组关联分析[J]. 周李生,杨杰,刘先先,张志燕,杨斌,麻骏武. 中国农业科学. 2014(03)
[4]品种和部位对鸭肉肉质的影响[J]. 王健,臧大存,左伟勇,展跃平,施帅,段修军. 家畜生态学报. 2008(06)
[5]不同类型鸭肉用性能及嫩度差异的比较[J]. 王健,臧大存,左伟勇,展跃平,施帅,段修军. 黑龙江畜牧兽医. 2008(09)
[6]鹅的肌肉品质及其组织学分析[J]. 林树茂,刘为民,景栋林,张绮琼,郭金彪. 安徽农业科学. 2006(15)
[7]北京油鸡品种资源特性描述[J]. 赵桂苹,陈继兰,文杰,郑麦青,李小华. 中国家禽. 2005(23)
[8]优质鸡肉质的特点及其评定方法[J]. 刘景,李忠荣,冯玉兰. 福建畜牧兽医. 2004(06)
[9]优质鸡内涵与选育[J]. 陈宽维,陈国宏,李慧芳,张学余,耿拓宇. 中国家禽. 2003(19)
[10]淘汰蛋鸡与普通肉鸡肌肉品质的比较研究[J]. 徐幸莲,周光宏,刘海斌. 食品工业科技. 2001(06)
博士论文
[1]基于GWAS的猪肉品质性状候选基因研究[D]. 李娜.中国农业大学 2016
硕士论文
[1]硒通过miR-365-3p靶向SelT调控鸡骨骼肌发育机理的研究[D]. 邢梦媛.东北农业大学 2018
本文编号:3720074
本文链接:https://www.wllwen.com/yixuelunwen/dongwuyixue/3720074.html