猪SIRT5基因外显子区多态性研究

发布时间：2023-02-26 21:08

　　为系统挖掘猪沉默信息调节因子5(silence information regulator 5, SIRT5)基因外显子区域SNPs位点,以4个猪资源群体(从江香猪、黔北黑猪♀×巴克夏♂F₁代杂交猪、夜郎黄金猪和大约克猪)为研究对象,构建品种DNA池,采用直接测序技术结合生物信息学软件分析猪SIRT5外显子多态性。结果显示:4个猪资源群体中共筛选得到G515A、C831T和A882G 3个变异位点,其中G515A属于错义突变,可由甘氨酸改变为谷氨酸;等位基因频率估算发现,C831T和A882G变异位点在从江香猪群体中多态丰度高,而在大约克猪中均呈现偏态分布;生物信息学发现,G515A突变后,猪SIRT5基因mRNA最小自由能降低,稳定性提升。本研究成功筛选出猪SIRT5基因外显子区的多态位点,为进一步验证该基因突变位点是否具有调控地方猪脂肪代谢水平提供参考。

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【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 试验样品采集
    1.2 主要试剂
    1.3 引物设计与合成
    1.4 PCR扩增反应
    1.5 变异位点筛选及等位基因频率估算
    1.6 mRNA二级结构分析
2 结果与分析
    2.1 DNA提取与PCR扩增
    2.2 序列比对与SNP位点挖掘
    2.3 等位基因频率估算
    2.4 mRNA二级结构预测
3 讨论



本文编号：3750895