反刍家畜隐孢子虫分子流行病学及微小隐孢子虫群体遗传研究
发布时间:2022-12-22 23:59
隐孢子虫(Cryptosporidium)是一种呈全球性分布的重要食源性/水源性人兽共患病原虫,它可以通过多种途径导致人类和其他动物感染隐孢子虫病,是人和动物急性腹泻或慢性致死性腹泻的重要致病因子。隐孢子虫属内种类众多,已命名26个有效虫种和70多个基因型。由隐孢子虫引起的隐孢子虫病是重要的人兽共患病,隐孢子虫病可感染包括人类在内的280多种动物,与粪便接触、食用被隐孢子虫卵囊污染的食物或水都可以传播隐孢子虫病。目前对隐孢子虫病的致病机理并不完全清楚,也尚无有效的治疗药物或疫苗。因此,隐孢子虫病不仅对畜牧养殖业产生重大的威胁,也对人类的健康产生巨大影响。为了解我国山羊隐孢子虫流行状况和公共卫生意义,对河南省和重庆市共7个养殖场1265份山羊粪便样品进行了检测。隐孢子虫感染率为3.48%(44/1256)。不同年龄段隐孢子虫感染率存在显著性差异,断奶后羔羊感染率最高达4.58%。基于SSU rRNA基因的PCR-RFLP分析和DNA序列分析鉴定出3个种,包括发现于河南省和重庆市山羊种的C.ubiquitum (24/44),发现于河南省的C.andersoni (16/44)和C.xia...
【文章页数】:87 页
【学位级别】:博士
【文章目录】:
致谢
摘要
Abstract
第一章 文献综述
1 隐孢子虫宿主特异性
2 牛羊隐孢子虫病
2.1 牛隐孢子虫病
2.2 羊隐孢子虫病
3 隐孢子虫基因分型
3.1 隐孢子虫基因分型工具
3.2 隐孢子虫基因亚型工具
3.3 隐孢子虫群体遗传分析技术
4 牛羊微小隐孢子虫(C.parvum)感染
5 微小隐孢子虫(Cparvum)亚型和人兽共患传播
6 结语
第二章 河南和重庆山羊隐孢子虫分子流行病学研究
1 引言
2 材料与方法
2.1 样品来源
2.2 试剂配制
2.3 显微镜检查
2.4 DNA提取
2.5 SSU rRNA基因PCR扩增
2.6 泛在隐孢子虫(C.ubiquitum)亚型分型
2.7 RFLP鉴定
2.8 DNA序列分析
2.9 凝胶电泳
2.10 种系发育分析
2.11 统计学分析
3 结果
3.1 山羊隐孢子虫感染率
3.2 隐孢子虫种类分布情况
3.3 隐孢子虫种类年龄类型
3.4 泛在隐孢子虫(C.ubiquitum)亚型
3.5 种系发育分析
4 讨论
第三章 宁夏奶牛隐孢子虫分子流行病学研究
1 引言
2 材料与方法
2.1 样品来源
2.2 显微镜检查方法
2.3 DNA提取
2.4 SSU rRNA基因PCR扩增
2.5 RFLP鉴定和DNA序列分析
2.6 凝胶电泳
2.7 种系发育分析
2.8 统计学分析
3 结果
3.1 隐孢子虫感染率
3.2 奶牛感染隐孢子虫种类分布
3.3 不同年龄段隐孢子虫种类分布特征
3.4 隐孢子虫亚型
4 讨论
第四章 微小隐孢子虫IID分离株多位点序列分型及群体遗传分析
1 引言
2 材料与方法
2.1 微小隐孢子虫(Cparvum)样品采集
2.2 多位点序列分型
2.3 种系发育关系及DNA多态性分析
2.4 连锁不平衡分析
2.5 STRUCTURE分析
2.6 核苷酸序列登录号
3 结果
3.1 MLST亚型及序列多态性
3.2 西亚地区在gp60基因位点上具有较高的遗传多态性
3.3 种系发育分析揭示分离株存在显著的地理区域隔离
3.4 LD分析表明IId分离株为克隆性群体结构
3.5 STRUCTURE分析产生3个祖先群
4 讨论
结论
参考文献
【参考文献】:
期刊论文
[1]重庆市部分种羊场山羊隐孢子虫感染情况调查[J]. 陈静,沈克飞,任航行,高立芳,宁长申. 中国兽医杂志. 2012(12)
[2]广西奶牛隐孢子虫病的流行病学调查[J]. 陶立,陈泽祥,韦志锋,王荣军,秦若甫,李军,唐林生,彭昊,兰美益,魏晓瑞,杨威. 中国兽医科学. 2012(07)
[3]隐孢子虫基因分型标记的研究进展[J]. 王强,安春霞,菅复春,朱静静,宁长申,张龙现. 中国人兽共患病学报. 2010(03)
[4]乳牛源隐孢子虫种类的PCR-RFLP和分子种系发育分析鉴定[J]. 梁楠,菅复春,李家诚,仇书兴,张龙现. 中国兽医科学. 2009(01)
[5]河南省山羊隐孢子虫流行病学调查[J]. 崔彬,王永立,菅复春,陈玉霞,马超锋,张龙现,宁长申. 中国兽医杂志. 2008(09)
[6]河南省部分地区乳牛隐孢子虫病的流行病学调查[J]. 卢庆斌,仇书兴,茹宝瑞,刘伟,王淑梅,苗霆,王岩,段张秀,宁长申,张龙现. 中国兽医科学. 2008(03)
[7]河南省绵羊隐孢子虫病的流行病学调查[J]. 王永立,崔彬,菅复春,张龙现,宁长申,董和平,卢庆斌,高庚渠. 中国兽医科学. 2008(02)
[8]天津地区奶牛感染隐孢子虫情况的调查[J]. 孟然,王欣,董明,张振庭,刘俊燕,纪伟华,杨秀珍. 中国病原生物学杂志. 2007(03)
[9]青海省化隆县牦牛隐孢子虫流行病学调查[J]. 王春景,刘恒明. 中国兽医杂志. 2007(05)
[10]PCR-RFLP鉴定隐孢子虫种类研究[J]. 张龙现,蒋金书,刘群,宁长申,赵金凤,刘红英. 畜牧兽医学报. 2004(05)
本文编号:3724301
【文章页数】:87 页
【学位级别】:博士
【文章目录】:
致谢
摘要
Abstract
第一章 文献综述
1 隐孢子虫宿主特异性
2 牛羊隐孢子虫病
2.1 牛隐孢子虫病
2.2 羊隐孢子虫病
3 隐孢子虫基因分型
3.1 隐孢子虫基因分型工具
3.2 隐孢子虫基因亚型工具
3.3 隐孢子虫群体遗传分析技术
4 牛羊微小隐孢子虫(C.parvum)感染
5 微小隐孢子虫(Cparvum)亚型和人兽共患传播
6 结语
第二章 河南和重庆山羊隐孢子虫分子流行病学研究
1 引言
2 材料与方法
2.1 样品来源
2.2 试剂配制
2.3 显微镜检查
2.4 DNA提取
2.5 SSU rRNA基因PCR扩增
2.6 泛在隐孢子虫(C.ubiquitum)亚型分型
2.7 RFLP鉴定
2.8 DNA序列分析
2.9 凝胶电泳
2.10 种系发育分析
2.11 统计学分析
3 结果
3.1 山羊隐孢子虫感染率
3.2 隐孢子虫种类分布情况
3.3 隐孢子虫种类年龄类型
3.4 泛在隐孢子虫(C.ubiquitum)亚型
3.5 种系发育分析
4 讨论
第三章 宁夏奶牛隐孢子虫分子流行病学研究
1 引言
2 材料与方法
2.1 样品来源
2.2 显微镜检查方法
2.3 DNA提取
2.4 SSU rRNA基因PCR扩增
2.5 RFLP鉴定和DNA序列分析
2.6 凝胶电泳
2.7 种系发育分析
2.8 统计学分析
3 结果
3.1 隐孢子虫感染率
3.2 奶牛感染隐孢子虫种类分布
3.3 不同年龄段隐孢子虫种类分布特征
3.4 隐孢子虫亚型
4 讨论
第四章 微小隐孢子虫IID分离株多位点序列分型及群体遗传分析
1 引言
2 材料与方法
2.1 微小隐孢子虫(Cparvum)样品采集
2.2 多位点序列分型
2.3 种系发育关系及DNA多态性分析
2.4 连锁不平衡分析
2.5 STRUCTURE分析
2.6 核苷酸序列登录号
3 结果
3.1 MLST亚型及序列多态性
3.2 西亚地区在gp60基因位点上具有较高的遗传多态性
3.3 种系发育分析揭示分离株存在显著的地理区域隔离
3.4 LD分析表明IId分离株为克隆性群体结构
3.5 STRUCTURE分析产生3个祖先群
4 讨论
结论
参考文献
【参考文献】:
期刊论文
[1]重庆市部分种羊场山羊隐孢子虫感染情况调查[J]. 陈静,沈克飞,任航行,高立芳,宁长申. 中国兽医杂志. 2012(12)
[2]广西奶牛隐孢子虫病的流行病学调查[J]. 陶立,陈泽祥,韦志锋,王荣军,秦若甫,李军,唐林生,彭昊,兰美益,魏晓瑞,杨威. 中国兽医科学. 2012(07)
[3]隐孢子虫基因分型标记的研究进展[J]. 王强,安春霞,菅复春,朱静静,宁长申,张龙现. 中国人兽共患病学报. 2010(03)
[4]乳牛源隐孢子虫种类的PCR-RFLP和分子种系发育分析鉴定[J]. 梁楠,菅复春,李家诚,仇书兴,张龙现. 中国兽医科学. 2009(01)
[5]河南省山羊隐孢子虫流行病学调查[J]. 崔彬,王永立,菅复春,陈玉霞,马超锋,张龙现,宁长申. 中国兽医杂志. 2008(09)
[6]河南省部分地区乳牛隐孢子虫病的流行病学调查[J]. 卢庆斌,仇书兴,茹宝瑞,刘伟,王淑梅,苗霆,王岩,段张秀,宁长申,张龙现. 中国兽医科学. 2008(03)
[7]河南省绵羊隐孢子虫病的流行病学调查[J]. 王永立,崔彬,菅复春,张龙现,宁长申,董和平,卢庆斌,高庚渠. 中国兽医科学. 2008(02)
[8]天津地区奶牛感染隐孢子虫情况的调查[J]. 孟然,王欣,董明,张振庭,刘俊燕,纪伟华,杨秀珍. 中国病原生物学杂志. 2007(03)
[9]青海省化隆县牦牛隐孢子虫流行病学调查[J]. 王春景,刘恒明. 中国兽医杂志. 2007(05)
[10]PCR-RFLP鉴定隐孢子虫种类研究[J]. 张龙现,蒋金书,刘群,宁长申,赵金凤,刘红英. 畜牧兽医学报. 2004(05)
本文编号:3724301
本文链接:https://www.wllwen.com/yixuelunwen/dongwuyixue/3724301.html
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