猪SUMO1基因的碱基序列特征及其在猪肺炎支原体感染过程中的表达
发布时间:2023-02-05 11:17
根据NCBI上GenBank的猪类泛素蛋白修饰分子1(SUMO1)基因碱基序列(NM001112676.1),设计编码区全长上、下游引物,成功克隆了猪SUMO1基因完整的编码区序列。经生物信息学软件分析发现猪SUMO1基因的蛋白质编码区(CDS)全长306 bp,编码101个氨基酸,SUMO1的蛋白质氨基酸序列在物种间高度保守。SUMO1基因在猪心、肝、脾、肺、肾、小肠及肌肉组织中均有表达,且在肺部表达较高。猪肺炎支原体感染原代猪肺泡巨噬细胞后SUMO1的mRNA表达水平显著升高。参与调控炎症反应的基因,如TLR2、P65和RXRα均存在潜在的SUMO化修饰位点,并且猪肺炎支原体感染后它们的mRNA表达水平极显著升高。
【文章页数】:8 页
【文章目录】:
1 材料与方法
1.1 试验材料
1.1.1 菌株及主要试剂
1.1.2 试验组织样品
1.2 方法
1.2.1 原代猪肺泡巨噬细胞的分离及培养
1.2.2 猪肺炎支原体感染原代猪肺泡巨噬细胞
1.2.3 SUMO1基因的克隆
1.2.4 半定量PCR和实时荧光定量PCR检测基因表达
1.2.5 试验结果分析及预测软件
2 结果与分析
2.1 猪SUMO1基因编码区的扩增及克隆
2.2 猪SUMO1的蛋白质理化性质分析
2.2.1 SUMO1的氨基酸序列
2.2.2 SUMO1的磷酸化位点预测
2.2.3 SUMO1的结构预测及分析
2.2.4 SUMO1的系统进化树分析
2.3 SUMO1在猪不同组织中的表达谱
2.4 猪支原体肺炎感染原代猪肺泡巨噬细胞后SUMO1的mRNA表达水平
2.5 调控炎症反应因子表达的上游调控基因SUMO化修饰位点预测
2.6 猪支原体肺炎感染原代猪肺泡巨噬细胞后相关调控基因的mRNA表达水平
3 讨 论
本文编号:3734877
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【文章目录】:
1 材料与方法
1.1 试验材料
1.1.1 菌株及主要试剂
1.1.2 试验组织样品
1.2 方法
1.2.1 原代猪肺泡巨噬细胞的分离及培养
1.2.2 猪肺炎支原体感染原代猪肺泡巨噬细胞
1.2.3 SUMO1基因的克隆
1.2.4 半定量PCR和实时荧光定量PCR检测基因表达
1.2.5 试验结果分析及预测软件
2 结果与分析
2.1 猪SUMO1基因编码区的扩增及克隆
2.2 猪SUMO1的蛋白质理化性质分析
2.2.1 SUMO1的氨基酸序列
2.2.2 SUMO1的磷酸化位点预测
2.2.3 SUMO1的结构预测及分析
2.2.4 SUMO1的系统进化树分析
2.3 SUMO1在猪不同组织中的表达谱
2.4 猪支原体肺炎感染原代猪肺泡巨噬细胞后SUMO1的mRNA表达水平
2.5 调控炎症反应因子表达的上游调控基因SUMO化修饰位点预测
2.6 猪支原体肺炎感染原代猪肺泡巨噬细胞后相关调控基因的mRNA表达水平
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