中国地区CCoV流行性Meta分析及2018~2019年黑龙江省CCoV分子流行病学调查
发布时间:2022-12-23 02:32
犬冠状病毒病(Canine coronavirus,CCoV)是一种具有分布广、发病率高且临床症状复杂等特点的传染性疾病。已有报道表明,冠状病毒变异会使其宿主由动物变为人,而犬作为人类日常生活伴侣与人类接触密切,所以密切关注犬冠状病毒流行与遗传变异情况对人类公共卫生具有重要意义。为全面了解中国CCoV流行情况,本试验采用Meta分析方法进行研究。首先收集并根据研究目的筛选中国1997~2019年发表关于国内CCoV流行情况的中英文文献,对符合要求的文献统计文章发表年份、作者、总样品数、阳性样品数、检测方法及样品来源背景等信息,并根据信息的全面性和试验详细程度进行评分估量。进一步提取文献中所有样品的背景信息数据并分为来源地区、季节、性别、免疫情况等共9个不同亚组,采用统计学方法分析不同亚组分类下CCoV流行率之间的差异及其与样品背景信息的关联性。最终通过统计学检验方法对亚组分析统计结果的异质性、文章发表偏倚性进行分析与验证。结合Meta分析结果,本研究进一步设计试验对2018~2019年中国黑龙江地区CCoV的流行及流行毒株遗传演化情况进行探究,收集黑龙江大庆、哈尔滨、鸡西、牡丹江、佳木...
【文章页数】:68 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
Abstract
1 文献综述
1.1 犬冠状病毒病概述
1.1.1 国内外流行情况
1.1.2 临床症状
1.1.3 致病机制
1.1.4 诊断方法
1.1.5 预防与治疗
1.2 CCoV生物学特征
1.2.1 CCoV形态及结构
1.2.2 CCoV基因组结构
1.2.3 CCoV结构蛋白
1.3 本研究目的与意义
2 中国地区CCoV流行性Meta分析
2.1 研究对象
2.2 研究方法
2.2.1 文库检索范围
2.2.2 检索策略
2.2.3 选择标准
2.2.4 数据提取
2.2.5 数据分析
2.2.6 森林图
2.2.7 偏倚分析
2.3 结果
2.3.1 文献搜索结果
2.3.2 纳入文献基本情况
2.3.3 单组率Meta分析
2.3.4 中国各地区CCoV感染率相关性分析
2.4 讨论
3 黑龙江地区CCoV分子流行病学调查
3.1 材料
3.1.1 试验样品
3.1.2 主要生化试剂
3.1.3 主要仪器设备
3.1.4 引物
3.2 方法
3.2.1 样品处理
3.2.2 目的基因测序与遗传进化性分析
3.3 结果
3.3.1 目的基因PCR扩增
3.3.2 目的基因PCR产物纯化鉴定
3.3.3 CCoV样品阳性率及基因分型
3.3.4 相关性分析
3.3.5 系统进化树分析
3.3.6 核苷酸与氨基酸同源性分析
3.3.7 序列比对分析
3.3.8 基因重组分析
3.3.9 N-糖基化位点分析
3.3.10 抗原位点分析
3.4 讨论
4 结论
参考文献
致谢
个人简历
【参考文献】:
期刊论文
[1]贵阳市乌当区犬冠状病毒感染的临床调查分析[J]. 汪席发,张翊富. 贵州畜牧兽医. 2018(06)
[2]犬瘟热病毒、犬细小病毒和犬冠状病毒三重PCR检测方法的建立[J]. 苏霞,周宏专,常彦嫣,杨兵. 畜牧与兽医. 2018(07)
[3]天津地区犬常见传染病的调查及防控措施[J]. 昝芳,白海霞,崔君. 天津农学院学报. 2017(04)
[4]浦东地区犬细小病毒与犬冠状病毒感染状况调查[J]. 艾旻,俞向前,文德亮,王苗苗,叶承荣,朱建国. 上海畜牧兽医通讯. 2017(06)
[5]犬细小病毒与犬冠状病毒双重PCR检测方法的建立[J]. 俞向前,艾旻,张忠海,王苗苗,朱建国,叶承荣. 上海畜牧兽医通讯. 2017(04)
[6]209例宠物犬冠状病毒病流行病学调查[J]. 贾燕,关平原. 畜牧与饲料科学. 2017(04)
[7]上海株犬冠状病毒的分离鉴定及S基因的遗传进化分析[J]. 沈美艳,孙秋艳,李舫,王彩霞. 中国动物检疫. 2017(03)
[8]山东省部分地区宠物犬冠状病毒病的流行病学调查[J]. 孙秋艳,李舫,蔡国栋. 中国预防兽医学报. 2016(11)
[9]兰州市犬冠状病毒病发病情况调查[J]. 卢旺银. 畜牧兽医杂志. 2009(06)
[10]辽宁省警犬犬瘟热犬细小病毒和犬冠状病毒感染情况调查[J]. 孔庆波,徐佳. 中国工作犬业. 2008(11)
博士论文
[1]犬冠状病毒的流行病学调查及地方株的特性研究[D]. 王玉燕.南京农业大学 2005
硕士论文
[1]吉林市犬常见病毒性腹泻病的病原流行病学调查[D]. 张科萌.吉林农业大学 2019
[2]2014-2015年黑龙江三个地区犬冠状病毒分子流行病学调查及病毒的初步分离[D]. 王欣宇.黑龙江八一农垦大学 2017
[3]长沙市犬瘟热、犬细小病毒病及冠状病毒病的调查与中药治疗效果研究[D]. 叶勇.湖南农业大学 2016
[4]上海地区犬冠状病毒病发病调查及治疗方法分析[D]. 许昊.上海交通大学 2012
[5]北京地区犬瘟热、犬细小病毒感染及犬冠状病毒病的分子流行病学调查[D]. 张晋.南京农业大学 2009
[6]犬科动物中犬冠状病毒的检测、分离及其S、M基因分析[D]. 马光刚.南京农业大学 2005
[7]警犬主要传染病流行情况及防控措施[D]. 张汇东.南京农业大学 2005
[8]犬冠状病毒的流行病学调查[D]. 温海.南京农业大学 2004
本文编号:3724532
【文章页数】:68 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
Abstract
1 文献综述
1.1 犬冠状病毒病概述
1.1.1 国内外流行情况
1.1.2 临床症状
1.1.3 致病机制
1.1.4 诊断方法
1.1.5 预防与治疗
1.2 CCoV生物学特征
1.2.1 CCoV形态及结构
1.2.2 CCoV基因组结构
1.2.3 CCoV结构蛋白
1.3 本研究目的与意义
2 中国地区CCoV流行性Meta分析
2.1 研究对象
2.2 研究方法
2.2.1 文库检索范围
2.2.2 检索策略
2.2.3 选择标准
2.2.4 数据提取
2.2.5 数据分析
2.2.6 森林图
2.2.7 偏倚分析
2.3 结果
2.3.1 文献搜索结果
2.3.2 纳入文献基本情况
2.3.3 单组率Meta分析
2.3.4 中国各地区CCoV感染率相关性分析
2.4 讨论
3 黑龙江地区CCoV分子流行病学调查
3.1 材料
3.1.1 试验样品
3.1.2 主要生化试剂
3.1.3 主要仪器设备
3.1.4 引物
3.2 方法
3.2.1 样品处理
3.2.2 目的基因测序与遗传进化性分析
3.3 结果
3.3.1 目的基因PCR扩增
3.3.2 目的基因PCR产物纯化鉴定
3.3.3 CCoV样品阳性率及基因分型
3.3.4 相关性分析
3.3.5 系统进化树分析
3.3.6 核苷酸与氨基酸同源性分析
3.3.7 序列比对分析
3.3.8 基因重组分析
3.3.9 N-糖基化位点分析
3.3.10 抗原位点分析
3.4 讨论
4 结论
参考文献
致谢
个人简历
【参考文献】:
期刊论文
[1]贵阳市乌当区犬冠状病毒感染的临床调查分析[J]. 汪席发,张翊富. 贵州畜牧兽医. 2018(06)
[2]犬瘟热病毒、犬细小病毒和犬冠状病毒三重PCR检测方法的建立[J]. 苏霞,周宏专,常彦嫣,杨兵. 畜牧与兽医. 2018(07)
[3]天津地区犬常见传染病的调查及防控措施[J]. 昝芳,白海霞,崔君. 天津农学院学报. 2017(04)
[4]浦东地区犬细小病毒与犬冠状病毒感染状况调查[J]. 艾旻,俞向前,文德亮,王苗苗,叶承荣,朱建国. 上海畜牧兽医通讯. 2017(06)
[5]犬细小病毒与犬冠状病毒双重PCR检测方法的建立[J]. 俞向前,艾旻,张忠海,王苗苗,朱建国,叶承荣. 上海畜牧兽医通讯. 2017(04)
[6]209例宠物犬冠状病毒病流行病学调查[J]. 贾燕,关平原. 畜牧与饲料科学. 2017(04)
[7]上海株犬冠状病毒的分离鉴定及S基因的遗传进化分析[J]. 沈美艳,孙秋艳,李舫,王彩霞. 中国动物检疫. 2017(03)
[8]山东省部分地区宠物犬冠状病毒病的流行病学调查[J]. 孙秋艳,李舫,蔡国栋. 中国预防兽医学报. 2016(11)
[9]兰州市犬冠状病毒病发病情况调查[J]. 卢旺银. 畜牧兽医杂志. 2009(06)
[10]辽宁省警犬犬瘟热犬细小病毒和犬冠状病毒感染情况调查[J]. 孔庆波,徐佳. 中国工作犬业. 2008(11)
博士论文
[1]犬冠状病毒的流行病学调查及地方株的特性研究[D]. 王玉燕.南京农业大学 2005
硕士论文
[1]吉林市犬常见病毒性腹泻病的病原流行病学调查[D]. 张科萌.吉林农业大学 2019
[2]2014-2015年黑龙江三个地区犬冠状病毒分子流行病学调查及病毒的初步分离[D]. 王欣宇.黑龙江八一农垦大学 2017
[3]长沙市犬瘟热、犬细小病毒病及冠状病毒病的调查与中药治疗效果研究[D]. 叶勇.湖南农业大学 2016
[4]上海地区犬冠状病毒病发病调查及治疗方法分析[D]. 许昊.上海交通大学 2012
[5]北京地区犬瘟热、犬细小病毒感染及犬冠状病毒病的分子流行病学调查[D]. 张晋.南京农业大学 2009
[6]犬科动物中犬冠状病毒的检测、分离及其S、M基因分析[D]. 马光刚.南京农业大学 2005
[7]警犬主要传染病流行情况及防控措施[D]. 张汇东.南京农业大学 2005
[8]犬冠状病毒的流行病学调查[D]. 温海.南京农业大学 2004
本文编号:3724532
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